More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3457 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_3457  Allergen V5/Tpx-1 related  100 
 
 
338 aa  674    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1282  SCP-like extracellular  54.41 
 
 
317 aa  303  2.0000000000000002e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0263  stress protein  54.37 
 
 
413 aa  151  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0120837 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4362  Allergen V5/Tpx-1 related  60.48 
 
 
264 aa  149  6e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328838  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0167  SCP-like extracellular  57.85 
 
 
209 aa  139  6e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.119271  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0219  SCP-like extracellular  56.45 
 
 
495 aa  139  7.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4591  Allergen V5/Tpx-1 family protein  52.82 
 
 
213 aa  136  4e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.39255  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2817  SCP-like extracellular  56 
 
 
249 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4285  SCP-like extracellular  56.35 
 
 
296 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5290  SCP-like extracellular  53.33 
 
 
211 aa  125  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3708  protein of unknown function DUF124  45.51 
 
 
449 aa  124  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.737309  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5005  SCP-like extracellular  43.54 
 
 
254 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.342918  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1179  SCP-like extracellular  48.09 
 
 
465 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.249096  hitchhiker  0.000057053 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1426  SCP-like extracellular  47.66 
 
 
328 aa  120  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0051  Allergen V5/Tpx-1 family protein  48.03 
 
 
300 aa  120  3.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000168583  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2270  SCP-like extracellular  50.82 
 
 
212 aa  120  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00083862  normal  0.0734842 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0900  stress protein  43.37 
 
 
479 aa  119  7.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.204273 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0654  stress protein  44.57 
 
 
289 aa  118  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.94614  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4242  Allergen V5/Tpx-1 family protein  46.15 
 
 
444 aa  119  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.152087 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1016  hypothetical protein  47.33 
 
 
283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.768354  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0851  hypothetical protein  48.44 
 
 
287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.721637  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3818  stress protein  42.26 
 
 
493 aa  114  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.139495  normal  0.219014 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1705  Allergen V5/Tpx-1 related  45.24 
 
 
245 aa  113  4.0000000000000004e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000015674  normal  0.367363 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0508  spore coat assembly protein SafA  46.22 
 
 
203 aa  112  7.000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2976  Allergen V5/Tpx-1 related  51.39 
 
 
334 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0120131  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8056  hypothetical protein  49.58 
 
 
305 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1186  hypothetical protein  46.09 
 
 
270 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0728  SCP-like extracellular  52.5 
 
 
285 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.416101  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4672  SCP-like extracellular  44.09 
 
 
458 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.988125  normal  0.181044 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3687  SCP-like extracellular  48 
 
 
167 aa  110  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00687212  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1208  hypothetical protein  46.09 
 
 
275 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1306  hypothetical protein  46.09 
 
 
275 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481179  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1407  hypothetical protein  46.09 
 
 
275 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1448  hypothetical protein  46.09 
 
 
275 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1384  hypothetical protein  46.09 
 
 
275 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1346  hypothetical protein  46.09 
 
 
275 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1188  hypothetical protein  46.09 
 
 
263 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0215059  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0300  Allergen V5/Tpx-1 related  44.92 
 
 
205 aa  108  9.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.022059  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1210  SCP-like extracellular  45.67 
 
 
276 aa  108  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1940  SCP-like extracellular  45.38 
 
 
242 aa  108  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0764504  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4765  stress protein  41.92 
 
 
411 aa  108  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.428894  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3998  hypothetical protein  45.31 
 
 
270 aa  107  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0752047 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4392  SCP-like extracellular  44.63 
 
 
180 aa  107  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4411  SCP-like extracellular  51.26 
 
 
300 aa  106  6e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5956  SCP-like extracellular  51.67 
 
 
226 aa  105  9e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33930  uncharacterized stress response protein, TerZ- and CABP1  40.45 
 
 
528 aa  105  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.333866  normal  0.940831 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1124  hypothetical protein  48.41 
 
 
255 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.901449 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1805  SCP-like extracellular  48.08 
 
 
222 aa  104  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000690986 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0488  Allergen V5/Tpx-1 related  46.51 
 
 
299 aa  105  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1373  hypothetical protein  43.9 
 
 
541 aa  103  3e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1289  Allergen V5/Tpx-1 family protein  43.31 
 
