160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1543 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_1543  hypothetical protein  100 
 
 
235 aa  491  9.999999999999999e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4591  Allergen V5/Tpx-1 family protein  37.68 
 
 
213 aa  89.7  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.39255  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0167  SCP-like extracellular  37.31 
 
 
209 aa  82.4  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.119271  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2217  SCP-like extracellular  35.04 
 
 
162 aa  81.3  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0268  SCP-like extracellular  32.67 
 
 
347 aa  79.7  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0219  SCP-like extracellular  34.62 
 
 
495 aa  73.2  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2043  Allergen V5/Tpx-1 related  34.65 
 
 
196 aa  72.4  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0276422  normal  0.319002 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1282  SCP-like extracellular  35.11 
 
 
317 aa  70.5  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3457  Allergen V5/Tpx-1 related  34.07 
 
 
338 aa  69.3  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2095  SCP-like extracellular  33.59 
 
 
180 aa  68.2  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.122143 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3687  SCP-like extracellular  32.61 
 
 
167 aa  67.8  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00687212  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1426  SCP-like extracellular  28.95 
 
 
328 aa  66.2  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0445  SCP-like extracellular  34.11 
 
 
500 aa  65.9  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000975734  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2188  SCP-like extracellular  36.61 
 
 
298 aa  65.9  0.0000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3446  SCP-like extracellular  33.12 
 
 
589 aa  65.1  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.118078 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2270  SCP-like extracellular  32.43 
 
 
212 aa  65.1  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00083862  normal  0.0734842 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2435  SCP-like extracellular  27.04 
 
 
270 aa  64.7  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0508  spore coat assembly protein SafA  30.77 
 
 
203 aa  64.7  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5290  SCP-like extracellular  31.72 
 
 
211 aa  64.7  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3221  SCP-like extracellular  31.06 
 
 
169 aa  64.7  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2817  SCP-like extracellular  32.56 
 
 
249 aa  64.3  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4362  Allergen V5/Tpx-1 related  30.77 
 
 
264 aa  63.5  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328838  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4411  SCP-like extracellular  32.56 
 
 
300 aa  62.8  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0300  Allergen V5/Tpx-1 related  30.71 
 
 
205 aa  62.4  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.022059  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4242  Allergen V5/Tpx-1 family protein  27.21 
 
 
444 aa  62.4  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.152087 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1373  hypothetical protein  28.86 
 
 
541 aa  62  0.000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1705  Allergen V5/Tpx-1 related  30.23 
 
 
245 aa  61.6  0.000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000015674  normal  0.367363 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2756  hypothetical protein  32.14 
 
 
169 aa  61.6  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0911231  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3556  Allergen V5/Tpx-1 related  32.14 
 
 
168 aa  61.6  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3523  Allergen V5/Tpx-1 related  31.34 
 
 
188 aa  61.6  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2074  SCP-like extracellular  32.26 
 
 
222 aa  61.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2451  SCP-like extracellular  31.21 
 
 
384 aa  61.6  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.645872  normal  0.0150957 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2104  Allergen V5/Tpx-1-like  31.47 
 
 
288 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233408  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1289  Allergen V5/Tpx-1 family protein  25 
 
 
443 aa  60.8  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.323784  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49660  hypothetical protein  32.2 
 
 
282 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0140  Allergen V5/Tpx-1 family protein  30.41 
 
 
372 aa  60.1  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.697458  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3565  hypothetical protein  32.2 
 
 
206 aa  59.3  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.727767  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3169  Allergen V5/Tpx-1 family protein  33.91 
 
 
279 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.635999  normal  0.126682 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1597  Allergen V5/Tpx-1 family protein  33.08 
 
 
602 aa  58.9  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4672  SCP-like extracellular  26.81 
 
 
458 aa  58.9  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.988125  normal  0.181044 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1406  Allergen V5/Tpx-1 related  31.25 
 
 
170 aa  58.5  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18350  hypothetical protein  32.76 
 
 
301 aa  58.5  0.00000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05140  SCP-like extracellular  26.81 
 
 
258 aa  58.5  0.00000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6973  hypothetical protein  31.86 
 
 
171 aa  58.5  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1407  hypothetical protein  28.28 
 
 
275 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1208  hypothetical protein  28.28 
 
 
275 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1188  hypothetical protein  28.08 
 
 
263 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0215059  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1306  hypothetical protein  28.28 
 
 
275 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481179  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3998  hypothetical protein  28.08 
 
