121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0460 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_0460  SCP-like extracellular  100 
 
 
184 aa  374  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.133435  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1463  SCP-like extracellular  34.04 
 
 
312 aa  79  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00481671 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0140  Allergen V5/Tpx-1 family protein  28.19 
 
 
372 aa  73.2  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.697458  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1235  SCP-like extracellular  28.76 
 
 
399 aa  73.2  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0683  SCP-like extracellular  26.85 
 
 
423 aa  71.2  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3523  Allergen V5/Tpx-1 related  31.64 
 
 
188 aa  71.2  0.000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4411  SCP-like extracellular  36.72 
 
 
300 aa  70.9  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0893  Allergen V5/Tpx-1 related  29.09 
 
 
449 aa  70.1  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.087721 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3457  Allergen V5/Tpx-1 related  37.5 
 
 
338 aa  69.3  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2188  SCP-like extracellular  36.97 
 
 
298 aa  68.6  0.00000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0268  SCP-like extracellular  33.61 
 
 
347 aa  67.4  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0827  hypothetical protein  26.92 
 
 
317 aa  66.6  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.722064  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0816  hypothetical protein  27.85 
 
 
317 aa  66.6  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2154  SCP-like extracellular  33.59 
 
 
255 aa  65.1  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0219  SCP-like extracellular  35.29 
 
 
495 aa  64.7  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4591  Allergen V5/Tpx-1 family protein  28 
 
 
213 aa  63.2  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.39255  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1543  hypothetical protein  32.59 
 
 
235 aa  62.8  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0070  SCP-like extracellular  34.23 
 
 
296 aa  61.2  0.000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2552  Allergen V5/Tpx-1 related  30.2 
 
 
310 aa  60.8  0.000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.240825 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6058  hypothetical protein  37.5 
 
 
208 aa  60.8  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0610  SCP-like extracellular  27.89 
 
 
352 aa  60.8  0.000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3066  SCP-like extracellular  29.89 
 
 
176 aa  60.8  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2043  Allergen V5/Tpx-1 related  26.71 
 
 
196 aa  60.5  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0276422  normal  0.319002 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0749  SCP-like extracellular  26.71 
 
 
355 aa  59.7  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2435  SCP-like extracellular  32.37 
 
 
270 aa  60.1  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2270  SCP-like extracellular  34.81 
 
 
212 aa  60.1  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00083862  normal  0.0734842 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0728  SCP-like extracellular  35.9 
 
 
285 aa  60.1  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.416101  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4362  Allergen V5/Tpx-1 related  35 
 
 
264 aa  59.3  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328838  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2282  Allergen V5/Tpx-1 family protein  28.19 
 
 
348 aa  59.3  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1282  SCP-like extracellular  33.77 
 
 
317 aa  59.3  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0508  spore coat assembly protein SafA  28.03 
 
 
203 aa  58.9  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3379  SCP-like extracellular  31.72 
 
 
274 aa  58.2  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.55179 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0470  Allergen V5/Tpx-1 related  29.17 
 
 
310 aa  58.2  0.00000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.765372 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0202  hypothetical protein  36.8 
 
 
156 aa  57.4  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00696457  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0300  Allergen V5/Tpx-1 related  31.62 
 
 
205 aa  57.4  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.022059  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1835  Allergen V5/Tpx-1 family protein  36.8 
 
 
156 aa  57.4  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.780904  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1443  Allergen V5/Tpx-1 family protein  35.34 
 
 
178 aa  57  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.477266  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4717  SCP-like extracellular  32.84 
 
 
197 aa  56.2  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.771476  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2817  SCP-like extracellular  28.24 
 
 
249 aa  55.1  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2948  Allergen V5/Tpx-1 related  27.85 
 
 
280 aa  54.7  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0215583  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1426  SCP-like extracellular  26.97 
 
 
328 aa  54.7  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5831  SCP-like extracellular  34.19 
 
 
214 aa  53.9  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.529003  normal  0.937003 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2424  SCP-like extracellular  27.62 
 
 
200 aa  53.9  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.572617  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8056  hypothetical protein  31.71 
 
 
305 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2104  Allergen V5/Tpx-1-like  31.08 
 
 
288 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233408  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1124  hypothetical protein  28.1 
 
 
255 aa  53.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.901449 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4242  Allergen V5/Tpx-1 family protein  32.82 
 
 
444 aa  53.5  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.152087 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0167  SCP-like extracellular  28.03 
 
 
209 aa  53.1  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.119271  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1805  SCP-like extracellular  33.33 
 
