117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2638 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2638  Allergen V5/Tpx-1 family protein  100 
 
 
179 aa  365  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.450247  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2861  Allergen V5/Tpx-1 family protein  89.94 
 
 
179 aa  335  2.9999999999999997e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1200  hypothetical protein  89.94 
 
 
184 aa  333  5.999999999999999e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3495  putative SCP-like extracellular protein  68.21 
 
 
176 aa  222  2e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.870948  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2580  Allergen V5/Tpx-1 family protein  56.35 
 
 
199 aa  202  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.632979 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2897  Allergen V5/Tpx-1 related  56.17 
 
 
176 aa  186  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.870748  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0167  SCP-like extracellular  36.44 
 
 
209 aa  78.6  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.119271  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4591  Allergen V5/Tpx-1 family protein  33.33 
 
 
213 aa  75.1  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.39255  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1373  hypothetical protein  32.23 
 
 
541 aa  70.9  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0268  SCP-like extracellular  33.33 
 
 
347 aa  68.9  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2270  SCP-like extracellular  32.54 
 
 
212 aa  67  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00083862  normal  0.0734842 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4392  SCP-like extracellular  33.91 
 
 
180 aa  67.4  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3687  SCP-like extracellular  28.24 
 
 
167 aa  67.4  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00687212  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4232  hypothetical protein  26.27 
 
 
152 aa  64.7  0.0000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.281804  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3169  Allergen V5/Tpx-1 family protein  32.31 
 
 
279 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.635999  normal  0.126682 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2074  SCP-like extracellular  31.3 
 
 
222 aa  61.2  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2381  Allergen V5/Tpx-1 related  30.7 
 
 
310 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0357627 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2649  hypothetical protein  31.19 
 
 
320 aa  58.5  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00790253  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4362  Allergen V5/Tpx-1 related  29.46 
 
 
264 aa  58.5  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328838  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8056  hypothetical protein  28.91 
 
 
305 aa  58.5  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18350  hypothetical protein  30.3 
 
 
301 aa  57.8  0.00000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0393  SCP-like extracellular  33.87 
 
 
168 aa  57  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0611399  normal  0.0668716 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0219  SCP-like extracellular  29.06 
 
 
495 aa  55.5  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1289  Allergen V5/Tpx-1 family protein  29.73 
 
 
443 aa  55.1  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.323784  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4242  Allergen V5/Tpx-1 family protein  32.65 
 
 
444 aa  55.1  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.152087 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2711  SCP-like extracellular  36.47 
 
 
220 aa  55.1  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000599492  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3384  Allergen V5/Tpx-1-like  29.37 
 
 
294 aa  54.7  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49660  hypothetical protein  29.55 
 
 
282 aa  54.7  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3446  SCP-like extracellular  32.26 
 
 
589 aa  54.3  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.118078 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0300  Allergen V5/Tpx-1 related  30.08 
 
 
205 aa  54.3  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.022059  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1399  Allergen V5/Tpx-1 family protein  37.14 
 
 
156 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.235297 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1597  Allergen V5/Tpx-1 family protein  33.96 
 
 
602 aa  54.3  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4672  SCP-like extracellular  31.63 
 
 
458 aa  53.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.988125  normal  0.181044 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5290  SCP-like extracellular  27.5 
 
 
211 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2104  Allergen V5/Tpx-1-like  27.86 
 
 
288 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233408  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3579  hypothetical protein  29.77 
 
 
293 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.38499  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1124  hypothetical protein  30.77 
 
 
255 aa  52  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.901449 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0851  hypothetical protein  30 
 
 
287 aa  52.4  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.721637  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1016  hypothetical protein  28.69 
 
 
283 aa  51.6  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.768354  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2817  SCP-like extracellular  29.01 
 
 
249 aa  51.6  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2358  SCP-like extracellular  29.63 
 
 
283 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.678269  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3563  hypothetical protein  27.48 
 
 
283 aa  51.2  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1282  SCP-like extracellular  29.82 
 
 
317 aa  50.8  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4411  SCP-like extracellular  30.83 
 
 
300 aa  50.8  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2043  Allergen V5/Tpx-1 related  31 
 
 
196 aa  50.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0276422  normal  0.319002 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2211  SCP-like extracellular protein  29.01 
 
 
283 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1210  SCP-like extracellular  27.73 
 
 
276 aa  50.4  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3137  SCP-like extracellular  28.47 
 
 
286 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2237  SCP-like extracellular  28.07 
 
