16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_33028 on replicon NC_011670
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011670  PHATRDRAFT_33028  predicted protein  100 
 
 
240 aa  495  1e-139  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05140  SCP-like extracellular  25 
 
 
258 aa  55.5  0.0000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1209  Allergen V5/Tpx-1 family protein  27.68 
 
 
239 aa  46.6  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.15017  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1374  Allergen V5/Tpx-1 family protein  24.14 
 
 
129 aa  46.2  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000198509  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1623  SCP-like extracellular  27.43 
 
 
259 aa  46.2  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.015038  hitchhiker  0.000000394389 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1426  SCP-like extracellular  27.35 
 
 
328 aa  45.4  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2948  Allergen V5/Tpx-1 related  24.79 
 
 
280 aa  44.7  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0215583  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0610  SCP-like extracellular  39.06 
 
 
352 aa  45.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0749  SCP-like extracellular  30.7 
 
 
237 aa  44.7  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0207585 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2817  SCP-like extracellular  29.57 
 
 
249 aa  43.9  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1940  SCP-like extracellular  26.96 
 
 
242 aa  43.5  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0764504  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0508  spore coat assembly protein SafA  24.14 
 
 
203 aa  43.5  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1407  Allergen V5/Tpx-1 related  27.52 
 
 
302 aa  42.7  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0652967 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0300  Allergen V5/Tpx-1 related  26.72 
 
 
205 aa  42.7  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.022059  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0828  SCP-like extracellular  24.88 
 
 
274 aa  42.4  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000017875  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2270  SCP-like extracellular  28.45 
 
 
212 aa  42.4  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00083862  normal  0.0734842 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>