183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1805 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1805  SCP-like extracellular  100 
 
 		 222 aa  439  9.999999999999999e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000690986 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3565  hypothetical protein  44.72 
 
 		 206 aa  142  5e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.727767  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1690  SCP-like extracellular protein  39 
 
 		 200 aa  117  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001041  hypothetical protein  33.84 
 
 		 179 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2104  Allergen V5/Tpx-1-like  43.54 
 
 		 288 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233408  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2649  hypothetical protein  44.78 
 
 		 320 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00790253  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49660  hypothetical protein  44.44 
 
 		 282 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2424  SCP-like extracellular  39.71 
 
 		 200 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.572617  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0488  Allergen V5/Tpx-1 related  47.58 
 
 		 299 aa  109  3e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3384  Allergen V5/Tpx-1-like  42.86 
 
 		 294 aa  108  5e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3579  hypothetical protein  42.11 
 
 		 293 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.38499  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2381  Allergen V5/Tpx-1 related  42.86 
 
 		 310 aa  105  5e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0357627 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3350  Allergen V5/Tpx-1 related  42.11 
 
 		 293 aa  105  8e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.688686  normal  0.0178942 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3457  Allergen V5/Tpx-1 related  48.08 
 
 		 338 aa  103  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3137  SCP-like extracellular  40.82 
 
 		 286 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4238  hypothetical protein  44.44 
 
 		 282 aa  101  9e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.569543  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5290  SCP-like extracellular  42.54 
 
 		 211 aa  100  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2358  SCP-like extracellular  37.78 
 
 		 283 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.678269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4392  SCP-like extracellular  47.62 
 
 		 180 aa  100  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3563  hypothetical protein  36.3 
 
 		 283 aa  98.6  7e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18350  hypothetical protein  39.26 
 
 		 301 aa  98.2  8e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8056  hypothetical protein  42.31 
 
 		 305 aa  98.2  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2217  SCP-like extracellular  41.38 
 
 		 162 aa  97.1  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2074  SCP-like extracellular  42.72 
 
 		 222 aa  96.3  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2817  SCP-like extracellular  43.81 
 
 		 249 aa  96.3  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2482  SCP-like extracellular  37.76 
 
 		 283 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.897986  normal  0.230524 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3169  Allergen V5/Tpx-1 family protein  40.43 
 
 		 279 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.635999  normal  0.126682 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2211  SCP-like extracellular protein  34.81 
 
 		 283 aa  91.7  7e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0827  SCP-like extracellular  37.3 
 
 		 157 aa  91.3  1e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.274249  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1282  SCP-like extracellular  44.9 
 
 		 317 aa  89.7  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0268  SCP-like extracellular  43.81 
 
 		 347 aa  89  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0219  SCP-like extracellular  42.86 
 
 		 495 aa  88.6  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0703  SCP/PR1 domain-containing proteins-like  39.86 
 
 		 338 aa  85.5  6e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.501608  normal  0.0221352 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4411  SCP-like extracellular  40.31 
 
 		 300 aa  83.6  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4362  Allergen V5/Tpx-1 related  41.51 
 
 		 264 aa  83.6  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4591  Allergen V5/Tpx-1 family protein  37.04 
 
 		 213 aa  83.6  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.39255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4242  Allergen V5/Tpx-1 family protein  31.4 
 
 		 444 aa  83.2  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.152087 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0508  spore coat assembly protein SafA  40.62 
 
 		 203 aa  82.8  0.000000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8010  SCP-like extracellular  35.12 
 
 		 232 aa  82  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5005  SCP-like extracellular  42.72 
 
 		 254 aa  81.6  0.000000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.342918  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4285  SCP-like extracellular  36.36 
 
 		 296 aa  80.9  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0167  SCP-like extracellular  42.45 
 
 		 209 aa  81.3  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.119271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1426  SCP-like extracellular  33.57 
 
 		 328 aa  80.9  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2270  SCP-like extracellular  39.62 
 
 		 212 aa  79.3  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00083862  normal  0.0734842 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1373  hypothetical protein  42.86 
 
 		 541 aa  79.3  0.00000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4672  SCP-like extracellular  36.09 
 
 		 458 aa  78.2  0.00000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.988125  normal  0.181044 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0728  SCP-like extracellular  44.76 
 
 		 285 aa  77  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.416101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1289  Allergen V5/Tpx-1 family protein  41.94 
 
 		 443 aa  74.7  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.323784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38670  uncharacterized protein with SCP/PR1 domains  37.69 
 
