249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4591 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4591  Allergen V5/Tpx-1 family protein  100 
 
 
213 aa  436  1e-121  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.39255  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0167  SCP-like extracellular  74.33 
 
 
209 aa  266  2e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.119271  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0219  SCP-like extracellular  56 
 
 
495 aa  145  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4362  Allergen V5/Tpx-1 related  56 
 
 
264 aa  139  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328838  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2270  SCP-like extracellular  56.45 
 
 
212 aa  139  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00083862  normal  0.0734842 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3457  Allergen V5/Tpx-1 related  52.82 
 
 
338 aa  137  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1282  SCP-like extracellular  56.1 
 
 
317 aa  137  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3687  SCP-like extracellular  49.24 
 
 
167 aa  132  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00687212  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0445  SCP-like extracellular  48.09 
 
 
500 aa  129  4.0000000000000003e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000975734  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2817  SCP-like extracellular  51.15 
 
 
249 aa  128  7.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1373  hypothetical protein  42.24 
 
 
541 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4242  Allergen V5/Tpx-1 family protein  52 
 
 
444 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.152087 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1016  hypothetical protein  38.76 
 
 
283 aa  124  8.000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.768354  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0393  SCP-like extracellular  51.24 
 
 
168 aa  123  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0611399  normal  0.0668716 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0851  hypothetical protein  50.82 
 
 
287 aa  122  3e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.721637  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4672  SCP-like extracellular  49.6 
 
 
458 aa  120  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.988125  normal  0.181044 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4285  SCP-like extracellular  52.46 
 
 
296 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1705  Allergen V5/Tpx-1 related  48.8 
 
 
245 aa  119  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000015674  normal  0.367363 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1179  SCP-like extracellular  39.11 
 
 
465 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.249096  hitchhiker  0.000057053 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4392  SCP-like extracellular  43.45 
 
 
180 aa  120  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1210  SCP-like extracellular  41.96 
 
 
276 aa  119  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2074  SCP-like extracellular  46.72 
 
 
222 aa  119  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5005  SCP-like extracellular  49.59 
 
 
254 aa  119  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.342918  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0268  SCP-like extracellular  49.59 
 
 
347 aa  118  6e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1289  Allergen V5/Tpx-1 family protein  48.8 
 
 
443 aa  118  6e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.323784  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1208  hypothetical protein  36.81 
 
 
275 aa  118  7e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1306  hypothetical protein  36.81 
 
 
275 aa  118  7e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481179  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1407  hypothetical protein  36.81 
 
 
275 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3998  hypothetical protein  36.81 
 
 
270 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0752047 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1448  hypothetical protein  36.81 
 
 
275 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1384  hypothetical protein  36.81 
 
 
275 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1346  hypothetical protein  36.81 
 
 
275 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1186  hypothetical protein  36.81 
 
 
270 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1188  hypothetical protein  35.84 
 
 
263 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0215059  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0051  Allergen V5/Tpx-1 family protein  44.54 
 
 
300 aa  117  9.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000168583  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1124  hypothetical protein  44.19 
 
 
255 aa  114  8.999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.901449 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5290  SCP-like extracellular  46.77 
 
 
211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4411  SCP-like extracellular  47.46 
 
 
300 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0081  Allergen V5/Tpx-1 family protein  43.41 
 
 
321 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38670  uncharacterized protein with SCP/PR1 domains  48.76 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1426  SCP-like extracellular  40.15 
 
 
328 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0728  SCP-like extracellular  47.11 
 
 
285 aa  109  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.416101  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8056  hypothetical protein  46.72 
 
 
305 aa  106  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2976  Allergen V5/Tpx-1 related  42.25 
 
 
334 aa  104  8e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0120131  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2237  SCP-like extracellular  43.33 
 
 
244 aa  104  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2358  SCP-like extracellular  43.38 
 
 
283 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.678269  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0508  spore coat assembly protein SafA  33.17 
 
 
203 aa  103  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0488  Allergen V5/Tpx-1 related  46.21 
 
 
299 aa  103  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3563  hypothetical protein  42.65 
 
 
283 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8010  SCP-like extracellular  48.74 
 
 
232 aa  102  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2482  SCP-like extracellular  43.7 
 
 
283 aa  101  7e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.897986  normal  0.230524 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5956  SCP-like extracellular  46.09 
 
