26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_4232 on replicon NC_007801
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007801  Jann_4232  hypothetical protein  100 
 
 		 152 aa  306  4e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.281804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3495  putative SCP-like extracellular protein  32.2 
 
 		 176 aa  75.9  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.870948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2897  Allergen V5/Tpx-1 related  29.6 
 
 		 176 aa  71.2  0.000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.870748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1200  hypothetical protein  27.97 
 
 		 184 aa  68.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2861  Allergen V5/Tpx-1 family protein  27.97 
 
 		 179 aa  69.3  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2638  Allergen V5/Tpx-1 family protein  26.27 
 
 		 179 aa  64.7  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.450247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2580  Allergen V5/Tpx-1 family protein  27.62 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.632979 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0268  SCP-like extracellular  27.12 
 
 		 347 aa  50.8  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3687  SCP-like extracellular  26.32 
 
 		 167 aa  50.4  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00687212  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49660  hypothetical protein  34.02 
 
 		 282 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2104  Allergen V5/Tpx-1-like  30.19 
 
 		 288 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233408  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4238  hypothetical protein  34.57 
 
 		 282 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.569543  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2074  SCP-like extracellular  23.08 
 
 		 222 aa  45.1  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2435  SCP-like extracellular  25 
 
 		 270 aa  45.1  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18350  hypothetical protein  29.67 
 
 		 301 aa  43.9  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2482  SCP-like extracellular  28.03 
 
 		 283 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.897986  normal  0.230524 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4392  SCP-like extracellular  24.14 
 
 		 180 aa  43.5  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1373  hypothetical protein  24.37 
 
 		 541 aa  43.5  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1597  Allergen V5/Tpx-1 family protein  29.55 
 
 		 602 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0393  SCP-like extracellular  28.87 
 
 		 168 aa  42.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0611399  normal  0.0668716 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0610  SCP-like extracellular  28.26 
 
 		 352 aa  42.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1443  Allergen V5/Tpx-1 family protein  25.22 
 
 		 178 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.477266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3137  SCP-like extracellular  30.11 
 
 		 286 aa  42  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0508  spore coat assembly protein SafA  23.89 
 
 		 203 aa  40.8  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3169  Allergen V5/Tpx-1 family protein  30.77 
 
 		 279 aa  40.8  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.635999  normal  0.126682 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2270  SCP-like extracellular  23.21 
 
 		 212 aa  40.4  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00083862  normal  0.0734842 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>