 
270 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0752047 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1386  Allergen V5/Tpx-1 related  31.25 
 
 
170 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3166  Allergen V5/Tpx-1 family protein  26.32 
 
 
461 aa  57.8  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1384  hypothetical protein  28.28 
 
 
275 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1346  hypothetical protein  28.28 
 
 
275 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1186  hypothetical protein  28.08 
 
 
270 aa  57.4  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1124  hypothetical protein  31.11 
 
 
255 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.901449 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1293  Allergen V5/Tpx-1 related  30.15 
 
 
335 aa  57  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.224237  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1210  SCP-like extracellular  28.28 
 
 
276 aa  57.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4689  SCP-like extracellular  32.74 
 
 
171 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3153  Allergen V5/Tpx-1 family protein  30.37 
 
 
322 aa  57  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0683  SCP-like extracellular  28.47 
 
 
423 aa  57.4  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0393  SCP-like extracellular  29.51 
 
 
168 aa  57.8  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0611399  normal  0.0668716 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0402  SCP-like extracellular  35.2 
 
 
160 aa  57  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1448  hypothetical protein  28.28 
 
 
275 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0202  hypothetical protein  31.78 
 
 
156 aa  56.6  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00696457  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1156  Allergen V5/Tpx-1 related  25.9 
 
 
337 aa  57  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.445034 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1835  Allergen V5/Tpx-1 family protein  31.78 
 
 
156 aa  56.6  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.780904  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1179  SCP-like extracellular  25.79 
 
 
465 aa  56.2  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.249096  hitchhiker  0.000057053 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1604  Allergen V5/Tpx-1 related  32.26 
 
 
552 aa  56.2  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0126507  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3137  SCP-like extracellular  29.86 
 
 
286 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1463  SCP-like extracellular  31.34 
 
 
312 aa  55.8  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00481671 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3579  hypothetical protein  32.35 
 
 
293 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.38499  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38670  uncharacterized protein with SCP/PR1 domains  29.17 
 
 
260 aa  55.5  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0309  hypothetical protein  33.87 
 
 
139 aa  55.1  0.0000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0323  hypothetical protein  33.87 
 
 
139 aa  55.1  0.0000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.970328  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2649  hypothetical protein  32.17 
 
 
320 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00790253  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2381  Allergen V5/Tpx-1 related  27.22 
 
 
310 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0357627 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0470  Allergen V5/Tpx-1 related  30.28 
 
 
310 aa  55.1  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.765372 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0458  Allergen V5/Tpx-1 related  29.73 
 
 
174 aa  54.7  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0827  hypothetical protein  29.5 
 
 
317 aa  54.7  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.722064  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0460  SCP-like extracellular  32.35 
 
 
184 aa  54.3  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.133435  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2482  SCP-like extracellular  29.71 
 
 
283 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.897986  normal  0.230524 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0816  hypothetical protein  29.5 
 
 
317 aa  54.3  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2358  SCP-like extracellular  29.71 
 
 
283 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.678269  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2211  SCP-like extracellular protein  28.99 
 
 
283 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4238  hypothetical protein  34.48 
 
 
282 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.569543  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0892  SCP-like extracellular  28.05 
 
 
264 aa  53.5  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000243289 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1016  hypothetical protein  28.08 
 
 
283 aa  53.9  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.768354  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4392  SCP-like extracellular  29.69 
 
 
180 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3563  hypothetical protein  32.48 
 
 
283 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1443  Allergen V5/Tpx-1 family protein  34.51 
 
 
178 aa  53.1  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.477266  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3184  SCP-like extracellular  31.16 
 
 
218 aa  53.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.14634  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3384  Allergen V5/Tpx-1-like  36.46 
 
 
294 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0728  SCP-like extracellular  30.47 
 
 
285 aa  53.1  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.416101  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2258  SCP-like extracellular protein  31.45 
 
 
553 aa  52.8  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.266463  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2441  SCP-like extracellular  29.46 
 
 
194 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.938741  hitchhiker  0.0000000999881 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4285  SCP-like extracellular  31.25 
 
 
296 aa  52.8  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0051  Allergen V5/Tpx-1 family protein  30.23 
 
 
300 aa  53.1  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000168583  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1235  SCP-like extracellular  28.97 
 
 
399 aa  53.1  0.000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0828  SCP-like extracellular  28.24 
 
 
274 aa  52.8  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000017875  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4004  Allergen V5/Tpx-1 related  28.57 
 
 
169 aa  52.4  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.555051 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>