118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1200 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1200  hypothetical protein  100 
 
 		 184 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2861  Allergen V5/Tpx-1 family protein  100 
 
 		 179 aa  367  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2638  Allergen V5/Tpx-1 family protein  89.94 
 
 		 179 aa  333  5.999999999999999e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.450247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3495  putative SCP-like extracellular protein  64.97 
 
 		 176 aa  223  2e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.870948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2580  Allergen V5/Tpx-1 family protein  54.3 
 
 		 199 aa  200  9.999999999999999e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.632979 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2897  Allergen V5/Tpx-1 related  54.34 
 
 		 176 aa  192  2e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.870748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0167  SCP-like extracellular  37.29 
 
 		 209 aa  80.1  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.119271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4591  Allergen V5/Tpx-1 family protein  37.29 
 
 		 213 aa  79  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.39255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1373  hypothetical protein  33.88 
 
 		 541 aa  73.6  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2270  SCP-like extracellular  35.71 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00083862  normal  0.0734842 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4392  SCP-like extracellular  34.17 
 
 		 180 aa  70.1  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4232  hypothetical protein  27.97 
 
 		 152 aa  68.9  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.281804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3687  SCP-like extracellular  27.94 
 
 		 167 aa  66.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00687212  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0268  SCP-like extracellular  31.97 
 
 		 347 aa  65.9  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2074  SCP-like extracellular  31.03 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4242  Allergen V5/Tpx-1 family protein  31.25 
 
 		 444 aa  62.4  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.152087 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8056  hypothetical protein  32.03 
 
 		 305 aa  62.8  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3169  Allergen V5/Tpx-1 family protein  33.08 
 
 		 279 aa  62  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.635999  normal  0.126682 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0219  SCP-like extracellular  31.62 
 
 		 495 aa  60.8  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4362  Allergen V5/Tpx-1 related  31.25 
 
 		 264 aa  60.5  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328838  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18350  hypothetical protein  31.82 
 
 		 301 aa  60.5  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49660  hypothetical protein  32.58 
 
 		 282 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0393  SCP-like extracellular  33.87 
 
 		 168 aa  59.3  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0611399  normal  0.0668716 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4672  SCP-like extracellular  29.69 
 
 		 458 aa  58.9  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.988125  normal  0.181044 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1399  Allergen V5/Tpx-1 family protein  38.1 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.235297 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2711  SCP-like extracellular  35.16 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000599492  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0300  Allergen V5/Tpx-1 related  31.58 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.022059  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1289  Allergen V5/Tpx-1 family protein  29.51 
 
 		 443 aa  58.2  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.323784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3384  Allergen V5/Tpx-1-like  32.06 
 
 		 294 aa  57  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2649  hypothetical protein  30.26 
 
 		 320 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00790253  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2381  Allergen V5/Tpx-1 related  30.53 
 
 		 310 aa  57  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0357627 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5290  SCP-like extracellular  29.17 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2104  Allergen V5/Tpx-1-like  29.77 
 
 		 288 aa  55.1  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233408  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2358  SCP-like extracellular  28.03 
 
 		 283 aa  55.1  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.678269  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3563  hypothetical protein  28.79 
 
 		 283 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2043  Allergen V5/Tpx-1 related  28.86 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0276422  normal  0.319002 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0851  hypothetical protein  33.64 
 
 		 287 aa  54.7  0.0000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.721637  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1597  Allergen V5/Tpx-1 family protein  33.96 
 
 		 602 aa  54.3  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1282  SCP-like extracellular  29.37 
 
 		 317 aa  54.7  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2817  SCP-like extracellular  30.83 
 
 		 249 aa  54.3  0.0000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2211  SCP-like extracellular protein  30.3 
 
 		 283 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3446  SCP-like extracellular  32.8 
 
 		 589 aa  54.3  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.118078 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1124  hypothetical protein  31.4 
 
 		 255 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.901449 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3579  hypothetical protein  32.71 
 
 		 293 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.38499  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1426  SCP-like extracellular  28.15 
 
 		 328 aa  53.5  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4411  SCP-like extracellular  31.67 
 
 		 300 aa  52.4  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3137  SCP-like extracellular  31.19 
 
 		 286 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0728  SCP-like extracellular  31 
 
 		 285 aa  52.8  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.416101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3457  Allergen V5/Tpx-1 related  29.01 
 
 		 338 aa  52  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3350  Allergen V5/Tpx-1 related  29.2 
 
 		 293 aa  51.2  0.000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.688686  normal  0.0178942 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3565  hypothetical protein  32.35 
 
