63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4557 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4557  SCP-like extracellular  100 
 
 		 169 aa  338  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.313497  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3058  SCP-like extracellular  88.27 
 
 		 169 aa  280  7.000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0142297  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5377  SCP-like extracellular  66.67 
 
 		 168 aa  181  6e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.132089  normal  0.43557 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4832  SCP-like extracellular  67.63 
 
 		 142 aa  176  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.627735 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5299  SCP-like extracellular  65.31 
 
 		 168 aa  176  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4345  SCP-like extracellular  67.16 
 
 		 159 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4689  SCP-like extracellular  47.4 
 
 		 171 aa  125  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1406  Allergen V5/Tpx-1 related  48.3 
 
 		 170 aa  124  6e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2756  hypothetical protein  45.03 
 
 		 169 aa  122  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0911231  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1386  Allergen V5/Tpx-1 related  48.55 
 
 		 170 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3556  Allergen V5/Tpx-1 related  47.1 
 
 		 168 aa  119  9.999999999999999e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6973  hypothetical protein  48.55 
 
 		 171 aa  117  7e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4004  Allergen V5/Tpx-1 related  44.22 
 
 		 169 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.555051 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2095  SCP-like extracellular  45.83 
 
 		 180 aa  113  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.122143 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3221  SCP-like extracellular  44.81 
 
 		 169 aa  99.4  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1215  SCP-like extracellular  34.84 
 
 		 162 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1086  SCP-like extracellular  35.48 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.162879 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4125  SCP-like extracellular  39.39 
 
 		 161 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4389  SCP-like extracellular  35.46 
 
 		 182 aa  67.4  0.00000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.311536  normal  0.985531 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1020  SCP-like extracellular  34.19 
 
 		 162 aa  67.8  0.00000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2796  SCP-like extracellular protein  35.38 
 
 		 164 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.845381  normal  0.95734 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1293  Allergen V5/Tpx-1 related  36.07 
 
 		 335 aa  62  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.224237  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3620  Allergen V5/Tpx-1 related  33.63 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.832332  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0268  SCP-like extracellular  31.03 
 
 		 347 aa  57.4  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3565  hypothetical protein  34.35 
 
 		 206 aa  57  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.727767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1282  SCP-like extracellular  34.71 
 
 		 317 aa  56.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4362  Allergen V5/Tpx-1 related  33.94 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4591  Allergen V5/Tpx-1 family protein  31.71 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.39255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4796  serine/threonine protein kinase  27.78 
 
 		 551 aa  52.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000010036  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0300  Allergen V5/Tpx-1 related  25.85 
 
 		 205 aa  51.6  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.022059  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0051  Allergen V5/Tpx-1 family protein  29.91 
 
 		 300 aa  51.2  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000168583  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6058  hypothetical protein  29.23 
 
 		 208 aa  51.2  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2211  SCP-like extracellular protein  43.4 
 
 		 283 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3563  hypothetical protein  43.4 
 
 		 283 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3184  SCP-like extracellular  27.91 
 
 		 218 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.14634  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2358  SCP-like extracellular  43.4 
 
 		 283 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.678269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2897  Allergen V5/Tpx-1 related  26.95 
 
 		 176 aa  50.1  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.870748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3687  SCP-like extracellular  28.7 
 
 		 167 aa  48.5  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00687212  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2435  SCP-like extracellular  33.91 
 
 		 270 aa  48.5  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3457  Allergen V5/Tpx-1 related  31.54 
 
 		 338 aa  47  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2381  Allergen V5/Tpx-1 related  32.03 
 
 		 310 aa  47  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0357627 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1557  Allergen V5/Tpx-1 related  32.43 
 
 		 331 aa  45.8  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal  0.411468 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2741  Allergen V5/Tpx-1 related  27.83 
 
 		 246 aa  45.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.446296  normal  0.680161 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1705  Allergen V5/Tpx-1 related  28.21 
 
 		 245 aa  45.4  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000015674  normal  0.367363 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2482  SCP-like extracellular  41.51 
 
 		 283 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.897986  normal  0.230524 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2270  SCP-like extracellular  31.9 
 
 		 212 aa  45.4  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00083862  normal  0.0734842 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1373  hypothetical protein  29.57 
 
 		 541 aa  45.4  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2649  hypothetical protein  29.23 
 
 		 320 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00790253  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3495  putative SCP-like extracellular protein  31.93 
 
 		 176 aa  44.7  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.870948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0219  SCP-like extracellular  32.43 
 
 		 495 aa  44.7  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3384  Allergen V5/Tpx-1-like  39.22 
 
 		 294 aa  43.9  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0508  spore coat assembly protein SafA  28.18 
 
 		 203 aa  43.5  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3137  SCP-like extracellular  33.98 
 
 		 286 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2104  Allergen V5/Tpx-1-like  30.95 
 
 		 288 aa  43.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233408  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3350  Allergen V5/Tpx-1 related  39.22 
 
 		 293 aa  43.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.688686  normal  0.0178942 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3798  SCP-like extracellular  27.21 
 
 		 321 aa  42.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.891607 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0934  Allergen V5/Tpx-1 related  32.8 
 
 		 353 aa  42.4  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.876847  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0167  SCP-like extracellular  27.64 
 
 		 209 aa  42  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.119271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2789  Allergen V5/Tpx-1 related  32.48 
 
 		 203 aa  42  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0921233  normal  0.40167 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3579  hypothetical protein  39.22 
 
 		 293 aa  42  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.38499  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4238  hypothetical protein  34.55 
 
 		 282 aa  40.8  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.569543  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1426  SCP-like extracellular  25.64 
 
 		 328 aa  40.8  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2074  SCP-like extracellular  28.33 
 
 		 222 aa  40.8  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>