52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1798 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1798  SCP-like extracellular  100 
 
 		 208 aa  438  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0154  SCP-like extracellular  30.56 
 
 		 235 aa  77.8  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2188  SCP-like extracellular  28.08 
 
 		 298 aa  60.5  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0958  copper amine oxidase domain protein  25.85 
 
 		 423 aa  56.2  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.990668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3457  Allergen V5/Tpx-1 related  28 
 
 		 338 aa  55.1  0.0000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1463  SCP-like extracellular  27.98 
 
 		 312 aa  53.9  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00481671 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0893  Allergen V5/Tpx-1 related  24.26 
 
 		 449 aa  53.9  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.087721 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2552  Allergen V5/Tpx-1 related  27.39 
 
 		 310 aa  53.5  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.240825 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0610  SCP-like extracellular  26.49 
 
 		 352 aa  53.1  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3523  Allergen V5/Tpx-1 related  28.4 
 
 		 188 aa  52  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1805  SCP-like extracellular  29.46 
 
 		 222 aa  52  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000690986 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2282  Allergen V5/Tpx-1 family protein  27.86 
 
 		 348 aa  51.6  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0272  SCP-like extracellular  25.15 
 
 		 257 aa  50.8  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0683  SCP-like extracellular  26.71 
 
 		 423 aa  50.4  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3579  hypothetical protein  26.32 
 
 		 293 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.38499  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1373  hypothetical protein  28.78 
 
 		 541 aa  48.9  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1235  SCP-like extracellular  28 
 
 		 399 aa  48.1  0.00008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0458  Allergen V5/Tpx-1 related  23.95 
 
 		 174 aa  47.8  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0779  copper amine oxidase-like protein  33.33 
 
 		 450 aa  47.8  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247024  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3268  SCP-like extracellular  28.97 
 
 		 410 aa  48.1  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8010  SCP-like extracellular  24.57 
 
 		 232 aa  47.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2043  Allergen V5/Tpx-1 related  23.75 
 
 		 196 aa  47.8  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0276422  normal  0.319002 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2104  Allergen V5/Tpx-1-like  28.35 
 
 		 288 aa  47  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233408  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0070  SCP-like extracellular  30 
 
 		 296 aa  47  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0140  Allergen V5/Tpx-1 family protein  25.81 
 
 		 372 aa  47  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.697458  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2424  SCP-like extracellular  28.8 
 
 		 200 aa  46.6  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.572617  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18350  hypothetical protein  27.34 
 
 		 301 aa  46.2  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3350  Allergen V5/Tpx-1 related  27.07 
 
 		 293 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.688686  normal  0.0178942 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0851  hypothetical protein  25.68 
 
 		 287 aa  45.8  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.721637  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2358  SCP-like extracellular  24.84 
 
 		 283 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.678269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2482  SCP-like extracellular  25.48 
 
 		 283 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.897986  normal  0.230524 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2817  SCP-like extracellular  23.62 
 
 		 249 aa  45.1  0.0009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49660  hypothetical protein  25.85 
 
 		 282 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2211  SCP-like extracellular protein  24.84 
 
 		 283 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0749  SCP-like extracellular  26.85 
 
 		 355 aa  43.9  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3563  hypothetical protein  24.18 
 
 		 283 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4039  hypothetical protein  23.78 
 
 		 344 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.784658  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4052  hypothetical protein  23.08 
 
 		 344 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.244783  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3697  hypothetical protein  23.08 
 
 		 336 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0346  SCP-like extracellular  27.73 
 
 		 261 aa  43.1  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.557826  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3680  hypothetical protein  23.08 
 
 		 344 aa  43.1  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3952  hypothetical protein  23.08 
 
 		 344 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1864  SCP-like extracellular  30.33 
 
 		 335 aa  42.7  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3169  Allergen V5/Tpx-1 family protein  27.56 
 
 		 279 aa  43.1  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.635999  normal  0.126682 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3849  hypothetical protein  23.08 
 
 		 344 aa  43.1  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4411  SCP-like extracellular  26.76 
 
 		 300 aa  43.1  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4147  hypothetical protein  23.08 
 
 		 344 aa  43.1  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3984  hypothetical protein  23.08 
 
 		 344 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2217  SCP-like extracellular  26.14 
 
 		 162 aa  42.7  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0300  Allergen V5/Tpx-1 related  23.38 
 
 		 205 aa  42.7  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.022059  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1282  SCP-like extracellular  27.08 
 
 		 317 aa  42  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2237  SCP-like extracellular  23.61 
 
 		 244 aa  41.2  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>