143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1597 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1597  Allergen V5/Tpx-1 family protein  100 
 
 
602 aa  1232    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3446  SCP-like extracellular  67.61 
 
 
589 aa  810    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.118078 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3153  Allergen V5/Tpx-1 family protein  37.5 
 
 
322 aa  140  7.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0892  SCP-like extracellular  39.22 
 
 
264 aa  125  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000243289 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1426  SCP-like extracellular  32.89 
 
 
328 aa  78.2  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1373  hypothetical protein  33.09 
 
 
541 aa  76.6  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3687  SCP-like extracellular  34.13 
 
 
167 aa  75.1  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00687212  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1407  hypothetical protein  32.28 
 
 
275 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1208  hypothetical protein  32.28 
 
 
275 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1186  hypothetical protein  32.28 
 
 
270 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1188  hypothetical protein  32.28 
 
 
263 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0215059  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1306  hypothetical protein  32.28 
 
 
275 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481179  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1448  hypothetical protein  32.28 
 
 
275 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1346  hypothetical protein  32.28 
 
 
275 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3998  hypothetical protein  32.28 
 
 
270 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0752047 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1384  hypothetical protein  32.28 
 
 
275 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2435  SCP-like extracellular  35.17 
 
 
270 aa  71.2  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3457  Allergen V5/Tpx-1 related  36.57 
 
 
338 aa  70.1  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4591  Allergen V5/Tpx-1 family protein  36.8 
 
 
213 aa  69.7  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.39255  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2270  SCP-like extracellular  39.2 
 
 
212 aa  69.7  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00083862  normal  0.0734842 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2817  SCP-like extracellular  36.51 
 
 
249 aa  69.3  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0300  Allergen V5/Tpx-1 related  32.31 
 
 
205 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.022059  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1210  SCP-like extracellular  31.5 
 
 
276 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0851  hypothetical protein  38.89 
 
 
287 aa  68.9  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.721637  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0167  SCP-like extracellular  36.8 
 
 
209 aa  68.2  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.119271  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4285  SCP-like extracellular  36.92 
 
 
296 aa  67.4  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0081  Allergen V5/Tpx-1 family protein  35.43 
 
 
321 aa  67.4  0.0000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5290  SCP-like extracellular  32.69 
 
 
211 aa  66.6  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0051  Allergen V5/Tpx-1 family protein  35.45 
 
 
300 aa  66.2  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000168583  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2195  Allergen V5/Tpx-1 family protein  38.79 
 
 
232 aa  65.9  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0225446  normal  0.313074 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4672  SCP-like extracellular  31.69 
 
 
458 aa  66.2  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.988125  normal  0.181044 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0508  spore coat assembly protein SafA  32.06 
 
 
203 aa  65.9  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8010  SCP-like extracellular  38.1 
 
 
232 aa  65.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2043  Allergen V5/Tpx-1 related  36.67 
 
 
196 aa  65.1  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0276422  normal  0.319002 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5005  SCP-like extracellular  33.58 
 
 
254 aa  65.1  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.342918  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1940  SCP-like extracellular  33.85 
 
 
242 aa  65.1  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0764504  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4362  Allergen V5/Tpx-1 related  38.24 
 
 
264 aa  64.7  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328838  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4392  SCP-like extracellular  34.43 
 
 
180 aa  64.3  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2188  SCP-like extracellular  38.05 
 
 
298 aa  64.3  0.000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2104  Allergen V5/Tpx-1-like  41.3 
 
 
288 aa  63.5  0.000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233408  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8056  hypothetical protein  34.65 
 
 
305 aa  63.5  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2237  SCP-like extracellular  32.54 
 
 
244 aa  63.2  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1016  hypothetical protein  31.25 
 
 
283 aa  63.5  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.768354  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0202  hypothetical protein  37.29 
 
 
156 aa  61.6  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00696457  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1835  Allergen V5/Tpx-1 family protein  37.29 
 
 
156 aa  61.6  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.780904  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05140  SCP-like extracellular  31.79 
 
 
258 aa  62  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3384  Allergen V5/Tpx-1-like  38.04 
 
 
294 aa  61.6  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2948  Allergen V5/Tpx-1 related  30.71 
 
 
280 aa  60.8  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0215583  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4242  Allergen V5/Tpx-1 family protein  30.56 
 
 
444 aa  60.5  0.00000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.152087 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2074  SCP-like extracellular  31.5 
 
 
222 aa  60.1  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3350  Allergen V5/Tpx-1 related  35.09 
 
