12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0154 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0154  SCP-like extracellular  100 
 
 		 235 aa  475  1e-133  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1798  SCP-like extracellular  31.33 
 
 		 208 aa  82.4  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2188  SCP-like extracellular  30.34 
 
 		 298 aa  52.8  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0958  copper amine oxidase domain protein  26.51 
 
 		 423 aa  52.4  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.990668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0749  SCP-like extracellular  30.19 
 
 		 355 aa  50.4  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0779  copper amine oxidase-like protein  27.16 
 
 		 450 aa  48.5  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247024  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0683  SCP-like extracellular  24.68 
 
 		 423 aa  45.8  0.0005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0140  Allergen V5/Tpx-1 family protein  24.68 
 
 		 372 aa  45.1  0.0009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.697458  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1374  Allergen V5/Tpx-1 family protein  24.84 
 
 		 129 aa  43.1  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000198509  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1235  SCP-like extracellular  24.52 
 
 		 399 aa  42  0.008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3984  hypothetical protein  26.43 
 
 		 344 aa  41.6  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4052  hypothetical protein  26.43 
 
 		 344 aa  41.6  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.244783  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>