76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_5299 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_5299  SCP-like extracellular  100 
 
 		 168 aa  338  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4832  SCP-like extracellular  99.3 
 
 		 142 aa  284  5e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.627735 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5377  SCP-like extracellular  94.05 
 
 		 168 aa  273  7e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.132089  normal  0.43557 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4345  SCP-like extracellular  75 
 
 		 159 aa  198  3e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3058  SCP-like extracellular  65.99 
 
 		 169 aa  191  5e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0142297  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4557  SCP-like extracellular  68.66 
 
 		 169 aa  190  7e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.313497  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4004  Allergen V5/Tpx-1 related  51.08 
 
 		 169 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.555051 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4689  SCP-like extracellular  49.7 
 
 		 171 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6973  hypothetical protein  50.66 
 
 		 171 aa  130  6.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2756  hypothetical protein  48.18 
 
 		 169 aa  130  6.999999999999999e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0911231  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3556  Allergen V5/Tpx-1 related  46.67 
 
 		 168 aa  127  5.0000000000000004e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1406  Allergen V5/Tpx-1 related  50 
 
 		 170 aa  127  6e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1386  Allergen V5/Tpx-1 related  49.28 
 
 		 170 aa  124  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2095  SCP-like extracellular  51.08 
 
 		 180 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.122143 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3221  SCP-like extracellular  42.5 
 
 		 169 aa  99.4  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1215  SCP-like extracellular  37.89 
 
 		 162 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1020  SCP-like extracellular  37.27 
 
 		 162 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4389  SCP-like extracellular  39.13 
 
 		 182 aa  75.5  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.311536  normal  0.985531 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2796  SCP-like extracellular protein  36 
 
 		 164 aa  75.1  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.845381  normal  0.95734 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1086  SCP-like extracellular  37.27 
 
 		 193 aa  75.1  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.162879 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4125  SCP-like extracellular  41.22 
 
 		 161 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1293  Allergen V5/Tpx-1 related  34.68 
 
 		 335 aa  63.5  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.224237  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6058  hypothetical protein  35.65 
 
 		 208 aa  62  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4591  Allergen V5/Tpx-1 family protein  32.23 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.39255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3184  SCP-like extracellular  31.34 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.14634  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4796  serine/threonine protein kinase  27.5 
 
 		 551 aa  57.8  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000010036  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3620  Allergen V5/Tpx-1 related  34.48 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.832332  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1282  SCP-like extracellular  36.36 
 
 		 317 aa  56.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1200  hypothetical protein  27.43 
 
 		 184 aa  55.1  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4362  Allergen V5/Tpx-1 related  32.67 
 
 		 264 aa  54.7  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0268  SCP-like extracellular  27.87 
 
 		 347 aa  54.3  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2861  Allergen V5/Tpx-1 family protein  28.03 
 
 		 179 aa  54.3  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2638  Allergen V5/Tpx-1 family protein  28.66 
 
 		 179 aa  53.9  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.450247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3457  Allergen V5/Tpx-1 related  32.14 
 
 		 338 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2897  Allergen V5/Tpx-1 related  27.5 
 
 		 176 aa  52  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.870748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3565  hypothetical protein  33.96 
 
 		 206 aa  51.2  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.727767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0167  SCP-like extracellular  30.58 
 
 		 209 aa  50.8  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.119271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2741  Allergen V5/Tpx-1 related  29.31 
 
 		 246 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.446296  normal  0.680161 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3687  SCP-like extracellular  26.61 
 
 		 167 aa  49.7  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00687212  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1705  Allergen V5/Tpx-1 related  28.95 
 
 		 245 aa  48.1  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000015674  normal  0.367363 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1373  hypothetical protein  28.7 
 
 		 541 aa  48.1  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2381  Allergen V5/Tpx-1 related  31.01 
 
 		 310 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0357627 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2580  Allergen V5/Tpx-1 family protein  29.76 
 
 		 199 aa  48.1  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.632979 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2270  SCP-like extracellular  30.58 
 
 		 212 aa  48.1  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00083862  normal  0.0734842 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2211  SCP-like extracellular protein  31.58 
 
 		 283 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0934  Allergen V5/Tpx-1 related  34.48 
 
 		 353 aa  47  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.876847  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2649  hypothetical protein  28.68 
 
 		 320 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00790253  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3563  hypothetical protein  31.58 
 
 		 283 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2358  SCP-like extracellular  31.58 
 
 		 283 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.678269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0051  Allergen V5/Tpx-1 family protein  39.29 
 
 		 300 aa  46.6  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000168583  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0224  SCP-like extracellular  27.16 
 
 		 165 aa  45.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2817  SCP-like extracellular  27.82 
 
 		 249 aa  44.3  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0300  Allergen V5/Tpx-1 related  29.69 
 
 		 205 aa  44.7  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.022059  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3384  Allergen V5/Tpx-1-like  30.77 
 
 		 294 aa  43.9  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3169  Allergen V5/Tpx-1 family protein  29.91 
 
 		 279 aa  43.9  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.635999  normal  0.126682 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1940  SCP-like extracellular  27.83 
 
 		 242 aa  43.5  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0764504  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1543  hypothetical protein  28.87 
 
 		 235 aa  43.1  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2789  Allergen V5/Tpx-1 related  31.62 
 
 		 203 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0921233  normal  0.40167 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3495  putative SCP-like extracellular protein  30.67 
 
 		 176 aa  42.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.870948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2104  Allergen V5/Tpx-1-like  30.23 
 
 		 288 aa  42.4  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233408  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0508  spore coat assembly protein SafA  26.73 
 
 		 203 aa  42.4  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8056  hypothetical protein  29.23 
 
 		 305 aa  42  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49660  hypothetical protein  31.43 
 
 		 282 aa  42  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1124  hypothetical protein  29.63 
 
 		 255 aa  42  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.901449 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1426  SCP-like extracellular  25.44 
 
 		 328 aa  42  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2482  SCP-like extracellular  29.87 
 
 		 283 aa  42  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.897986  normal  0.230524 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2435  SCP-like extracellular  31.58 
 
 		 270 aa  41.6  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0195  SCP-like extracellular  25.64 
 
 		 165 aa  41.2  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0309  hypothetical protein  27.35 
 
 		 139 aa  41.2  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0323  hypothetical protein  27.35 
 
 		 139 aa  41.2  0.007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.970328  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18350  hypothetical protein  30.56 
 
 		 301 aa  41.2  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0219  SCP-like extracellular  31 
 
 		 495 aa  41.2  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0402  SCP-like extracellular  26.5 
 
 		 160 aa  41.2  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2074  SCP-like extracellular  30.68 
 
 		 222 aa  40.8  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3350  Allergen V5/Tpx-1 related  30.48 
 
 		 293 aa  40.8  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.688686  normal  0.0178942 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3153  Allergen V5/Tpx-1 family protein  33.33 
 
 		 322 aa  40.8  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>