21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5104 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5104  Allergen V5/Tpx-1 related  100 
 
 		 353 aa  704    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.217216  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4607  Allergen V5/Tpx-1 related  38.44 
 
 		 336 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0398633  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3716  hypothetical protein  28.61 
 
 		 310 aa  94.4  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.519725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4490  allergen V5/Tpx-1-like protein  29.43 
 
 		 352 aa  90.9  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4336  Allergen V5/Tpx-1 family protein  28.45 
 
 		 352 aa  86.3  7e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.253754  normal  0.853513 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3675  Allergen V5/Tpx-1 family protein  29.02 
 
 		 325 aa  85.5  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.119335  normal  0.615826 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5207  SCP-like extracellular  28.9 
 
 		 327 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1542  SCP-like extracellular  28.9 
 
 		 327 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.312767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3673  Allergen V5/Tpx-1 family protein  28.3 
 
 		 325 aa  83.6  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0308491  normal  0.595452 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2224  Allergen V5/Tpx-1 family protein  29.38 
 
 		 358 aa  82  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.449099  hitchhiker  0.00516568 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1485  periplasmic protein  25.25 
 
 		 459 aa  78.2  0.0000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6555  SCP-like extracellular  29.94 
 
 		 337 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3718  Allergen V5/Tpx-1 family protein  28.95 
 
 		 319 aa  77  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5022  SCP-like extracellular  25 
 
 		 341 aa  67.8  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0390932  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5427  SCP-like extracellular  24.68 
 
 		 341 aa  66.2  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1004  Allergen V5/Tpx-1 related  29.47 
 
 		 382 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5562  SCP-like extracellular  28.25 
 
 		 340 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.249089 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2049  hypothetical protein  22.11 
 
 		 466 aa  62  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.670502  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6363  SCP-like extracellular domain-containing protein  26.18 
 
 		 327 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.18267  normal  0.482727 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2680  SCP-like extracellular  25.99 
 
 		 417 aa  48.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000473437  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1632  putative periplasmic protein  24.42 
 
 		 456 aa  43.5  0.005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000262022  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>