67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0131 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0131  SCP-like extracellular  100 
 
 
206 aa  400  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0989282  normal  0.151358 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0242  Allergen V5/Tpx-1 family protein  41.96 
 
 
275 aa  84.7  8e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0111615  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1209  Allergen V5/Tpx-1 family protein  38.74 
 
 
239 aa  76.6  0.0000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.15017  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2115  SCP-like extracellular  37.96 
 
 
349 aa  68.9  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.147298  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1426  SCP-like extracellular  33.58 
 
 
328 aa  68.6  0.00000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0300  Allergen V5/Tpx-1 related  34.78 
 
 
205 aa  60.8  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.022059  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0508  spore coat assembly protein SafA  32.03 
 
 
203 aa  58.2  0.00000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1186  hypothetical protein  33.61 
 
 
270 aa  55.1  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2451  SCP-like extracellular  33.63 
 
 
384 aa  55.1  0.0000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.645872  normal  0.0150957 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1208  hypothetical protein  33.61 
 
 
275 aa  54.7  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1448  hypothetical protein  33.61 
 
 
275 aa  55.1  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1306  hypothetical protein  33.61 
 
 
275 aa  54.7  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481179  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1407  hypothetical protein  33.61 
 
 
275 aa  54.7  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1346  hypothetical protein  33.61 
 
 
275 aa  54.7  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1384  hypothetical protein  33.61 
 
 
275 aa  54.7  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1407  Allergen V5/Tpx-1 related  36.13 
 
 
302 aa  54.3  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0652967 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1188  hypothetical protein  33.61 
 
 
263 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0215059  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4242  Allergen V5/Tpx-1 family protein  34.35 
 
 
444 aa  54.3  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.152087 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1374  Allergen V5/Tpx-1 family protein  34.45 
 
 
129 aa  54.7  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000198509  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3998  hypothetical protein  32.77 
 
 
270 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0752047 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0369  SCP-like extracellular  33.33 
 
 
570 aa  52.4  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.879788 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0828  SCP-like extracellular  31.36 
 
 
274 aa  52.4  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000017875  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1282  SCP-like extracellular  35.11 
 
 
317 aa  52.4  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0219  SCP-like extracellular  33.33 
 
 
495 aa  52  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5290  SCP-like extracellular  29.57 
 
 
211 aa  52  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3523  Allergen V5/Tpx-1 related  29.17 
 
 
188 aa  52  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2237  SCP-like extracellular  31.75 
 
 
244 aa  51.6  0.000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21450  SCP-like extracellular  28.76 
 
 
255 aa  50.8  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3457  Allergen V5/Tpx-1 related  34.17 
 
 
338 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3166  Allergen V5/Tpx-1 family protein  28.85 
 
 
461 aa  50.8  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1156  Allergen V5/Tpx-1 related  26.99 
 
 
337 aa  50.4  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.445034 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1210  SCP-like extracellular  31.93 
 
 
276 aa  49.7  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4672  SCP-like extracellular  33.9 
 
 
458 aa  49.7  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.988125  normal  0.181044 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0268  SCP-like extracellular  35.92 
 
 
347 aa  48.9  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1543  hypothetical protein  28.92 
 
 
235 aa  49.3  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1623  SCP-like extracellular  28.81 
 
 
259 aa  48.1  0.00008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.015038  hitchhiker  0.000000394389 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1016  hypothetical protein  31.09 
 
 
283 aa  48.1  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.768354  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0749  SCP-like extracellular  33.33 
 
 
237 aa  47.8  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0207585 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8056  hypothetical protein  26.72 
 
 
305 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2741  Allergen V5/Tpx-1 related  30.38 
 
 
246 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.446296  normal  0.680161 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3165  Allergen V5/Tpx-1 family protein  30.77 
 
 
568 aa  47.4  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.845212  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2948  Allergen V5/Tpx-1 related  32.41 
 
 
280 aa  47.8  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0215583  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3865  SCP-like extracellular  28.37 
 
 
207 aa  46.6  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.348195  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4285  SCP-like extracellular  31.25 
 
 
296 aa  47  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1857  SCP-like extracellular  30.43 
 
 
214 aa  46.6  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.539147  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2441  SCP-like extracellular  30.77 
 
 
194 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.938741  hitchhiker  0.0000000999881 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0081  Allergen V5/Tpx-1 family protein  32.46 
 
 
321 aa  47  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1260  Allergen V5/Tpx-1 family protein  36.96 
 
 
164 aa  46.2  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.560977  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3066  SCP-like extracellular  30.38 
 
 
176 aa  46.6  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0892  SCP-like extracellular  31.9 
 
 
264 aa  44.7  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000243289 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0749  SCP-like extracellular  28.21 
 
 
355 aa  44.7  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3446  SCP-like extracellular  36.67 
 
 
589 aa  44.7  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.118078 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1940  SCP-like extracellular  28.36 
 
 
242 aa  43.9  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0764504  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6058  hypothetical protein  40.43 
 
 
208 aa  43.5  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0051  Allergen V5/Tpx-1 family protein  32.48 
 
 
300 aa  43.9  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000168583  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3522  SCP-like extracellular  32.46 
 
 
290 aa  43.9  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490521  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4411  SCP-like extracellular  36.52 
 
 
300 aa  42.7  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1597  Allergen V5/Tpx-1 family protein  57.89 
 
 
602 aa  43.1  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1179  SCP-like extracellular  32.2 
 
 
465 aa  42.4  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.249096  hitchhiker  0.000057053 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1705  Allergen V5/Tpx-1 related  28.69 
 
 
245 aa  42.7  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000015674  normal  0.367363 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8010  SCP-like extracellular  34.43 
 
 
232 aa  42.7  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0393  SCP-like extracellular  31.19 
 
 
168 aa  42.4  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0611399  normal  0.0668716 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5956  SCP-like extracellular  31.86 
 
 
226 aa  42.4  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3184  SCP-like extracellular  32.41 
 
 
218 aa  42  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.14634  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1583  SCP-like extracellular  37.74 
 
 
275 aa  42  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38670  uncharacterized protein with SCP/PR1 domains  27.74 
 
 
260 aa  41.6  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_33028  predicted protein  26.55 
 
 
240 aa  41.2  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>