114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0159 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0159  SCP-like extracellular  100 
 
 		 167 aa  342  1e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.577627  normal  0.78157 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0224  SCP-like extracellular  55.83 
 
 		 165 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0195  SCP-like extracellular  59.44 
 
 		 165 aa  159  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0588  hypothetical protein  52.86 
 
 		 189 aa  135  4e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0309  hypothetical protein  44.35 
 
 		 139 aa  99  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0323  hypothetical protein  44.35 
 
 		 139 aa  99  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.970328  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0402  SCP-like extracellular  41.74 
 
 		 160 aa  92.4  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1426  SCP-like extracellular  40.18 
 
 		 328 aa  65.1  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2095  SCP-like extracellular  39.13 
 
 		 180 aa  63.9  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.122143 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4411  SCP-like extracellular  36.44 
 
 		 300 aa  60.1  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0779  copper amine oxidase-like protein  31.37 
 
 		 450 aa  59.3  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247024  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2796  SCP-like extracellular protein  34.19 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.845381  normal  0.95734 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0300  Allergen V5/Tpx-1 related  30.95 
 
 		 205 aa  57  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.022059  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3184  SCP-like extracellular  37.39 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.14634  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1117  SCP-like extracellular  33.33 
 
 		 351 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1557  Allergen V5/Tpx-1 related  33.04 
 
 		 331 aa  56.2  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal  0.411468 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0934  Allergen V5/Tpx-1 related  33.33 
 
 		 353 aa  56.2  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.876847  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6058  hypothetical protein  35.48 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0167  SCP-like extracellular  34.75 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.119271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1293  Allergen V5/Tpx-1 related  35.83 
 
 		 335 aa  55.1  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.224237  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1940  SCP-like extracellular  33.58 
 
 		 242 aa  55.1  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0764504  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3798  SCP-like extracellular  31.54 
 
 		 321 aa  55.1  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.891607 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1146  SCP-like extracellular  32.56 
 
 		 351 aa  55.1  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.582279 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3620  Allergen V5/Tpx-1 related  34.78 
 
 		 141 aa  53.9  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.832332  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4689  SCP-like extracellular  28.81 
 
 		 171 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8056  hypothetical protein  33.61 
 
 		 305 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5956  SCP-like extracellular  37.5 
 
 		 226 aa  52.4  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0508  spore coat assembly protein SafA  30.83 
 
 		 203 aa  52  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0907  hypothetical protein  33.63 
 
 		 341 aa  51.6  0.000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1215  SCP-like extracellular  30.57 
 
 		 162 aa  51.6  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5005  SCP-like extracellular  32.48 
 
 		 254 aa  51.6  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.342918  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4285  SCP-like extracellular  31.82 
 
 		 296 aa  51.2  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3457  Allergen V5/Tpx-1 related  34.78 
 
 		 338 aa  51.2  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1020  SCP-like extracellular  30.13 
 
 		 162 aa  50.8  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1407  hypothetical protein  33.9 
 
 		 275 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1208  hypothetical protein  33.9 
 
 		 275 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1186  hypothetical protein  33.9 
 
 		 270 aa  50.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1188  hypothetical protein  33.9 
 
 		 263 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0215059  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2435  SCP-like extracellular  31.58 
 
 		 270 aa  50.1  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1306  hypothetical protein  33.9 
 
 		 275 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481179  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4242  Allergen V5/Tpx-1 family protein  32.33 
 
 		 444 aa  50.4  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.152087 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1086  SCP-like extracellular  30.57 
 
 		 193 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.162879 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1448  hypothetical protein  33.9 
 
 		 275 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1346  hypothetical protein  33.9 
 
 		 275 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3998  hypothetical protein  33.9 
 
 		 270 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0752047 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1384  hypothetical protein  33.9 
 
 		 275 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2756  hypothetical protein  29.63 
 
 		 169 aa  50.1  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0911231  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1399  SCP-like extracellular  32.74 
 
 		 287 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000144066  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1426  SCP-like extracellular protein  32.74 
 
 		 287 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000767316  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1016  hypothetical protein  32.06 
 
 		 283 aa  49.7  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.768354  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1179  SCP-like extracellular  32.37 
 
 		 465 aa  49.7  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.249096  hitchhiker  0.000057053 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1210  SCP-like extracellular  33.9 
 
 		 276 aa  50.1  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4341  Allergen V5/Tpx-1 related  32.74 
 
