49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1412 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1412  SCP-like extracellular  100 
 
 		 407 aa  794    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.787858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3450  SCP-like extracellular  94.84 
 
 		 405 aa  661    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.538197 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2195  Allergen V5/Tpx-1 family protein  46.11 
 
 		 232 aa  120  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0225446  normal  0.313074 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4242  Allergen V5/Tpx-1 family protein  31.25 
 
 		 444 aa  70.5  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.152087 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4591  Allergen V5/Tpx-1 family protein  31.29 
 
 		 213 aa  64.7  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.39255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4672  SCP-like extracellular  31.35 
 
 		 458 aa  62.4  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.988125  normal  0.181044 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2270  SCP-like extracellular  37.82 
 
 		 212 aa  62.4  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00083862  normal  0.0734842 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1289  Allergen V5/Tpx-1 family protein  35.54 
 
 		 443 aa  60.8  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.323784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0851  hypothetical protein  33.96 
 
 		 287 aa  59.7  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.721637  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1399  Allergen V5/Tpx-1 family protein  40.43 
 
 		 156 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.235297 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4285  SCP-like extracellular  35.77 
 
 		 296 aa  57.8  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1373  hypothetical protein  34.26 
 
 		 541 aa  55.8  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0598  SCP-like extracellular  47.69 
 
 		 276 aa  55.8  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.845775  normal  0.23326 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1124  hypothetical protein  34.48 
 
 		 255 aa  54.7  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.901449 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1282  SCP-like extracellular  39.81 
 
 		 317 aa  54.3  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0268  SCP-like extracellular  34.31 
 
 		 347 aa  53.9  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2074  SCP-like extracellular  38.18 
 
 		 222 aa  53.5  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0167  SCP-like extracellular  29.67 
 
 		 209 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.119271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2435  SCP-like extracellular  35.54 
 
 		 270 aa  52.4  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8056  hypothetical protein  29.25 
 
 		 305 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2817  SCP-like extracellular  35.51 
 
 		 249 aa  51.2  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3446  SCP-like extracellular  34.32 
 
 		 589 aa  50.8  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.118078 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4411  SCP-like extracellular  33.33 
 
 		 300 aa  50.8  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5956  SCP-like extracellular  34.31 
 
 		 226 aa  50.1  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0300  Allergen V5/Tpx-1 related  32.73 
 
 		 205 aa  50.1  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.022059  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4392  SCP-like extracellular  36.54 
 
 		 180 aa  49.3  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1463  SCP-like extracellular  31.21 
 
 		 312 aa  49.7  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00481671 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1179  SCP-like extracellular  31.4 
 
 		 465 aa  49.7  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.249096  hitchhiker  0.000057053 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2043  Allergen V5/Tpx-1 related  29.57 
 
 		 196 aa  49.3  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0276422  normal  0.319002 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0219  SCP-like extracellular  33.96 
 
 		 495 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5290  SCP-like extracellular  31.62 
 
 		 211 aa  48.1  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38670  uncharacterized protein with SCP/PR1 domains  34.45 
 
 		 260 aa  47.8  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0393  SCP-like extracellular  35.65 
 
 		 168 aa  47.8  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0611399  normal  0.0668716 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2580  Allergen V5/Tpx-1 family protein  35.48 
 
 		 199 aa  47.4  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.632979 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8010  SCP-like extracellular  34.21 
 
 		 232 aa  47.4  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3565  hypothetical protein  33.33 
 
 		 206 aa  47  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.727767  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0728  SCP-like extracellular  30.1 
 
 		 285 aa  46.6  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.416101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0683  SCP-like extracellular  26.87 
 
 		 423 aa  46.6  0.0008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4717  SCP-like extracellular  34.55 
 
 		 197 aa  46.2  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.771476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0445  SCP-like extracellular  26.36 
 
 		 500 aa  45.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000975734  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5005  SCP-like extracellular  29.31 
 
 		 254 aa  44.7  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.342918  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0140  Allergen V5/Tpx-1 family protein  25.37 
 
 		 372 aa  45.1  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.697458  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5104  Allergen V5/Tpx-1 related  31.03 
 
 		 353 aa  44.3  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.217216  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4106  hypothetical protein  35.16 
 
 		 168 aa  43.5  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.123266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05140  SCP-like extracellular  25.19 
 
 		 258 aa  43.5  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0827  SCP-like extracellular  30.49 
 
 		 157 aa  43.1  0.009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.274249  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1235  SCP-like extracellular  26.12 
 
 		 399 aa  43.1  0.009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0051  Allergen V5/Tpx-1 family protein  29.25 
 
 		 300 aa  43.1  0.009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000168583  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1374  Allergen V5/Tpx-1 family protein  28.3 
 
 		 129 aa  43.1  0.01  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000198509  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>