79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_5377 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_5377  SCP-like extracellular  100 
 
 		 168 aa  334  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.132089  normal  0.43557 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5299  SCP-like extracellular  94.05 
 
 		 168 aa  274  3e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4832  SCP-like extracellular  95.77 
 
 		 142 aa  257  7e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.627735 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4345  SCP-like extracellular  76.43 
 
 		 159 aa  204  7e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4557  SCP-like extracellular  70.15 
 
 		 169 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.313497  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3058  SCP-like extracellular  65.99 
 
 		 169 aa  193  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0142297  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6973  hypothetical protein  51.97 
 
 		 171 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4004  Allergen V5/Tpx-1 related  51.08 
 
 		 169 aa  134  8e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.555051 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2756  hypothetical protein  48.25 
 
 		 169 aa  134  8e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0911231  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4689  SCP-like extracellular  50 
 
 		 171 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3556  Allergen V5/Tpx-1 related  49.28 
 
 		 168 aa  130  7.999999999999999e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1406  Allergen V5/Tpx-1 related  50 
 
 		 170 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1386  Allergen V5/Tpx-1 related  49.28 
 
 		 170 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2095  SCP-like extracellular  51.8 
 
 		 180 aa  122  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.122143 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3221  SCP-like extracellular  43.12 
 
 		 169 aa  102  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1020  SCP-like extracellular  39.75 
 
 		 162 aa  84  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1215  SCP-like extracellular  39.75 
 
 		 162 aa  81.3  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1086  SCP-like extracellular  38.51 
 
 		 193 aa  80.5  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.162879 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4389  SCP-like extracellular  38.73 
 
 		 182 aa  79  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.311536  normal  0.985531 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2796  SCP-like extracellular protein  36.67 
 
 		 164 aa  78.2  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.845381  normal  0.95734 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4125  SCP-like extracellular  41.98 
 
 		 161 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6058  hypothetical protein  36.52 
 
 		 208 aa  65.5  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1293  Allergen V5/Tpx-1 related  35.48 
 
 		 335 aa  65.9  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.224237  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4591  Allergen V5/Tpx-1 family protein  31.33 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.39255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3184  SCP-like extracellular  32.09 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.14634  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3620  Allergen V5/Tpx-1 related  37.07 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.832332  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4796  serine/threonine protein kinase  28.33 
 
 		 551 aa  60.8  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000010036  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1200  hypothetical protein  28.57 
 
 		 184 aa  58.9  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3457  Allergen V5/Tpx-1 related  32.86 
 
 		 338 aa  58.2  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4362  Allergen V5/Tpx-1 related  33.33 
 
 		 264 aa  58.2  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1282  SCP-like extracellular  37.19 
 
 		 317 aa  58.2  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2638  Allergen V5/Tpx-1 family protein  30.12 
 
 		 179 aa  57.4  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.450247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2861  Allergen V5/Tpx-1 family protein  28.83 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0268  SCP-like extracellular  28.69 
 
 		 347 aa  56.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3687  SCP-like extracellular  27.42 
 
 		 167 aa  54.3  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00687212  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2897  Allergen V5/Tpx-1 related  28.33 
 
 		 176 aa  53.5  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.870748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0167  SCP-like extracellular  31.4 
 
 		 209 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.119271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2741  Allergen V5/Tpx-1 related  30.17 
 
 		 246 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.446296  normal  0.680161 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1705  Allergen V5/Tpx-1 related  29.82 
 
 		 245 aa  50.1  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000015674  normal  0.367363 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3565  hypothetical protein  33.02 
 
 		 206 aa  50.4  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.727767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0934  Allergen V5/Tpx-1 related  35.34 
 
 		 353 aa  50.1  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.876847  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2270  SCP-like extracellular  31.4 
 
 		 212 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00083862  normal  0.0734842 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2381  Allergen V5/Tpx-1 related  31.01 
 
 		 310 aa  47  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0357627 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0224  SCP-like extracellular  26.83 
 
 		 165 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1426  SCP-like extracellular  26.36 
 
 		 328 aa  46.6  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3563  hypothetical protein  31.51 
 
 		 283 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2211  SCP-like extracellular protein  31.51 
 
 		 283 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2789  Allergen V5/Tpx-1 related  32.48 
 
 		 203 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0921233  normal  0.40167 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1373  hypothetical protein  27.83 
 
 		 541 aa  46.6  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2580  Allergen V5/Tpx-1 family protein  27.33 
 
 		 199 aa  45.4  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.632979 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2649  hypothetical protein  28.68 
 
 		 320 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00790253  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0051  Allergen V5/Tpx-1 family protein  39.29 
 
 		 300 aa  45.4  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000168583  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1940  SCP-like extracellular  28.7 
 
 		 242 aa  45.1  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0764504  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2358  SCP-like extracellular  31.51 
 
 		 283 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.678269  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2817  SCP-like extracellular  30 
 
 		 249 aa  45.1  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1543  hypothetical protein  29.58 
 
 		 235 aa  45.1  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0309  hypothetical protein  28.45 
 
 		 139 aa  44.3  0.0008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0323  hypothetical protein  28.45 
 
 		 139 aa  44.3  0.0008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.970328  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8056  hypothetical protein  30.16 
 
 		 305 aa  43.9  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0402  SCP-like extracellular  27.35 
 
 		 160 aa  43.9  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0300  Allergen V5/Tpx-1 related  23.53 
 
 		 205 aa  43.5  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.022059  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0195  SCP-like extracellular  26.77 
 
 		 165 aa  43.9  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2104  Allergen V5/Tpx-1-like  31.01 
 
 		 288 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233408  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3384  Allergen V5/Tpx-1-like  30.77 
 
 		 294 aa  43.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1124  hypothetical protein  30.56 
 
 		 255 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.901449 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2435  SCP-like extracellular  31.58 
 
 		 270 aa  42.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3169  Allergen V5/Tpx-1 family protein  29.91 
 
 		 279 aa  42.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.635999  normal  0.126682 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3153  Allergen V5/Tpx-1 family protein  26.09 
 
 		 322 aa  43.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3495  putative SCP-like extracellular protein  30.34 
 
 		 176 aa  42.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.870948  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0508  spore coat assembly protein SafA  26.36 
 
 		 203 aa  42.4  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0588  hypothetical protein  29.13 
 
 		 189 aa  42  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0219  SCP-like extracellular  30.63 
 
 		 495 aa  41.6  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0910  hypothetical protein  24.81 
 
 		 184 aa  41.6  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0940  hypothetical protein  24.81 
 
 		 184 aa  41.2  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2482  SCP-like extracellular  29.87 
 
 		 283 aa  41.2  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.897986  normal  0.230524 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4411  SCP-like extracellular  29.73 
 
 		 300 aa  41.2  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2786  Allergen V5/Tpx-1 related  31.3 
 
 		 194 aa  40.8  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.428179 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1557  Allergen V5/Tpx-1 related  30.91 
 
 		 331 aa  40.8  0.01  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal  0.411468 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2948  Allergen V5/Tpx-1 related  25.2 
 
 		 280 aa  40.8  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0215583  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>