 
244 aa  50.8  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3350  Allergen V5/Tpx-1 related  28.24 
 
 
293 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.688686  normal  0.0178942 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0598  SCP-like extracellular  30.33 
 
 
276 aa  49.7  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.845775  normal  0.23326 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0728  SCP-like extracellular  29.59 
 
 
285 aa  48.9  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.416101  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2195  Allergen V5/Tpx-1 family protein  28.44 
 
 
232 aa  48.9  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0225446  normal  0.313074 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1426  SCP-like extracellular  25 
 
 
328 aa  48.5  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0508  spore coat assembly protein SafA  26.36 
 
 
203 aa  48.1  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2003  Allergen V5/Tpx-1 family protein  29.46 
 
 
140 aa  47.8  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0703  SCP/PR1 domain-containing proteins-like  30.51 
 
 
338 aa  47.4  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.501608  normal  0.0221352 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3565  hypothetical protein  29.41 
 
 
206 aa  47  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.727767  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0445  SCP-like extracellular  30.48 
 
 
500 aa  47.8  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000975734  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1940  SCP-like extracellular  23.44 
 
 
242 aa  47.8  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0764504  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4832  SCP-like extracellular  29.66 
 
 
142 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.627735 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5377  SCP-like extracellular  30.07 
 
 
168 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.132089  normal  0.43557 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3457  Allergen V5/Tpx-1 related  27.34 
 
 
338 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1406  Allergen V5/Tpx-1 related  27.05 
 
 
170 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1179  SCP-like extracellular  28.16 
 
 
465 aa  46.6  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.249096  hitchhiker  0.000057053 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8010  SCP-like extracellular  30.63 
 
 
232 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2482  SCP-like extracellular  26.92 
 
 
283 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.897986  normal  0.230524 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1186  hypothetical protein  26.05 
 
 
270 aa  45.8  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1188  hypothetical protein  26.05 
 
 
263 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0215059  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3523  Allergen V5/Tpx-1 related  34.51 
 
 
188 aa  45.4  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0779  copper amine oxidase-like protein  24.41 
 
 
450 aa  45.4  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247024  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0081  Allergen V5/Tpx-1 family protein  25.86 
 
 
321 aa  45.4  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0402  SCP-like extracellular  28.81 
 
 
160 aa  45.4  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3998  hypothetical protein  26.05 
 
 
270 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0752047 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1407  hypothetical protein  26.05 
 
 
275 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1208  hypothetical protein  26.05 
 
 
275 aa  45.4  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1306  hypothetical protein  26.05 
 
 
275 aa  45.4  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481179  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1463  SCP-like extracellular  28.79 
 
 
312 aa  45.1  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00481671 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2217  SCP-like extracellular  27.07 
 
 
162 aa  45.4  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4689  SCP-like extracellular  26.06 
 
 
171 aa  45.1  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1448  hypothetical protein  26.05 
 
 
275 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1346  hypothetical protein  26.05 
 
 
275 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1384  hypothetical protein  26.05 
 
 
275 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3268  SCP-like extracellular  29.82 
 
 
410 aa  45.1  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0910  hypothetical protein  23.97 
 
 
184 aa  45.1  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5299  SCP-like extracellular  28.97 
 
 
168 aa  45.1  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1293  Allergen V5/Tpx-1 related  29.79 
 
 
335 aa  44.7  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.224237  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2188  SCP-like extracellular  30.43 
 
 
298 aa  44.7  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4238  hypothetical protein  30.3 
 
 
282 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.569543  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5005  SCP-like extracellular  25.4 
 
 
254 aa  44.7  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.342918  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0940  hypothetical protein  23.81 
 
 
184 aa  44.7  0.0008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2756  hypothetical protein  28.33 
 
 
169 aa  44.3  0.0009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0911231  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6973  hypothetical protein  26.05 
 
 
171 aa  44.3  0.0009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1543  hypothetical protein  26.61 
 
 
235 aa  44.3  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1156  Allergen V5/Tpx-1 related  29.27 
 
 
337 aa  43.9  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.445034 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0488  Allergen V5/Tpx-1 related  29.77 
 
 
299 aa  43.9  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4285  SCP-like extracellular  25.83 
 
 
296 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2424  SCP-like extracellular  27.34 
 
 
200 aa  43.5  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.572617  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0828  SCP-like extracellular  24.14 
 
 
274 aa  43.5  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000017875  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0992  SCP-like extracellular  24.39 
 
 
336 aa  43.1  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>