174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1690 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1690  SCP-like extracellular protein  100 
 
 		 200 aa  414  9.999999999999999e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3565  hypothetical protein  50.34 
 
 		 206 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.727767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001041  hypothetical protein  41.49 
 
 		 179 aa  140  9e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1805  SCP-like extracellular  42.5 
 
 		 222 aa  120  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000690986 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3579  hypothetical protein  43.41 
 
 		 293 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.38499  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3350  Allergen V5/Tpx-1 related  42.64 
 
 		 293 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.688686  normal  0.0178942 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2649  hypothetical protein  37.88 
 
 		 320 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00790253  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0488  Allergen V5/Tpx-1 related  46.51 
 
 		 299 aa  111  8.000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18350  hypothetical protein  40.15 
 
 		 301 aa  109  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2217  SCP-like extracellular  39.46 
 
 		 162 aa  110  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49660  hypothetical protein  40.15 
 
 		 282 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2381  Allergen V5/Tpx-1 related  37.59 
 
 		 310 aa  108  6e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0357627 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3384  Allergen V5/Tpx-1-like  40.31 
 
 		 294 aa  107  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2424  SCP-like extracellular  40.74 
 
 		 200 aa  103  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.572617  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2482  SCP-like extracellular  36.84 
 
 		 283 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.897986  normal  0.230524 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3169  Allergen V5/Tpx-1 family protein  38.76 
 
 		 279 aa  102  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.635999  normal  0.126682 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1282  SCP-like extracellular  37.13 
 
 		 317 aa  102  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3137  SCP-like extracellular  37.59 
 
 		 286 aa  101  8e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2358  SCP-like extracellular  36.09 
 
 		 283 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.678269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0827  SCP-like extracellular  36.84 
 
 		 157 aa  100  2e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.274249  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0268  SCP-like extracellular  39.85 
 
 		 347 aa  100  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2104  Allergen V5/Tpx-1-like  34.59 
 
 		 288 aa  98.2  7e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233408  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3457  Allergen V5/Tpx-1 related  42.42 
 
 		 338 aa  98.2  8e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3563  hypothetical protein  34.59 
 
 		 283 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2211  SCP-like extracellular protein  34.59 
 
 		 283 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0167  SCP-like extracellular  48.18 
 
 		 209 aa  97.1  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.119271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3687  SCP-like extracellular  40 
 
 		 167 aa  94.4  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00687212  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4238  hypothetical protein  39.39 
 
 		 282 aa  94  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.569543  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1557  Allergen V5/Tpx-1 related  40.74 
 
 		 331 aa  93.2  3e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal  0.411468 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5290  SCP-like extracellular  36.47 
 
 		 211 aa  92.8  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4672  SCP-like extracellular  39.85 
 
 		 458 aa  92  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.988125  normal  0.181044 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4392  SCP-like extracellular  43.41 
 
 		 180 aa  90.9  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4591  Allergen V5/Tpx-1 family protein  45.45 
 
 		 213 aa  89.7  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.39255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38670  uncharacterized protein with SCP/PR1 domains  36.42 
 
 		 260 aa  87.4  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4242  Allergen V5/Tpx-1 family protein  39.1 
 
 		 444 aa  87.4  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.152087 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1373  hypothetical protein  31.1 
 
 		 541 aa  85.9  4e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1179  SCP-like extracellular  34.12 
 
 		 465 aa  85.5  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.249096  hitchhiker  0.000057053 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2817  SCP-like extracellular  43 
 
 		 249 aa  83.6  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2270  SCP-like extracellular  37.4 
 
 		 212 aa  83.2  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00083862  normal  0.0734842 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0219  SCP-like extracellular  35.66 
 
 		 495 aa  83.2  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2074  SCP-like extracellular  39.02 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1289  Allergen V5/Tpx-1 family protein  33.33 
 
 		 443 aa  79.3  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.323784  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0728  SCP-like extracellular  37.98 
 
 		 285 aa  79  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.416101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8056  hypothetical protein  39.55 
 
 		 305 aa  79  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1582  SCP-like extracellular  33.57 
 
 		 159 aa  77.8  0.00000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.71435  normal  0.283076 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0703  SCP/PR1 domain-containing proteins-like  38.46 
 
 		 338 aa  77  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.501608  normal  0.0221352 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4411  SCP-like extracellular  36.43 
 
 		 300 aa  76.6  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0393  SCP-like extracellular  38.3 
 
 		 168 aa  76.3  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0611399  normal  0.0668716 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0508  spore coat assembly protein SafA  34.09 
 
 		 203 aa  73.9  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1940  SCP-like extracellular  33.33 
 
