127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1260 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_1260  Allergen V5/Tpx-1 family protein  100 
 
 
164 aa  331  3e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.560977  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0749  SCP-like extracellular  34.75 
 
 
237 aa  79  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0207585 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3066  SCP-like extracellular  32.08 
 
 
176 aa  73.6  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3153  Allergen V5/Tpx-1 family protein  32.65 
 
 
322 aa  66.2  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0827  hypothetical protein  33.87 
 
 
317 aa  65.1  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.722064  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8010  SCP-like extracellular  31.29 
 
 
232 aa  65.1  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0816  hypothetical protein  33.87 
 
 
317 aa  64.7  0.0000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2237  SCP-like extracellular  32 
 
 
244 aa  62  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8056  hypothetical protein  34.13 
 
 
305 aa  59.7  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2853  SCP-like extracellular  31.72 
 
 
179 aa  59.3  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5290  SCP-like extracellular  49.18 
 
 
211 aa  59.7  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1426  SCP-like extracellular  31.75 
 
 
328 aa  59.3  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2817  SCP-like extracellular  31.48 
 
 
249 aa  58.9  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3798  SCP-like extracellular  30.71 
 
 
321 aa  57.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.891607 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2043  Allergen V5/Tpx-1 related  32.11 
 
 
196 aa  55.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0276422  normal  0.319002 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0910  hypothetical protein  33.06 
 
 
184 aa  55.5  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0508  spore coat assembly protein SafA  32 
 
 
203 aa  55.5  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1705  Allergen V5/Tpx-1 related  29.37 
 
 
245 aa  55.1  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000015674  normal  0.367363 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4285  SCP-like extracellular  45.76 
 
 
296 aa  55.1  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3446  SCP-like extracellular  33.33 
 
 
589 aa  55.1  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.118078 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0940  hypothetical protein  32.23 
 
 
184 aa  54.7  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2441  SCP-like extracellular  51.16 
 
 
194 aa  53.9  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.938741  hitchhiker  0.0000000999881 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3565  hypothetical protein  33.57 
 
 
206 aa  53.5  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.727767  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0851  hypothetical protein  32.79 
 
 
287 aa  52.4  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.721637  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1373  hypothetical protein  32.48 
 
 
541 aa  53.1  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3865  SCP-like extracellular  29.22 
 
 
207 aa  52.4  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.348195  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1399  SCP-like extracellular  28.81 
 
 
287 aa  52.4  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000144066  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1426  SCP-like extracellular protein  28.81 
 
 
287 aa  52.4  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000767316  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1016  hypothetical protein  28.78 
 
 
283 aa  52.4  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.768354  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38670  uncharacterized protein with SCP/PR1 domains  29.5 
 
 
260 aa  52  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1940  SCP-like extracellular  27.64 
 
 
242 aa  52  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0764504  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4411  SCP-like extracellular  43.64 
 
 
300 aa  51.2  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0943  Allergen V5/Tpx-1 family protein  51.06 
 
 
242 aa  51.2  0.000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0081  Allergen V5/Tpx-1 family protein  31.82 
 
 
321 aa  51.2  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2948  Allergen V5/Tpx-1 related  31.15 
 
 
280 aa  50.8  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0215583  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3687  SCP-like extracellular  31.51 
 
 
167 aa  50.8  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00687212  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0892  SCP-like extracellular  33.06 
 
 
264 aa  50.4  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000243289 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1188  hypothetical protein  27.78 
 
 
263 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0215059  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0300  Allergen V5/Tpx-1 related  28.8 
 
 
205 aa  50.4  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.022059  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3221  SCP-like extracellular  33.1 
 
 
169 aa  50.1  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3998  hypothetical protein  27.78 
 
 
270 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0752047 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0992  SCP-like extracellular  28 
 
 
336 aa  50.4  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1407  hypothetical protein  27.78 
 
 
275 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1208  hypothetical protein  27.78 
 
 
275 aa  49.7  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1186  hypothetical protein  27.78 
 
 
270 aa  49.3  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1306  hypothetical protein  27.78 
 
 
275 aa  49.7  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481179  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1463  SCP-like extracellular  31.11 
 
 
312 aa  49.7  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00481671 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1146  SCP-like extracellular  29.13 
 
 
351 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.582279 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0140  Allergen V5/Tpx-1 family protein  59.46 
 
 
372 aa  49.7  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.697458  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1210  SCP-like extracellular  27.78 
 
