90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1086 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1086  SCP-like extracellular  100 
 
 		 193 aa  386  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.162879 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1215  SCP-like extracellular  98.15 
 
 		 162 aa  321  3e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1020  SCP-like extracellular  91.36 
 
 		 162 aa  302  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4389  SCP-like extracellular  71.83 
 
 		 182 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.311536  normal  0.985531 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2796  SCP-like extracellular protein  68 
 
 		 164 aa  195  3e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.845381  normal  0.95734 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4125  SCP-like extracellular  74.02 
 
 		 161 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3221  SCP-like extracellular  44.3 
 
 		 169 aa  113  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2095  SCP-like extracellular  46.02 
 
 		 180 aa  102  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.122143 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3556  Allergen V5/Tpx-1 related  40.32 
 
 		 168 aa  100  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2756  hypothetical protein  40.32 
 
 		 169 aa  99.8  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0911231  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4004  Allergen V5/Tpx-1 related  38.71 
 
 		 169 aa  97.1  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.555051 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4689  SCP-like extracellular  34.97 
 
 		 171 aa  91.7  6e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3620  Allergen V5/Tpx-1 related  44 
 
 		 141 aa  91.3  8e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.832332  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6973  hypothetical protein  37.39 
 
 		 171 aa  90.1  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1386  Allergen V5/Tpx-1 related  37.1 
 
 		 170 aa  88.6  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6058  hypothetical protein  42.86 
 
 		 208 aa  87.4  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1406  Allergen V5/Tpx-1 related  37.1 
 
 		 170 aa  85.9  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2741  Allergen V5/Tpx-1 related  37.4 
 
 		 246 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.446296  normal  0.680161 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2789  Allergen V5/Tpx-1 related  40.52 
 
 		 203 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0921233  normal  0.40167 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3184  SCP-like extracellular  40.68 
 
 		 218 aa  74.7  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.14634  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5377  SCP-like extracellular  36.67 
 
 		 168 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.132089  normal  0.43557 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3058  SCP-like extracellular  38.4 
 
 		 169 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0142297  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0195  SCP-like extracellular  34.01 
 
 		 165 aa  68.2  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1282  SCP-like extracellular  32.33 
 
 		 317 aa  67.4  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4557  SCP-like extracellular  38.4 
 
 		 169 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.313497  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0224  SCP-like extracellular  33.75 
 
 		 165 aa  67.4  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3457  Allergen V5/Tpx-1 related  32.14 
 
 		 338 aa  66.6  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2786  Allergen V5/Tpx-1 related  37.6 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.428179 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4832  SCP-like extracellular  38.71 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.627735 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5299  SCP-like extracellular  36 
 
 		 168 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4345  SCP-like extracellular  36.29 
 
 		 159 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1443  Allergen V5/Tpx-1 family protein  35.34 
 
 		 178 aa  63.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.477266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0167  SCP-like extracellular  34.45 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.119271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4591  Allergen V5/Tpx-1 family protein  35.34 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.39255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1293  Allergen V5/Tpx-1 related  33.33 
 
 		 335 aa  62.4  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.224237  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4362  Allergen V5/Tpx-1 related  36.45 
 
 		 264 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1373  hypothetical protein  32 
 
 		 541 aa  58.9  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1857  SCP-like extracellular  30.58 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.539147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0268  SCP-like extracellular  30.25 
 
 		 347 aa  58.5  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0934  Allergen V5/Tpx-1 related  33.6 
 
 		 353 aa  56.6  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.876847  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0309  hypothetical protein  31.36 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0323  hypothetical protein  31.36 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.970328  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1124  hypothetical protein  27.61 
 
 		 255 aa  55.5  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.901449 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0588  hypothetical protein  30.41 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0402  SCP-like extracellular  29.93 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1705  Allergen V5/Tpx-1 related  30.16 
 
 		 245 aa  54.3  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000015674  normal  0.367363 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1426  SCP-like extracellular  32.63 
 
 		 328 aa  52.8  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3687  SCP-like extracellular  24.78 
 
 		 167 aa  52.8  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00687212  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4242  Allergen V5/Tpx-1 family protein  28.21 
 
