57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1582 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1582  SCP-like extracellular  100 
 
 		 159 aa  323  6e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.71435  normal  0.283076 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2482  SCP-like extracellular  39.13 
 
 		 283 aa  92  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.897986  normal  0.230524 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2358  SCP-like extracellular  36.96 
 
 		 283 aa  88.2  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.678269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0827  SCP-like extracellular  30.34 
 
 		 157 aa  87.8  5e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.274249  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3563  hypothetical protein  36.96 
 
 		 283 aa  87  9e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2211  SCP-like extracellular protein  37.68 
 
 		 283 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49660  hypothetical protein  36.5 
 
 		 282 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3350  Allergen V5/Tpx-1 related  37.39 
 
 		 293 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.688686  normal  0.0178942 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3579  hypothetical protein  38.26 
 
 		 293 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.38499  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3384  Allergen V5/Tpx-1-like  37.39 
 
 		 294 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4238  hypothetical protein  35.9 
 
 		 282 aa  81.3  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.569543  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2217  SCP-like extracellular  35.86 
 
 		 162 aa  81.3  0.000000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2649  hypothetical protein  34.31 
 
 		 320 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00790253  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18350  hypothetical protein  33.58 
 
 		 301 aa  78.6  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1690  SCP-like extracellular protein  33.33 
 
 		 200 aa  78.2  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2381  Allergen V5/Tpx-1 related  34.81 
 
 		 310 aa  77.8  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0357627 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3137  SCP-like extracellular  33.58 
 
 		 286 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2104  Allergen V5/Tpx-1-like  34.31 
 
 		 288 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233408  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0488  Allergen V5/Tpx-1 related  38.03 
 
 		 299 aa  73.9  0.0000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3169  Allergen V5/Tpx-1 family protein  36.52 
 
 		 279 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.635999  normal  0.126682 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3565  hypothetical protein  33.1 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.727767  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2434  SCP-like extracellular  34.93 
 
 		 157 aa  68.2  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0703  SCP/PR1 domain-containing proteins-like  31.45 
 
 		 338 aa  61.2  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.501608  normal  0.0221352 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001041  hypothetical protein  32.35 
 
 		 179 aa  60.8  0.000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1282  SCP-like extracellular  32 
 
 		 317 aa  59.7  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4591  Allergen V5/Tpx-1 family protein  30.77 
 
 		 213 aa  57.8  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.39255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1805  SCP-like extracellular  30.22 
 
 		 222 aa  57.8  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000690986 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2369  SCP-like extracellular  33.08 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0167  SCP-like extracellular  31.62 
 
 		 209 aa  52  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.119271  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1186  hypothetical protein  29.7 
 
 		 270 aa  48.5  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0300  Allergen V5/Tpx-1 related  29.67 
 
 		 205 aa  48.9  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.022059  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1188  hypothetical protein  29.7 
 
 		 263 aa  48.1  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0215059  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3998  hypothetical protein  29.7 
 
 		 270 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0752047 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1346  hypothetical protein  29.7 
 
 		 275 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1448  hypothetical protein  29.7 
 
 		 275 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1384  hypothetical protein  29.7 
 
 		 275 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1407  hypothetical protein  29.7 
 
 		 275 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1208  hypothetical protein  29.7 
 
 		 275 aa  47.8  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1306  hypothetical protein  29.7 
 
 		 275 aa  47.8  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481179  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1016  hypothetical protein  29 
 
 		 283 aa  47.8  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.768354  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2095  SCP-like extracellular  28.85 
 
 		 180 aa  47.8  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.122143 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3457  Allergen V5/Tpx-1 related  32.94 
 
 		 338 aa  47  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2074  SCP-like extracellular  33.78 
 
 		 222 aa  46.2  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0393  SCP-like extracellular  32.82 
 
 		 168 aa  45.4  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0611399  normal  0.0668716 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1705  Allergen V5/Tpx-1 related  32.56 
 
 		 245 aa  45.4  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000015674  normal  0.367363 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0508  spore coat assembly protein SafA  26.32 
 
 		 203 aa  45.1  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1210  SCP-like extracellular  29 
 
 		 276 aa  44.3  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1557  Allergen V5/Tpx-1 related  31.39 
 
 		 331 aa  43.9  0.0008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal  0.411468 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0081  Allergen V5/Tpx-1 family protein  27.64 
 
 		 321 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0268  SCP-like extracellular  28.57 
 
 		 347 aa  42.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2772  hypothetical protein  32.14 
 
 		 152 aa  42.4  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.882379 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1463  SCP-like extracellular  35.19 
 
 		 312 aa  42.4  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00481671 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1020  SCP-like extracellular  27.27 
 
 		 162 aa  42.4  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0195  SCP-like extracellular  29.69 
 
 		 165 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1086  SCP-like extracellular  29.24 
 
 		 193 aa  41.6  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.162879 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1215  SCP-like extracellular  28.57 
 
 		 162 aa  41.2  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0224  SCP-like extracellular  28.68 
 
 		 165 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>