147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0703 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0703  SCP/PR1 domain-containing proteins-like  100 
 
 		 338 aa  688    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.501608  normal  0.0221352 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001041  hypothetical protein  44.85 
 
 		 179 aa  109  7.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2649  hypothetical protein  42.65 
 
 		 320 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00790253  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2381  Allergen V5/Tpx-1 related  43.38 
 
 		 310 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0357627 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3350  Allergen V5/Tpx-1 related  38.81 
 
 		 293 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.688686  normal  0.0178942 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3384  Allergen V5/Tpx-1-like  37.78 
 
 		 294 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3565  hypothetical protein  41.3 
 
 		 206 aa  99.8  6e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.727767  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3579  hypothetical protein  39.55 
 
 		 293 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.38499  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1805  SCP-like extracellular  41.3 
 
 		 222 aa  97.4  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000690986 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0268  SCP-like extracellular  39.35 
 
 		 347 aa  97.1  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3169  Allergen V5/Tpx-1 family protein  38.52 
 
 		 279 aa  96.3  8e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.635999  normal  0.126682 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0488  Allergen V5/Tpx-1 related  35.44 
 
 		 299 aa  94.7  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18350  hypothetical protein  38.24 
 
 		 301 aa  94  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49660  hypothetical protein  37.5 
 
 		 282 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3137  SCP-like extracellular  40.44 
 
 		 286 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2104  Allergen V5/Tpx-1-like  39.71 
 
 		 288 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233408  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1373  hypothetical protein  47.22 
 
 		 541 aa  92  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4591  Allergen V5/Tpx-1 family protein  46.43 
 
 		 213 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.39255  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1690  SCP-like extracellular protein  37.59 
 
 		 200 aa  88.6  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2358  SCP-like extracellular  36.03 
 
 		 283 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.678269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0827  SCP-like extracellular  35.77 
 
 		 157 aa  87  4e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.274249  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3563  hypothetical protein  36.76 
 
 		 283 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2424  SCP-like extracellular  40.88 
 
 		 200 aa  86.7  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.572617  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0167  SCP-like extracellular  40.15 
 
 		 209 aa  86.7  6e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.119271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2270  SCP-like extracellular  43.1 
 
 		 212 aa  86.3  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00083862  normal  0.0734842 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2217  SCP-like extracellular  39.29 
 
 		 162 aa  84.7  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4392  SCP-like extracellular  41.38 
 
 		 180 aa  84.7  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3687  SCP-like extracellular  44.44 
 
 		 167 aa  84  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00687212  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2482  SCP-like extracellular  34.31 
 
 		 283 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.897986  normal  0.230524 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2211  SCP-like extracellular protein  35.29 
 
 		 283 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5956  SCP-like extracellular  44.23 
 
 		 226 aa  80.5  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38670  uncharacterized protein with SCP/PR1 domains  35.75 
 
 		 260 aa  80.9  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4238  hypothetical protein  36.76 
 
 		 282 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.569543  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2074  SCP-like extracellular  43.12 
 
 		 222 aa  80.5  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0445  SCP-like extracellular  35.1 
 
 		 500 aa  80.1  0.00000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000975734  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1293  Allergen V5/Tpx-1 related  34.03 
 
 		 335 aa  79  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.224237  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5005  SCP-like extracellular  42.72 
 
 		 254 aa  77.4  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.342918  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4362  Allergen V5/Tpx-1 related  41.96 
 
 		 264 aa  77.8  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328838  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2817  SCP-like extracellular  37.61 
 
 		 249 aa  77.4  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8056  hypothetical protein  36.5 
 
 		 305 aa  77.4  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1557  Allergen V5/Tpx-1 related  40.14 
 
 		 331 aa  76.3  0.0000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal  0.411468 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4285  SCP-like extracellular  40.78 
 
 		 296 aa  74.7  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1282  SCP-like extracellular  36.43 
 
 		 317 aa  75.1  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2435  SCP-like extracellular  37.86 
 
 		 270 aa  73.6  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5290  SCP-like extracellular  41.75 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0219  SCP-like extracellular  40 
 
 		 495 aa  73.2  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1705  Allergen V5/Tpx-1 related  38.33 
 
 		 245 aa  71.2  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000015674  normal  0.367363 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0779  copper amine oxidase-like protein  36.5 
 
 		 450 aa  70.9  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247024  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0393  SCP-like extracellular  35.56 
 