 		 242 aa  74.3  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0764504  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0300  Allergen V5/Tpx-1 related  34.29 
 
 		 205 aa  73.6  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.022059  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4362  Allergen V5/Tpx-1 related  38.61 
 
 		 264 aa  72.4  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5005  SCP-like extracellular  31.21 
 
 		 254 aa  72.4  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.342918  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0445  SCP-like extracellular  34.11 
 
 		 500 aa  72.4  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000975734  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8010  SCP-like extracellular  37.98 
 
 		 232 aa  72  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0851  hypothetical protein  37.12 
 
 		 287 aa  70.9  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.721637  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2369  SCP-like extracellular  34.81 
 
 		 156 aa  70.1  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3268  SCP-like extracellular  37.5 
 
 		 410 aa  70.1  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2435  SCP-like extracellular  35.34 
 
 		 270 aa  69.7  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2237  SCP-like extracellular  34.35 
 
 		 244 aa  68.6  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4285  SCP-like extracellular  35.66 
 
 		 296 aa  68.2  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2043  Allergen V5/Tpx-1 related  38.68 
 
 		 196 aa  67  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0276422  normal  0.319002 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5956  SCP-like extracellular  29.56 
 
 		 226 aa  65.9  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3153  Allergen V5/Tpx-1 family protein  30 
 
 		 322 aa  65.5  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1443  Allergen V5/Tpx-1 family protein  32.46 
 
 		 178 aa  65.1  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.477266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0140  Allergen V5/Tpx-1 family protein  34.71 
 
 		 372 aa  64.7  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.697458  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1235  Allergen V5/Tpx-1 related  46.88 
 
 		 178 aa  63.9  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.637281 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0683  SCP-like extracellular  32.85 
 
 		 423 aa  63.5  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2441  SCP-like extracellular  29.29 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.938741  hitchhiker  0.0000000999881 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1235  SCP-like extracellular  33.04 
 
 		 399 aa  62.4  0.000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2772  hypothetical protein  46.03 
 
 		 152 aa  62.8  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.882379 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2095  SCP-like extracellular  33.66 
 
 		 180 aa  61.6  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.122143 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2976  Allergen V5/Tpx-1 related  36.92 
 
 		 334 aa  61.2  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0120131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1705  Allergen V5/Tpx-1 related  31.01 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000015674  normal  0.367363 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1293  Allergen V5/Tpx-1 related  32.61 
 
 		 335 aa  60.8  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.224237  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0202  hypothetical protein  32.41 
 
 		 156 aa  60.5  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00696457  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1835  Allergen V5/Tpx-1 family protein  32.41 
 
 		 156 aa  60.5  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.780904  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1583  SCP-like extracellular  32.65 
 
 		 275 aa  59.3  0.00000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5831  SCP-like extracellular  31.67 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.529003  normal  0.937003 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0081  Allergen V5/Tpx-1 family protein  32.14 
 
 		 321 aa  59.3  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0892  SCP-like extracellular  35.19 
 
 		 264 aa  58.9  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000243289 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3523  Allergen V5/Tpx-1 related  27.34 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0934  Allergen V5/Tpx-1 related  34.53 
 
 		 353 aa  58.2  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.876847  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0779  copper amine oxidase-like protein  31.34 
 
 		 450 aa  58.2  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247024  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0958  copper amine oxidase domain protein  31.03 
 
 		 423 aa  57.4  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.990668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1426  SCP-like extracellular  28.46 
 
 		 328 aa  57.4  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4796  serine/threonine protein kinase  27.13 
 
 		 551 aa  57.4  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000010036  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1399  SCP-like extracellular  29.2 
 
 		 287 aa  57.8  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000144066  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1426  SCP-like extracellular protein  29.2 
 
 		 287 aa  57.8  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000767316  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0749  SCP-like extracellular  32.41 
 
 		 355 aa  57.8  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1188  hypothetical protein  24.71 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0215059  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0827  hypothetical protein  29.93 
 
 		 317 aa  57  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.722064  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2003  Allergen V5/Tpx-1 family protein  32.43 
 
 		 140 aa  57  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3221  SCP-like extracellular  28.97 
 
 		 169 aa  56.2  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1406  Allergen V5/Tpx-1 related  27.15 
 
 		 170 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1016  hypothetical protein  29.05 
 
 		 283 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.768354  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2434  SCP-like extracellular  31.11 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1407  hypothetical protein  30.08 
 
 		 275 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1306  hypothetical protein  30.08 
 
 		 275 aa  55.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481179  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1210  SCP-like extracellular  30.08 
 
 		 276 aa  55.8  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>