64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3450 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3450  SCP-like extracellular  100 
 
 		 405 aa  786    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.538197 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1412  SCP-like extracellular  94.84 
 
 		 407 aa  663    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.787858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2195  Allergen V5/Tpx-1 family protein  45.56 
 
 		 232 aa  120  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0225446  normal  0.313074 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4242  Allergen V5/Tpx-1 family protein  31.61 
 
 		 444 aa  72.4  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.152087 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4591  Allergen V5/Tpx-1 family protein  32.37 
 
 		 213 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.39255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2270  SCP-like extracellular  37.61 
 
 		 212 aa  67.8  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00083862  normal  0.0734842 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0851  hypothetical protein  36.89 
 
 		 287 aa  67.4  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.721637  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4672  SCP-like extracellular  32.35 
 
 		 458 aa  66.6  0.0000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.988125  normal  0.181044 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4285  SCP-like extracellular  38.21 
 
 		 296 aa  64.3  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1289  Allergen V5/Tpx-1 family protein  36.79 
 
 		 443 aa  64.3  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.323784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0300  Allergen V5/Tpx-1 related  36.36 
 
 		 205 aa  62.4  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.022059  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1282  SCP-like extracellular  41.35 
 
 		 317 aa  62  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2435  SCP-like extracellular  37.82 
 
 		 270 aa  62  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1373  hypothetical protein  34.26 
 
 		 541 aa  60.8  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0598  SCP-like extracellular  35.04 
 
 		 276 aa  60.5  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.845775  normal  0.23326 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0268  SCP-like extracellular  35.29 
 
 		 347 aa  60.1  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2074  SCP-like extracellular  39.09 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8056  hypothetical protein  29.52 
 
 		 305 aa  59.3  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1124  hypothetical protein  33.33 
 
 		 255 aa  58.9  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.901449 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0167  SCP-like extracellular  31.25 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.119271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1399  Allergen V5/Tpx-1 family protein  40.43 
 
 		 156 aa  57  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.235297 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2817  SCP-like extracellular  36.45 
 
 		 249 aa  57  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3565  hypothetical protein  35 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.727767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3446  SCP-like extracellular  34.52 
 
 		 589 aa  56.6  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.118078 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4392  SCP-like extracellular  36.54 
 
 		 180 aa  56.6  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1179  SCP-like extracellular  30.09 
 
 		 465 aa  55.8  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.249096  hitchhiker  0.000057053 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38670  uncharacterized protein with SCP/PR1 domains  36.13 
 
 		 260 aa  55.8  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5956  SCP-like extracellular  34.31 
 
 		 226 aa  56.2  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2043  Allergen V5/Tpx-1 related  31.3 
 
 		 196 aa  55.8  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0276422  normal  0.319002 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4411  SCP-like extracellular  34.92 
 
 		 300 aa  55.1  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1463  SCP-like extracellular  34.19 
 
 		 312 aa  55.1  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00481671 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2346  SCP-like extracellular  29.95 
 
 		 554 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.25929  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0728  SCP-like extracellular  31.07 
 
 		 285 aa  54.7  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.416101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2258  SCP-like extracellular protein  30.57 
 
 		 553 aa  53.9  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.266463  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0828  SCP-like extracellular  36.11 
 
 		 274 aa  53.9  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000017875  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8010  SCP-like extracellular  38.32 
 
 		 232 aa  53.1  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0219  SCP-like extracellular  33.96 
 
 		 495 aa  52  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05140  SCP-like extracellular  26.72 
 
 		 258 aa  51.6  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5005  SCP-like extracellular  30.17 
 
 		 254 aa  51.2  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.342918  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5290  SCP-like extracellular  29.82 
 
 		 211 aa  51.6  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1374  Allergen V5/Tpx-1 family protein  32.71 
 
 		 129 aa  50.8  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000198509  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0393  SCP-like extracellular  36.28 
 
 		 168 aa  50.1  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0611399  normal  0.0668716 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0508  spore coat assembly protein SafA  29.46 
 
 		 203 aa  50.1  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0051  Allergen V5/Tpx-1 family protein  30.77 
 
 		 300 aa  50.1  0.00007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000168583  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0445  SCP-like extracellular  27.13 
 
 		 500 aa  49.7  0.00009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000975734  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1604  Allergen V5/Tpx-1 related  28.93 
 
 		 552 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0126507  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3687  SCP-like extracellular  28.46 
 
 		 167 aa  49.3  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00687212  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0827  SCP-like extracellular  30.49 
 
 		 157 aa  49.3  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.274249  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1156  Allergen V5/Tpx-1 related  28.93 
 
 		 337 aa  48.9  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.445034 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1597  Allergen V5/Tpx-1 family protein  34.86 
 
 		 602 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0683  SCP-like extracellular  26.87 
 
 		 423 aa  48.9  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0369  SCP-like extracellular  29.05 
 
 		 570 aa  48.5  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.879788 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2580  Allergen V5/Tpx-1 family protein  30.77 
 
 		 199 aa  48.1  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.632979 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4717  SCP-like extracellular  33.64 
 
 		 197 aa  47.8  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.771476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4218  Allergen V5/Tpx-1 related  32.33 
 
 		 524 aa  45.8  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.245286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0140  Allergen V5/Tpx-1 family protein  25.37 
 
 		 372 aa  45.8  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.697458  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1235  SCP-like extracellular  28.36 
 
 		 399 aa  45.8  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3457  Allergen V5/Tpx-1 related  32.69 
 
 		 338 aa  44.3  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0703  SCP/PR1 domain-containing proteins-like  34.57 
 
 		 338 aa  44.3  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.501608  normal  0.0221352 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1543  hypothetical protein  28.57 
 
 		 235 aa  44.3  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2711  SCP-like extracellular  27.73 
 
 		 220 aa  44.3  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000599492  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2217  SCP-like extracellular  32.17 
 
 		 162 aa  44.3  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0934  Allergen V5/Tpx-1 related  35.09 
 
 		 353 aa  43.9  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.876847  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0081  Allergen V5/Tpx-1 family protein  28.18 
 
 		 321 aa  42.7  0.01  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>