 
222 aa  53.5  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000690986 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1374  Allergen V5/Tpx-1 family protein  30.88 
 
 
129 aa  52.8  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000198509  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0445  SCP-like extracellular  30.58 
 
 
500 aa  52.8  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000975734  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5290  SCP-like extracellular  28.57 
 
 
211 aa  52.4  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21450  SCP-like extracellular  29.46 
 
 
255 aa  52  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2510  SCP-like extracellular  29.45 
 
 
181 aa  51.6  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0779  copper amine oxidase-like protein  27.21 
 
 
450 aa  51.2  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247024  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2441  SCP-like extracellular  25 
 
 
194 aa  51.2  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.938741  hitchhiker  0.0000000999881 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3166  Allergen V5/Tpx-1 family protein  30.77 
 
 
461 aa  50.8  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0081  Allergen V5/Tpx-1 family protein  29.63 
 
 
321 aa  50.8  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1117  SCP-like extracellular  30.6 
 
 
351 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5956  SCP-like extracellular  32.5 
 
 
226 aa  49.7  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4672  SCP-like extracellular  32.09 
 
 
458 aa  49.3  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.988125  normal  0.181044 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0828  SCP-like extracellular  27.82 
 
 
274 aa  49.7  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000017875  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3165  Allergen V5/Tpx-1 family protein  32 
 
 
568 aa  48.9  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.845212  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3798  SCP-like extracellular  32.59 
 
 
321 aa  48.9  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.891607 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1798  SCP-like extracellular  28.97 
 
 
208 aa  49.3  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1146  SCP-like extracellular  29.85 
 
 
351 aa  48.5  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.582279 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0910  hypothetical protein  26.32 
 
 
184 aa  48.1  0.00007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0940  hypothetical protein  26.97 
 
 
184 aa  47.8  0.00008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1705  Allergen V5/Tpx-1 related  31.69 
 
 
245 aa  47.8  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000015674  normal  0.367363 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8010  SCP-like extracellular  29.57 
 
 
232 aa  47.8  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0393  SCP-like extracellular  34.48 
 
 
168 aa  47.8  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0611399  normal  0.0668716 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3268  SCP-like extracellular  32.18 
 
 
410 aa  47.8  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2897  SCP-like extracellular  32.85 
 
 
279 aa  47.8  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.204847  normal  0.471797 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1016  hypothetical protein  27.56 
 
 
283 aa  47  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.768354  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1407  hypothetical protein  25.31 
 
 
275 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1208  hypothetical protein  25.31 
 
 
275 aa  46.6  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1188  hypothetical protein  25.31 
 
 
263 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0215059  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1306  hypothetical protein  25.31 
 
 
275 aa  46.6  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481179  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3565  hypothetical protein  32.35 
 
 
206 aa  47  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.727767  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2861  Allergen V5/Tpx-1 family protein  32.11 
 
 
179 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2638  Allergen V5/Tpx-1 family protein  28.05 
 
 
179 aa  46.6  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.450247  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1210  SCP-like extracellular  27.04 
 
 
276 aa  46.2  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1448  hypothetical protein  25.31 
 
 
275 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1346  hypothetical protein  25.31 
 
 
275 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1384  hypothetical protein  25.31 
 
 
275 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1186  hypothetical protein  25.31 
 
 
270 aa  46.2  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1200  hypothetical protein  32.11 
 
 
184 aa  46.2  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3137  SCP-like extracellular  29.05 
 
 
286 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3687  SCP-like extracellular  29.75 
 
 
167 aa  45.8  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00687212  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1179  SCP-like extracellular  31.33 
 
 
465 aa  45.8  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.249096  hitchhiker  0.000057053 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38670  uncharacterized protein with SCP/PR1 domains  30.25 
 
 
260 aa  45.4  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0458  Allergen V5/Tpx-1 related  29.36 
 
 
174 aa  45.1  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3998  hypothetical protein  24.69 
 
 
270 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0752047 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1857  SCP-like extracellular  28.24 
 
 
214 aa  45.4  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.539147  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4392  SCP-like extracellular  38.03 
 
 
180 aa  45.1  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4285  SCP-like extracellular  28.91 
 
 
296 aa  45.1  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3495  putative SCP-like extracellular protein  31.58 
 
 
176 aa  44.3  0.0009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.870948  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1373  hypothetical protein  28.23 
 
 
541 aa  44.3  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1407  Allergen V5/Tpx-1 related  27.21 
 
 
302 aa  44.3  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0652967 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5005  SCP-like extracellular  28.68 
 
 
254 aa  43.9  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.342918  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>