44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_03150 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_03150  hypothetical protein  100 
 
 		 690 aa  1323    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.345616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  40.47 
 
 		 9867 aa  127  6e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4022  conserved repeat domain protein  30.17 
 
 		 1989 aa  89.4  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3161  outer membrane adhesin-like protein  37.5 
 
 		 1269 aa  80.1  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3256  outer membrane adhesin like proteiin  38.81 
 
 		 1268 aa  80.1  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26340  hypothetical protein  36.69 
 
 		 654 aa  80.1  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3063  VCBS  36.36 
 
 		 1269 aa  73.9  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6119  hypothetical protein  44.14 
 
 		 390 aa  67.8  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6118  hypothetical protein  42.06 
 
 		 393 aa  61.2  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  31.66 
 
 		 3474 aa  61.2  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  34.03 
 
 		 4848 aa  57.4  0.0000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20050  hypothetical protein  31.1 
 
 		 721 aa  57  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.127306  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02378  hypothetical protein  39.1 
 
 		 814 aa  55.8  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  32.02 
 
 		 2377 aa  56.6  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.5 
 
 		 994 aa  55.5  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  33.7 
 
 		 2816 aa  55.1  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3686  parallel beta-helix repeat-containing protein  34.36 
 
 		 1066 aa  54.7  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.346515 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  31 
 
 		 2839 aa  54.7  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2038  FG-GAP  35.25 
 
 		 690 aa  54.3  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0466844 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4855  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  36.32 
 
 		 2114 aa  54.3  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.656621  normal  0.707732 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  31.73 
 
 		 4978 aa  53.1  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2357  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.92 
 
 		 850 aa  52.8  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  30.73 
 
 		 3477 aa  52.8  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0045  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  27.41 
 
 		 1468 aa  51.6  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.292772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3869  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.29 
 
 		 3816 aa  51.6  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  29.32 
 
 		 3089 aa  50.1  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  30.1 
 
 		 5745 aa  50.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0223  fibronectin, type III  29.17 
 
 		 1911 aa  50.1  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1752  proprotein convertase, P  30.17 
 
 		 1367 aa  48.9  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  34.62 
 
 		 3191 aa  48.1  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2359  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.4 
 
 		 761 aa  48.1  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.658251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  30.32 
 
 		 1597 aa  46.6  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1152  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.65 
 
 		 3363 aa  47  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1367  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.8 
 
 		 3396 aa  47.4  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.410312 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6410  hypothetical protein  31.82 
 
 		 1781 aa  46.2  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.885103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0949  fibronectin, type III domain-containing protein  32.07 
 
 		 892 aa  46.6  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  32.1 
 
 		 16322 aa  46.2  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  31.79 
 
 		 8321 aa  45.8  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0313  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.54 
 
 		 4836 aa  44.7  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.971398 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.11 
 
 		 4220 aa  44.7  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  27.62 
 
 		 3544 aa  44.3  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2554  proprotein convertase, P  28.67 
 
 		 1363 aa  44.3  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5754  conserved repeat domain protein  36.56 
 
 		 3471 aa  43.9  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.350912 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1291  outer membrane adhesin like proteiin  30.95 
 
 		 2555 aa  43.9  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.983971 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>