 		 260 aa  73.2  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5956  SCP-like extracellular  42.11 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1179  SCP-like extracellular  37.01 
 
 		 465 aa  72.8  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.249096  hitchhiker  0.000057053 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1557  Allergen V5/Tpx-1 related  30.48 
 
 		 331 aa  72  0.000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal  0.411468 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0300  Allergen V5/Tpx-1 related  37.78 
 
 		 205 aa  71.6  0.000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.022059  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0851  hypothetical protein  40 
 
 		 287 aa  71.2  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.721637  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5831  SCP-like extracellular  40.43 
 
 		 214 aa  69.3  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.529003  normal  0.937003 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3687  SCP-like extracellular  36.45 
 
 		 167 aa  68.9  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00687212  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1443  Allergen V5/Tpx-1 family protein  38.46 
 
 		 178 aa  68.2  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.477266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1705  Allergen V5/Tpx-1 related  33.09 
 
 		 245 aa  67.4  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000015674  normal  0.367363 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2188  SCP-like extracellular  36.78 
 
 		 298 aa  67.4  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0779  copper amine oxidase-like protein  39.76 
 
 		 450 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247024  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1940  SCP-like extracellular  30.95 
 
 		 242 aa  65.5  0.0000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0764504  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0202  hypothetical protein  36.54 
 
 		 156 aa  64.7  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00696457  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1835  Allergen V5/Tpx-1 family protein  36.54 
 
 		 156 aa  64.7  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.780904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2435  SCP-like extracellular  40 
 
 		 270 aa  64.7  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4717  SCP-like extracellular  40 
 
 		 197 aa  64.3  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.771476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0934  Allergen V5/Tpx-1 related  38.74 
 
 		 353 aa  63.2  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.876847  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0892  SCP-like extracellular  35.97 
 
 		 264 aa  62.4  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000243289 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1235  SCP-like extracellular  29.68 
 
 		 399 aa  62.4  0.000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0828  SCP-like extracellular  33.33 
 
 		 274 aa  61.6  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000017875  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2043  Allergen V5/Tpx-1 related  28.67 
 
 		 196 aa  61.2  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0276422  normal  0.319002 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0081  Allergen V5/Tpx-1 family protein  30.37 
 
 		 321 aa  60.8  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2640  hypothetical protein  39.51 
 
 		 353 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0937186  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2711  SCP-like extracellular  28.99 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000599492  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2897  Allergen V5/Tpx-1 related  32.58 
 
 		 176 aa  60.5  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.870748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0610  SCP-like extracellular  27.78 
 
 		 352 aa  60.5  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2369  SCP-like extracellular  31.88 
 
 		 156 aa  60.5  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1200  hypothetical protein  39.76 
 
 		 344 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4039  hypothetical protein  39.76 
 
 		 344 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.784658  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1124  hypothetical protein  33.63 
 
 		 255 aa  59.3  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.901449 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3849  hypothetical protein  39.76 
 
 		 344 aa  58.9  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3680  hypothetical protein  39.76 
 
 		 344 aa  58.9  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3697  hypothetical protein  39.76 
 
 		 336 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4147  hypothetical protein  39.76 
 
 		 344 aa  58.9  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3952  hypothetical protein  39.76 
 
 		 344 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1407  hypothetical protein  34.34 
 
 		 275 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1208  hypothetical protein  34.34 
 
 		 275 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1186  hypothetical protein  36.47 
 
 		 270 aa  57.8  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1188  hypothetical protein  34.34 
 
 		 263 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0215059  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1306  hypothetical protein  34.34 
 
 		 275 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481179  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1384  hypothetical protein  33.33 
 
 		 275 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1448  hypothetical protein  34.34 
 
 		 275 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1582  SCP-like extracellular  30.22 
 
 		 159 aa  57.8  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.71435  normal  0.283076 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3998  hypothetical protein  34.34 
 
 		 270 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0752047 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1346  hypothetical protein  33.33 
 
 		 275 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1210  SCP-like extracellular  33.33 
 
 		 276 aa  58.2  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1016  hypothetical protein  34.41 
 
 		 283 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.768354  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3984  hypothetical protein  38.55 
 
 		 344 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2976  Allergen V5/Tpx-1 related  30.63 
 
 		 334 aa  57  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0120131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3268  SCP-like extracellular  33.7 
 
 		 410 aa  57.4  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4052  hypothetical protein  38.55 
 
 		 344 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.244783  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>