 		 206 aa  50.8  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.727767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1179  SCP-like extracellular  29.13 
 
 		 465 aa  50.4  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.249096  hitchhiker  0.000057053 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0508  spore coat assembly protein SafA  28.18 
 
 		 203 aa  50.8  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5005  SCP-like extracellular  26.87 
 
 		 254 aa  50.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.342918  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0598  SCP-like extracellular  30.83 
 
 		 276 aa  50.1  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.845775  normal  0.23326 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2237  SCP-like extracellular  28.07 
 
 		 244 aa  50.1  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1016  hypothetical protein  27.07 
 
 		 283 aa  49.3  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.768354  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4832  SCP-like extracellular  28.97 
 
 		 142 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.627735 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2482  SCP-like extracellular  28.24 
 
 		 283 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.897986  normal  0.230524 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4689  SCP-like extracellular  27.17 
 
 		 171 aa  48.9  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2195  Allergen V5/Tpx-1 family protein  28.44 
 
 		 232 aa  48.5  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0225446  normal  0.313074 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1210  SCP-like extracellular  27.12 
 
 		 276 aa  48.1  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5377  SCP-like extracellular  29.37 
 
 		 168 aa  48.1  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.132089  normal  0.43557 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1406  Allergen V5/Tpx-1 related  27.87 
 
 		 170 aa  47.8  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2424  SCP-like extracellular  28.89 
 
 		 200 aa  47.8  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.572617  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0445  SCP-like extracellular  31.43 
 
 		 500 aa  47.8  0.00009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000975734  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8010  SCP-like extracellular  28.12 
 
 		 232 aa  47.8  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3865  SCP-like extracellular  28.26 
 
 		 207 aa  47.4  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.348195  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0402  SCP-like extracellular  28.81 
 
 		 160 aa  47.4  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2003  Allergen V5/Tpx-1 family protein  29.57 
 
 		 140 aa  46.6  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5299  SCP-like extracellular  28.28 
 
 		 168 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0610  SCP-like extracellular  26.67 
 
 		 352 aa  46.2  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2756  hypothetical protein  31.25 
 
 		 169 aa  46.2  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0911231  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4285  SCP-like extracellular  27.5 
 
 		 296 aa  45.8  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1940  SCP-like extracellular  24.14 
 
 		 242 aa  46.2  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0764504  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38670  uncharacterized protein with SCP/PR1 domains  26.89 
 
 		 260 aa  46.2  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3268  SCP-like extracellular  30.7 
 
 		 410 aa  45.8  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0828  SCP-like extracellular  24.14 
 
 		 274 aa  45.4  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000017875  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0992  SCP-like extracellular  26.02 
 
 		 336 aa  45.4  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2435  SCP-like extracellular  28.57 
 
 		 270 aa  45.8  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1805  SCP-like extracellular  26.58 
 
 		 222 aa  45.4  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000690986 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0703  SCP/PR1 domain-containing proteins-like  29.91 
 
 		 338 aa  45.1  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.501608  normal  0.0221352 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3523  Allergen V5/Tpx-1 related  28.31 
 
 		 188 aa  45.1  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2217  SCP-like extracellular  27.69 
 
 		 162 aa  45.1  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3556  Allergen V5/Tpx-1 related  29.41 
 
 		 168 aa  44.7  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4796  serine/threonine protein kinase  25.83 
 
 		 551 aa  44.7  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000010036  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5956  SCP-like extracellular  27.03 
 
 		 226 aa  45.1  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1156  Allergen V5/Tpx-1 related  28 
 
 		 337 aa  44.7  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.445034 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0081  Allergen V5/Tpx-1 family protein  25.86 
 
 		 321 aa  44.7  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0910  hypothetical protein  24.11 
 
 		 184 aa  43.9  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2976  Allergen V5/Tpx-1 related  28.79 
 
 		 334 aa  44.3  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0120131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1386  Allergen V5/Tpx-1 related  27.05 
 
 		 170 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0458  Allergen V5/Tpx-1 related  29.13 
 
 		 174 aa  43.9  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1293  Allergen V5/Tpx-1 related  28.79 
 
 		 335 aa  44.3  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.224237  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6973  hypothetical protein  26.72 
 
 		 171 aa  44.3  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4238  hypothetical protein  30.3 
 
 		 282 aa  43.9  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.569543  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8011  SCP-like extracellular  28.57 
 
 		 323 aa  43.9  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1407  hypothetical protein  25.42 
 
 		 275 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0309  hypothetical protein  27.12 
 
 		 139 aa  43.1  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1208  hypothetical protein  25.42 
 
 		 275 aa  43.1  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>