 
443 aa  103  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.323784  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38670  uncharacterized protein with SCP/PR1 domains  47.5 
 
 
260 aa  103  4e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2435  SCP-like extracellular  44.35 
 
 
270 aa  103  5e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8010  SCP-like extracellular  49.61 
 
 
232 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2237  SCP-like extracellular  47.06 
 
 
244 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0268  SCP-like extracellular  43.8 
 
 
347 aa  100  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2074  SCP-like extracellular  42.62 
 
 
222 aa  99.8  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1443  Allergen V5/Tpx-1 family protein  44.54 
 
 
178 aa  99  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.477266  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0809  stress protein  37.65 
 
 
389 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.616867  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2104  Allergen V5/Tpx-1-like  41.26 
 
 
288 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233408  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3153  Allergen V5/Tpx-1 family protein  44.35 
 
 
322 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0445  SCP-like extracellular  43.7 
 
 
500 aa  98.2  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000975734  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1690  SCP-like extracellular protein  42.42 
 
 
200 aa  97.8  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6399  stress protein  38.46 
 
 
560 aa  97.4  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266447  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2424  SCP-like extracellular  48.57 
 
 
200 aa  97.4  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.572617  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0779  copper amine oxidase-like protein  43.8 
 
 
450 aa  96.7  5e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247024  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0081  Allergen V5/Tpx-1 family protein  42.62 
 
 
321 aa  96.3  7e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2649  hypothetical protein  40.74 
 
 
320 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00790253  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3579  hypothetical protein  39.16 
 
 
293 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.38499  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0892  SCP-like extracellular  43.31 
 
 
264 aa  94.7  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000243289 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2358  SCP-like extracellular  43.93 
 
 
283 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.678269  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1293  Allergen V5/Tpx-1 related  42.75 
 
 
335 aa  93.6  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.224237  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49660  hypothetical protein  46.73 
 
 
282 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3350  Allergen V5/Tpx-1 related  47.66 
 
 
293 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.688686  normal  0.0178942 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0202  hypothetical protein  42.02 
 
 
156 aa  93.2  6e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00696457  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1835  Allergen V5/Tpx-1 family protein  42.02 
 
 
156 aa  93.2  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.780904  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001041  hypothetical protein  44.23 
 
 
179 aa  93.2  6e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1589  stress protein  43.45 
 
 
401 aa  93.2  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00887419  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3169  Allergen V5/Tpx-1 family protein  46.73 
 
 
279 aa  92.8  8e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.635999  normal  0.126682 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3563  hypothetical protein  42.99 
 
 
283 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0941  tellurium resistance protein TerA  36.47 
 
 
401 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1374  Allergen V5/Tpx-1 family protein  37.82 
 
 
129 aa  90.9  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000198509  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05140  SCP-like extracellular  35.95 
 
 
258 aa  90.5  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2381  Allergen V5/Tpx-1 related  41.51 
 
 
310 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0357627 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1463  SCP-like extracellular  43.36 
 
 
312 aa  90.1  5e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00481671 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1557  Allergen V5/Tpx-1 related  46.27 
 
 
331 aa  90.1  5e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal  0.411468 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3137  SCP-like extracellular  43.93 
 
 
286 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2482  SCP-like extracellular  46 
 
 
283 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.897986  normal  0.230524 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0825  stress protein  38.18 
 
 
545 aa  87.8  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4717  SCP-like extracellular  40.88 
 
 
197 aa  88.2  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.771476  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0827  hypothetical protein  40 
 
 
317 aa  87.8  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.722064  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2211  SCP-like extracellular protein  41.51 
 
 
283 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0828  SCP-like extracellular  39.67 
 
 
274 aa  87.4  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000017875  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0393  SCP-like extracellular  41.6 
 
 
168 aa  87.4  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0611399  normal  0.0668716 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3523  Allergen V5/Tpx-1 related  42.11 
 
 
188 aa  87.4  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3384  Allergen V5/Tpx-1-like  42.99 
 
 
294 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0749  SCP-like extracellular  37.04 
 
 
355 aa  86.7  5e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0683  SCP-like extracellular  33.33 
 
 
423 aa  86.7  6e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3018  stress protein  35.71 
 
 
722 aa  86.3  7e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000801006  decreased coverage  0.0000799018 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0816  hypothetical protein  39.2 
 
 
317 aa  86.3  8e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>