 		 444 aa  52.4  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.152087 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0219  SCP-like extracellular  34.75 
 
 		 495 aa  52.4  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1374  Allergen V5/Tpx-1 family protein  31.25 
 
 		 129 aa  52  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000198509  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2381  Allergen V5/Tpx-1 related  30.77 
 
 		 310 aa  51.2  0.000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0357627 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1557  Allergen V5/Tpx-1 related  37.74 
 
 		 331 aa  51.6  0.000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal  0.411468 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1179  SCP-like extracellular  25.54 
 
 		 465 aa  51.2  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.249096  hitchhiker  0.000057053 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1835  Allergen V5/Tpx-1 family protein  31.9 
 
 		 156 aa  50.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.780904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0300  Allergen V5/Tpx-1 related  28.46 
 
 		 205 aa  50.8  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.022059  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0202  hypothetical protein  31.9 
 
 		 156 aa  50.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00696457  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0159  SCP-like extracellular  30.57 
 
 		 167 aa  50.4  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.577627  normal  0.78157 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2435  SCP-like extracellular  30.71 
 
 		 270 aa  50.1  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2649  hypothetical protein  28.85 
 
 		 320 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00790253  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3384  Allergen V5/Tpx-1-like  33.33 
 
 		 294 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2948  Allergen V5/Tpx-1 related  29.08 
 
 		 280 aa  48.1  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0215583  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21450  SCP-like extracellular  26.87 
 
 		 255 aa  47.8  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2711  SCP-like extracellular  31.2 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000599492  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0892  SCP-like extracellular  27.5 
 
 		 264 aa  46.6  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000243289 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1940  SCP-like extracellular  23.36 
 
 		 242 aa  46.6  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0764504  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0393  SCP-like extracellular  34.53 
 
 		 168 aa  45.8  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0611399  normal  0.0668716 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3153  Allergen V5/Tpx-1 family protein  26.89 
 
 		 322 aa  45.8  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3169  Allergen V5/Tpx-1 family protein  33.8 
 
 		 279 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.635999  normal  0.126682 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1016  hypothetical protein  26.61 
 
 		 283 aa  45.8  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.768354  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1289  Allergen V5/Tpx-1 family protein  28.32 
 
 		 443 aa  45.8  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.323784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0051  Allergen V5/Tpx-1 family protein  25.6 
 
 		 300 aa  45.4  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000168583  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2003  Allergen V5/Tpx-1 family protein  31.82 
 
 		 140 aa  45.4  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0828  SCP-like extracellular  28.69 
 
 		 274 aa  45.1  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000017875  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4672  SCP-like extracellular  27.73 
 
 		 458 aa  45.1  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.988125  normal  0.181044 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2270  SCP-like extracellular  28.7 
 
 		 212 aa  43.9  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00083862  normal  0.0734842 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2772  hypothetical protein  32.77 
 
 		 152 aa  44.3  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.882379 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38670  uncharacterized protein with SCP/PR1 domains  26.92 
 
 		 260 aa  44.7  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0893  Allergen V5/Tpx-1 related  23.48 
 
 		 449 aa  44.3  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.087721 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1543  hypothetical protein  28.89 
 
 		 235 aa  43.1  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4411  SCP-like extracellular  30.28 
 
 		 300 aa  42.4  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0851  hypothetical protein  30.28 
 
 		 287 aa  42.4  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.721637  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1210  SCP-like extracellular  24.58 
 
 		 276 aa  42.4  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0488  Allergen V5/Tpx-1 related  36 
 
 		 299 aa  42  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1582  SCP-like extracellular  29.24 
 
 		 159 aa  41.6  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.71435  normal  0.283076 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0728  SCP-like extracellular  28.3 
 
 		 285 aa  41.6  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.416101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2424  SCP-like extracellular  35.85 
 
 		 200 aa  41.6  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.572617  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49660  hypothetical protein  32.2 
 
 		 282 aa  41.6  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0346  SCP-like extracellular  28 
 
 		 261 aa  41.2  0.01  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.557826  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0081  Allergen V5/Tpx-1 family protein  28 
 
 		 321 aa  41.2  0.01  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>