 
293 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.688686  normal  0.0178942 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1289  Allergen V5/Tpx-1 family protein  30 
 
 
443 aa  60.1  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.323784  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1179  SCP-like extracellular  30.28 
 
 
465 aa  60.5  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.249096  hitchhiker  0.000057053 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0445  SCP-like extracellular  32.73 
 
 
500 aa  60.1  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000975734  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0728  SCP-like extracellular  36.45 
 
 
285 aa  60.1  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.416101  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1543  hypothetical protein  33.08 
 
 
235 aa  58.9  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1857  SCP-like extracellular  30.71 
 
 
214 aa  59.3  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.539147  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0779  copper amine oxidase-like protein  32.43 
 
 
450 aa  58.5  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247024  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1463  SCP-like extracellular  36.07 
 
 
312 aa  58.5  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00481671 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0219  SCP-like extracellular  34.75 
 
 
495 aa  58.5  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3137  SCP-like extracellular  37.62 
 
 
286 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1705  Allergen V5/Tpx-1 related  34.92 
 
 
245 aa  58.5  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000015674  normal  0.367363 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3579  hypothetical protein  33.63 
 
 
293 aa  57.8  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.38499  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1443  Allergen V5/Tpx-1 family protein  34.45 
 
 
178 aa  57.8  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.477266  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0470  Allergen V5/Tpx-1 related  32.81 
 
 
310 aa  57.8  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.765372 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0488  Allergen V5/Tpx-1 related  32.92 
 
 
299 aa  57.8  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2897  Allergen V5/Tpx-1 related  27.85 
 
 
176 aa  57.4  0.0000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.870748  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2649  hypothetical protein  38.14 
 
 
320 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00790253  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4717  SCP-like extracellular  33.63 
 
 
197 aa  56.6  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.771476  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0610  SCP-like extracellular  32.65 
 
 
352 aa  55.8  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2381  Allergen V5/Tpx-1 related  38.71 
 
 
310 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0357627 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1282  SCP-like extracellular  34.23 
 
 
317 aa  56.2  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1124  hypothetical protein  32.79 
 
 
255 aa  56.2  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.901449 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49660  hypothetical protein  35.24 
 
 
282 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0402  SCP-like extracellular  36.27 
 
 
160 aa  55.1  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3495  putative SCP-like extracellular protein  35.85 
 
 
176 aa  55.1  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.870948  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2861  Allergen V5/Tpx-1 family protein  33.96 
 
 
179 aa  54.7  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1399  SCP-like extracellular  26.24 
 
 
287 aa  54.7  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000144066  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1426  SCP-like extracellular protein  26.24 
 
 
287 aa  54.7  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000767316  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1200  hypothetical protein  33.96 
 
 
184 aa  54.3  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3523  Allergen V5/Tpx-1 related  34.97 
 
 
188 aa  54.3  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2638  Allergen V5/Tpx-1 family protein  33.96 
 
 
179 aa  54.3  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.450247  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4238  hypothetical protein  38.71 
 
 
282 aa  54.3  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.569543  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2441  SCP-like extracellular  30.07 
 
 
194 aa  53.9  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.938741  hitchhiker  0.0000000999881 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1374  Allergen V5/Tpx-1 family protein  33.64 
 
 
129 aa  53.1  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000198509  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0393  SCP-like extracellular  38 
 
 
168 aa  53.1  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0611399  normal  0.0668716 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0268  SCP-like extracellular  34.65 
 
 
347 aa  53.5  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0749  SCP-like extracellular  34.62 
 
 
237 aa  53.1  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0207585 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0683  SCP-like extracellular  29.14 
 
 
423 aa  52.4  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3563  hypothetical protein  33.33 
 
 
283 aa  52  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0309  hypothetical protein  35.29 
 
 
139 aa  52.4  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1156  Allergen V5/Tpx-1 related  29.38 
 
 
337 aa  52  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.445034 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0323  hypothetical protein  35.29 
 
 
139 aa  52.4  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.970328  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2358  SCP-like extracellular  35.48 
 
 
283 aa  52  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.678269  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18350  hypothetical protein  32.35 
 
 
301 aa  52.4  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3565  hypothetical protein  32.65 
 
 
206 aa  51.2  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.727767  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1160  hypothetical protein  41.94 
 
 
1657 aa  50.4  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0827  SCP-like extracellular  32.32 
 
 
157 aa  50.1  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.274249  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3169  Allergen V5/Tpx-1 family protein  30.63 
 
 
279 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.635999  normal  0.126682 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3697  hypothetical protein  31.03 
 
 
336 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>