85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2195 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2195  Allergen V5/Tpx-1 family protein  100 
 
 		 232 aa  463  1e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0225446  normal  0.313074 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1412  SCP-like extracellular  48.03 
 
 		 407 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.787858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3450  SCP-like extracellular  47.37 
 
 		 405 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.538197 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1373  hypothetical protein  36.84 
 
 		 541 aa  73.6  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2270  SCP-like extracellular  37.4 
 
 		 212 aa  73.6  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00083862  normal  0.0734842 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3687  SCP-like extracellular  35.88 
 
 		 167 aa  73.2  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00687212  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3446  SCP-like extracellular  36.25 
 
 		 589 aa  71.2  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.118078 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0445  SCP-like extracellular  29.11 
 
 		 500 aa  70.9  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000975734  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4591  Allergen V5/Tpx-1 family protein  33.53 
 
 		 213 aa  70.5  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.39255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4242  Allergen V5/Tpx-1 family protein  34.59 
 
 		 444 aa  68.9  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.152087 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1282  SCP-like extracellular  39.1 
 
 		 317 aa  67.4  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0167  SCP-like extracellular  30.05 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.119271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1597  Allergen V5/Tpx-1 family protein  37.6 
 
 		 602 aa  65.9  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4672  SCP-like extracellular  31.78 
 
 		 458 aa  64.3  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.988125  normal  0.181044 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1289  Allergen V5/Tpx-1 family protein  31.78 
 
 		 443 aa  62.8  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.323784  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0598  SCP-like extracellular  30.9 
 
 		 276 aa  59.3  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.845775  normal  0.23326 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1179  SCP-like extracellular  31.78 
 
 		 465 aa  59.7  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.249096  hitchhiker  0.000057053 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8056  hypothetical protein  28.09 
 
 		 305 aa  58.5  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1399  SCP-like extracellular  31.9 
 
 		 287 aa  57  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000144066  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1426  SCP-like extracellular protein  31.9 
 
 		 287 aa  57  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000767316  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2649  hypothetical protein  31.9 
 
 		 320 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00790253  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3384  Allergen V5/Tpx-1-like  34.48 
 
 		 294 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0851  hypothetical protein  32.14 
 
 		 287 aa  55.1  0.0000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.721637  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2074  SCP-like extracellular  29.66 
 
 		 222 aa  55.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1293  Allergen V5/Tpx-1 related  33.04 
 
 		 335 aa  54.7  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.224237  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4218  Allergen V5/Tpx-1 related  32.81 
 
 		 524 aa  54.7  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.245286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4392  SCP-like extracellular  29.73 
 
 		 180 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3457  Allergen V5/Tpx-1 related  33.33 
 
 		 338 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3350  Allergen V5/Tpx-1 related  34.51 
 
 		 293 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.688686  normal  0.0178942 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3169  Allergen V5/Tpx-1 family protein  41.46 
 
 		 279 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.635999  normal  0.126682 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2104  Allergen V5/Tpx-1-like  35.9 
 
 		 288 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233408  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0268  SCP-like extracellular  29.73 
 
 		 347 aa  53.5  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4285  SCP-like extracellular  31.9 
 
 		 296 aa  53.1  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1463  SCP-like extracellular  35.2 
 
 		 312 aa  52.8  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00481671 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1156  Allergen V5/Tpx-1 related  28.77 
 
 		 337 aa  52.8  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.445034 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2381  Allergen V5/Tpx-1 related  36.59 
 
 		 310 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0357627 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4238  hypothetical protein  43.37 
 
 		 282 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.569543  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1016  hypothetical protein  28.4 
 
 		 283 aa  52.4  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.768354  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2043  Allergen V5/Tpx-1 related  29.82 
 
 		 196 aa  52.4  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0276422  normal  0.319002 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3579  hypothetical protein  33.63 
 
 		 293 aa  52  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.38499  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0779  copper amine oxidase-like protein  28.57 
 