 
226 aa  101  9e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3350  Allergen V5/Tpx-1 related  42.86 
 
 
293 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.688686  normal  0.0178942 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2211  SCP-like extracellular protein  41.91 
 
 
283 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1940  SCP-like extracellular  36.3 
 
 
242 aa  99  5e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0764504  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0779  copper amine oxidase-like protein  40 
 
 
450 aa  98.6  6e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247024  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3384  Allergen V5/Tpx-1-like  42.75 
 
 
294 aa  98.6  7e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001041  hypothetical protein  35.95 
 
 
179 aa  97.4  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2435  SCP-like extracellular  39.55 
 
 
270 aa  97.8  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2649  hypothetical protein  45.37 
 
 
320 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00790253  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3579  hypothetical protein  41.79 
 
 
293 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.38499  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3153  Allergen V5/Tpx-1 family protein  41.46 
 
 
322 aa  96.7  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2948  Allergen V5/Tpx-1 related  36.67 
 
 
280 aa  97.1  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0215583  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2381  Allergen V5/Tpx-1 related  45.37 
 
 
310 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0357627 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2217  SCP-like extracellular  46.85 
 
 
162 aa  96.3  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3169  Allergen V5/Tpx-1 family protein  46.79 
 
 
279 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.635999  normal  0.126682 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0300  Allergen V5/Tpx-1 related  32.64 
 
 
205 aa  95.1  7e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.022059  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49660  hypothetical protein  47.32 
 
 
282 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1557  Allergen V5/Tpx-1 related  42.86 
 
 
331 aa  93.6  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal  0.411468 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1293  Allergen V5/Tpx-1 related  41.09 
 
 
335 aa  93.2  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.224237  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05140  SCP-like extracellular  38.58 
 
 
258 aa  92.4  4e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0892  SCP-like extracellular  45.97 
 
 
264 aa  92  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000243289 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0598  SCP-like extracellular  40.8 
 
 
276 aa  92  6e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.845775  normal  0.23326 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18350  hypothetical protein  41.04 
 
 
301 aa  92  6e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3268  SCP-like extracellular  40 
 
 
410 aa  91.3  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3565  hypothetical protein  39.47 
 
 
206 aa  90.9  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.727767  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1543  hypothetical protein  37.68 
 
 
235 aa  90.1  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2104  Allergen V5/Tpx-1-like  42.59 
 
 
288 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233408  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1690  SCP-like extracellular protein  45.45 
 
 
200 aa  89.4  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4796  serine/threonine protein kinase  36.15 
 
 
551 aa  89.4  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000010036  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2043  Allergen V5/Tpx-1 related  41.88 
 
 
196 aa  88.2  8e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0276422  normal  0.319002 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3764  SCP-like extracellular  39.17 
 
 
373 aa  88.2  9e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1374  Allergen V5/Tpx-1 family protein  36.59 
 
 
129 aa  87.4  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000198509  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1426  SCP-like extracellular protein  34.38 
 
 
287 aa  87.8  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000767316  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1399  SCP-like extracellular  34.38 
 
 
287 aa  87.8  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000144066  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3984  hypothetical protein  39.17 
 
 
344 aa  87  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4052  hypothetical protein  39.17 
 
 
344 aa  87  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.244783  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3849  hypothetical protein  39.17 
 
 
344 aa  86.7  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3680  hypothetical protein  39.17 
 
 
344 aa  86.7  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3697  hypothetical protein  39.17 
 
 
336 aa  86.7  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4147  hypothetical protein  39.17 
 
 
344 aa  86.7  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3137  SCP-like extracellular  43.52 
 
 
286 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3952  hypothetical protein  39.17 
 
 
344 aa  86.7  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2640  hypothetical protein  38.33 
 
 
353 aa  86.3  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0937186  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0202  hypothetical protein  38.89 
 
 
156 aa  85.9  4e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00696457  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1835  Allergen V5/Tpx-1 family protein  38.89 
 
 
156 aa  85.9  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.780904  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1200  hypothetical protein  38.33 
 
 
344 aa  85.9  5e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4039  hypothetical protein  41.32 
 
 
344 aa  85.1  8e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.784658  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0828  SCP-like extracellular  38.02 
 
 
274 aa  84.7  9e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000017875  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2424  SCP-like extracellular  42.59 
 
 
200 aa  84.7  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.572617  normal  0.29276 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>