 		 182 aa  49.3  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.135556  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2510  SCP-like extracellular  33.93 
 
 		 181 aa  48.9  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3268  SCP-like extracellular  39.29 
 
 		 410 aa  49.3  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8010  SCP-like extracellular  32.8 
 
 		 232 aa  48.9  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3556  Allergen V5/Tpx-1 related  30.51 
 
 		 168 aa  48.5  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4389  SCP-like extracellular  31.47 
 
 		 182 aa  48.5  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.311536  normal  0.985531 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2789  Allergen V5/Tpx-1 related  50 
 
 		 203 aa  48.5  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0921233  normal  0.40167 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4541  Allergen V5/Tpx-1 family protein  29.66 
 
 		 150 aa  48.5  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4591  Allergen V5/Tpx-1 family protein  31.36 
 
 		 213 aa  48.1  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.39255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1705  Allergen V5/Tpx-1 related  32.48 
 
 		 245 aa  48.1  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000015674  normal  0.367363 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5290  SCP-like extracellular  30.77 
 
 		 211 aa  47.8  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0268  SCP-like extracellular  32.46 
 
 		 347 aa  47.8  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2817  SCP-like extracellular  31.58 
 
 		 249 aa  47.4  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2237  SCP-like extracellular  34.95 
 
 		 244 aa  47.4  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1373  hypothetical protein  31.03 
 
 		 541 aa  47  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4004  Allergen V5/Tpx-1 related  27.97 
 
 		 169 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.555051 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1386  Allergen V5/Tpx-1 related  28.33 
 
 		 170 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0081  Allergen V5/Tpx-1 family protein  31.86 
 
 		 321 aa  47.4  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0393  SCP-like extracellular  30.5 
 
 		 168 aa  47  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0611399  normal  0.0668716 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3687  SCP-like extracellular  33.61 
 
 		 167 aa  47  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00687212  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4362  Allergen V5/Tpx-1 related  33.71 
 
 		 264 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1282  SCP-like extracellular  31.85 
 
 		 317 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4672  SCP-like extracellular  33.33 
 
 		 458 aa  46.2  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.988125  normal  0.181044 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3066  SCP-like extracellular  32.41 
 
 		 176 aa  46.2  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38670  uncharacterized protein with SCP/PR1 domains  28.8 
 
 		 260 aa  46.2  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1443  Allergen V5/Tpx-1 family protein  32.03 
 
 		 178 aa  45.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.477266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3221  SCP-like extracellular  27.12 
 
 		 169 aa  45.4  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1463  SCP-like extracellular  33.61 
 
 		 312 aa  45.1  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00481671 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0051  Allergen V5/Tpx-1 family protein  32.48 
 
 		 300 aa  45.1  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000168583  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2948  Allergen V5/Tpx-1 related  31.36 
 
 		 280 aa  44.7  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0215583  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1805  SCP-like extracellular  31.48 
 
 		 222 aa  44.7  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000690986 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1913  Allergen V5/Tpx-1 related  31.62 
 
 		 163 aa  44.3  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.110805 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1406  Allergen V5/Tpx-1 related  27.5 
 
 		 170 aa  44.3  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2741  Allergen V5/Tpx-1 related  34.78 
 
 		 246 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.446296  normal  0.680161 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6973  hypothetical protein  26.27 
 
 		 171 aa  43.9  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1690  SCP-like extracellular protein  28.97 
 
 		 200 aa  42.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0940  hypothetical protein  27.03 
 
 		 184 aa  43.1  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1912  Allergen V5/Tpx-1 related  33.08 
 
 		 264 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0614362 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1407  Allergen V5/Tpx-1 related  27.86 
 
 		 302 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0652967 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2003  Allergen V5/Tpx-1 family protein  33.93 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0219  SCP-like extracellular  32.5 
 
 		 495 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21450  SCP-like extracellular  33.64 
 
 		 255 aa  42.7  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2074  SCP-like extracellular  45.1 
 
 		 222 aa  43.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2649  hypothetical protein  31.73 
 
 		 320 aa  42.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00790253  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0910  hypothetical protein  26.13 
 
 		 184 aa  42.7  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3350  Allergen V5/Tpx-1 related  41.18 
 
 		 293 aa  42.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.688686  normal  0.0178942 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1583  SCP-like extracellular  30.77 
 
 		 275 aa  42.4  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2640  hypothetical protein  29.2 
 
 		 353 aa  42.4  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0937186  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>