 		 168 aa  70.1  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0611399  normal  0.0668716 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4411  SCP-like extracellular  36.57 
 
 		 300 aa  69.7  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1289  Allergen V5/Tpx-1 family protein  42.16 
 
 		 443 aa  69.7  0.00000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.323784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1179  SCP-like extracellular  42.16 
 
 		 465 aa  69.7  0.00000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.249096  hitchhiker  0.000057053 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4242  Allergen V5/Tpx-1 family protein  41.18 
 
 		 444 aa  69.3  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.152087 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3457  Allergen V5/Tpx-1 related  33.61 
 
 		 338 aa  65.9  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4672  SCP-like extracellular  40.2 
 
 		 458 aa  65.5  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.988125  normal  0.181044 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0051  Allergen V5/Tpx-1 family protein  31.25 
 
 		 300 aa  64.3  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000168583  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0851  hypothetical protein  41.58 
 
 		 287 aa  63.5  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.721637  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1582  SCP-like extracellular  29.66 
 
 		 159 aa  63.5  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.71435  normal  0.283076 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0934  Allergen V5/Tpx-1 related  30.34 
 
 		 353 aa  63.2  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.876847  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0892  SCP-like extracellular  35.92 
 
 		 264 aa  62.4  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000243289 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3984  hypothetical protein  34.82 
 
 		 344 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2043  Allergen V5/Tpx-1 related  39.22 
 
 		 196 aa  61.6  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0276422  normal  0.319002 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1426  SCP-like extracellular  32 
 
 		 328 aa  62  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2369  SCP-like extracellular  33.55 
 
 		 156 aa  61.6  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1235  SCP-like extracellular  33.58 
 
 		 399 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4052  hypothetical protein  34.82 
 
 		 344 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.244783  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0081  Allergen V5/Tpx-1 family protein  31.97 
 
 		 321 aa  60.8  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1124  hypothetical protein  33.64 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.901449 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3849  hypothetical protein  33.93 
 
 		 344 aa  59.7  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3680  hypothetical protein  33.93 
 
 		 344 aa  59.7  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3697  hypothetical protein  33.93 
 
 		 336 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4147  hypothetical protein  33.93 
 
 		 344 aa  59.7  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3952  hypothetical protein  33.93 
 
 		 344 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2237  SCP-like extracellular  35.14 
 
 		 244 aa  59.7  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2640  hypothetical protein  33.93 
 
 		 353 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0937186  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2976  Allergen V5/Tpx-1 related  35.79 
 
 		 334 aa  59.7  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0120131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1200  hypothetical protein  32.48 
 
 		 344 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0300  Allergen V5/Tpx-1 related  35.29 
 
 		 205 aa  58.9  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.022059  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4039  hypothetical protein  33.93 
 
 		 344 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.784658  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0683  SCP-like extracellular  32.84 
 
 		 423 aa  59.3  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2711  SCP-like extracellular  30.38 
 
 		 220 aa  58.9  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000599492  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0508  spore coat assembly protein SafA  34.91 
 
 		 203 aa  58.2  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3153  Allergen V5/Tpx-1 family protein  33.33 
 
 		 322 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1016  hypothetical protein  33.33 
 
 		 283 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.768354  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1210  SCP-like extracellular  30.4 
 
 		 276 aa  58.5  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2188  SCP-like extracellular  30 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8010  SCP-like extracellular  34.95 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3764  SCP-like extracellular  33.98 
 
 		 373 aa  56.2  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1407  hypothetical protein  33.33 
 
 		 275 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0992  SCP-like extracellular  26.62 
 
 		 336 aa  55.5  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1399  Allergen V5/Tpx-1 family protein  44.59 
 
 		 156 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.235297 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0749  SCP-like extracellular  32.26 
 
 		 355 aa  55.8  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1208  hypothetical protein  33.33 
 
 		 275 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1186  hypothetical protein  33.33 
 
 		 270 aa  55.1  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1188  hypothetical protein  33.33 
 
 		 263 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0215059  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1306  hypothetical protein  33.33 
 
 		 275 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481179  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3998  hypothetical protein  33.33 
 
 		 270 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0752047 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1940  SCP-like extracellular  31.76 
 
 		 242 aa  55.1  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0764504  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1448  hypothetical protein  33.33 
 
 		 275 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1346  hypothetical protein  33.33 
 
 		 275 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>