 
276 aa  49.3  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1448  hypothetical protein  27.78 
 
 
275 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1346  hypothetical protein  27.78 
 
 
275 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1384  hypothetical protein  27.78 
 
 
275 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1289  Allergen V5/Tpx-1 family protein  29.75 
 
 
443 aa  48.9  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.323784  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0728  SCP-like extracellular  35.34 
 
 
285 aa  48.9  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.416101  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0683  SCP-like extracellular  59.46 
 
 
423 aa  48.9  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6058  hypothetical protein  34.43 
 
 
208 aa  48.1  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1200  hypothetical protein  26.53 
 
 
344 aa  48.1  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1583  SCP-like extracellular  40 
 
 
275 aa  48.1  0.00005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3350  Allergen V5/Tpx-1 related  32.46 
 
 
293 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.688686  normal  0.0178942 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3523  Allergen V5/Tpx-1 related  32.33 
 
 
188 aa  47.8  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1235  SCP-like extracellular  56.76 
 
 
399 aa  47.8  0.00006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3184  SCP-like extracellular  35.71 
 
 
218 aa  48.1  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.14634  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4039  hypothetical protein  26.53 
 
 
344 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.784658  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1117  SCP-like extracellular  42.86 
 
 
351 aa  47.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5956  SCP-like extracellular  45.61 
 
 
226 aa  47.8  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1282  SCP-like extracellular  37.4 
 
 
317 aa  47.4  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0958  copper amine oxidase domain protein  31.58 
 
 
423 aa  47.4  0.00008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.990668  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1913  Allergen V5/Tpx-1 related  33.61 
 
 
163 aa  47  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.110805 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1443  Allergen V5/Tpx-1 family protein  31.97 
 
 
178 aa  47  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.477266  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4672  SCP-like extracellular  46.3 
 
 
458 aa  47  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.988125  normal  0.181044 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0907  hypothetical protein  26.72 
 
 
341 aa  46.2  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3984  hypothetical protein  24.49 
 
 
344 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3849  hypothetical protein  24.49 
 
 
344 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3680  hypothetical protein  24.49 
 
 
344 aa  45.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3697  hypothetical protein  24.49 
 
 
336 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1912  Allergen V5/Tpx-1 related  30.71 
 
 
264 aa  46.2  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0614362 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4147  hypothetical protein  24.49 
 
 
344 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4341  Allergen V5/Tpx-1 related  29.03 
 
 
182 aa  46.2  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.135556  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2270  SCP-like extracellular  31.65 
 
 
212 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00083862  normal  0.0734842 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1179  SCP-like extracellular  45.45 
 
 
465 aa  46.2  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.249096  hitchhiker  0.000057053 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4052  hypothetical protein  24.49 
 
 
344 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.244783  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3952  hypothetical protein  24.49 
 
 
344 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3457  Allergen V5/Tpx-1 related  34.15 
 
 
338 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0219  SCP-like extracellular  35.2 
 
 
495 aa  45.8  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4689  SCP-like extracellular  35.64 
 
 
171 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2510  SCP-like extracellular  44.83 
 
 
181 aa  45.1  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4242  Allergen V5/Tpx-1 family protein  32.98 
 
 
444 aa  45.4  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.152087 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1597  Allergen V5/Tpx-1 family protein  35.35 
 
 
602 aa  45.1  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0393  SCP-like extracellular  31.58 
 
 
168 aa  45.1  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0611399  normal  0.0668716 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001041  hypothetical protein  32.65 
 
 
179 aa  45.1  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0131  SCP-like extracellular  38.71 
 
 
206 aa  45.1  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0989282  normal  0.151358 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0202  hypothetical protein  33.04 
 
 
156 aa  43.9  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00696457  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1835  Allergen V5/Tpx-1 family protein  33.04 
 
 
156 aa  43.9  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.780904  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4238  hypothetical protein  48.89 
 
 
282 aa  43.9  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.569543  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0268  SCP-like extracellular  43.75 
 
 
347 aa  43.9  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2188  SCP-like extracellular  34.17 
 
 
298 aa  43.9  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2424  SCP-like extracellular  45 
 
 
200 aa  43.9  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.572617  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1406  Allergen V5/Tpx-1 related  32.67 
 
 
170 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0458  Allergen V5/Tpx-1 related  28.78 
 
 
174 aa  42.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>