 		 450 aa  52  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247024  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0051  Allergen V5/Tpx-1 family protein  30.08 
 
 		 300 aa  51.2  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000168583  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1124  hypothetical protein  34.21 
 
 		 255 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.901449 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3495  putative SCP-like extracellular protein  27.59 
 
 		 176 aa  51.2  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.870948  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0728  SCP-like extracellular  31.25 
 
 		 285 aa  50.8  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.416101  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0508  spore coat assembly protein SafA  29.91 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49660  hypothetical protein  42.17 
 
 		 282 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0907  hypothetical protein  28.57 
 
 		 341 aa  50.1  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2358  SCP-like extracellular  37.35 
 
 		 283 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.678269  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2817  SCP-like extracellular  31.58 
 
 		 249 aa  49.7  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2580  Allergen V5/Tpx-1 family protein  26.61 
 
 		 199 aa  49.3  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.632979 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4362  Allergen V5/Tpx-1 related  33.02 
 
 		 264 aa  49.3  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2861  Allergen V5/Tpx-1 family protein  28.44 
 
 		 179 aa  49.3  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2638  Allergen V5/Tpx-1 family protein  28.44 
 
 		 179 aa  48.9  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.450247  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3563  hypothetical protein  37.35 
 
 		 283 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1374  Allergen V5/Tpx-1 family protein  32.46 
 
 		 129 aa  48.9  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000198509  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8010  SCP-like extracellular  29.32 
 
 		 232 aa  48.5  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1200  hypothetical protein  28.44 
 
 		 184 aa  48.5  0.00008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2211  SCP-like extracellular protein  39.29 
 
 		 283 aa  48.5  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2976  Allergen V5/Tpx-1 related  32.23 
 
 		 334 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0120131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5290  SCP-like extracellular  25.9 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4796  serine/threonine protein kinase  27.78 
 
 		 551 aa  48.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000010036  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3137  SCP-like extracellular  33.05 
 
 		 286 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18350  hypothetical protein  38.75 
 
 		 301 aa  47.4  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1399  Allergen V5/Tpx-1 family protein  35.35 
 
 		 156 aa  47  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.235297 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2482  SCP-like extracellular  37.35 
 
 		 283 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.897986  normal  0.230524 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0300  Allergen V5/Tpx-1 related  31.58 
 
 		 205 aa  47.4  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.022059  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38670  uncharacterized protein with SCP/PR1 domains  27.83 
 
 		 260 aa  47  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2237  SCP-like extracellular  27.83 
 
 		 244 aa  47  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4717  SCP-like extracellular  34.75 
 
 		 197 aa  46.6  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.771476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0219  SCP-like extracellular  29.46 
 
 		 495 aa  46.2  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0081  Allergen V5/Tpx-1 family protein  26.61 
 
 		 321 aa  45.8  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4411  SCP-like extracellular  28.83 
 
 		 300 aa  46.2  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05140  SCP-like extracellular  27.22 
 
 		 258 aa  45.8  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1426  SCP-like extracellular  26.36 
 
 		 328 aa  45.4  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6555  SCP-like extracellular  27.21 
 
 		 337 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1210  SCP-like extracellular  25.47 
 
 		 276 aa  44.3  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3998  hypothetical protein  25.27 
 
 		 270 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0752047 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1186  hypothetical protein  25.27 
 
 		 270 aa  42.7  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3153  Allergen V5/Tpx-1 family protein  27.46 
 
 		 322 aa  43.1  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2435  SCP-like extracellular  29.57 
 
 		 270 aa  42.7  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0369  SCP-like extracellular  30.83 
 
 		 570 aa  42.7  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.879788 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2424  SCP-like extracellular  25.37 
 
 		 200 aa  42.4  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.572617  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1857  SCP-like extracellular  31.9 
 
 		 214 aa  42.4  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.539147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0934  Allergen V5/Tpx-1 related  50 
 
 		 353 aa  42  0.009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.876847  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>