50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0531 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0531  hypothetical protein  100 
 
 		 1032 aa  2068    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.309597 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0530  hypothetical protein  48.1 
 
 		 1210 aa  333  1e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0010082  normal  0.0887655 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  29.59 
 
 		 3793 aa  87.4  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  25.99 
 
 		 4896 aa  75.1  0.000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3798  filamentous hemagglutinin outer membrane protein  36.26 
 
 		 1526 aa  72  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0575475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  26.05 
 
 		 2377 aa  70.5  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  35.11 
 
 		 3927 aa  69.7  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  34.51 
 
 		 3227 aa  65.9  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  38.18 
 
 		 9867 aa  65.9  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0597  hypothetical protein  40.28 
 
 		 1547 aa  64.3  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  32.95 
 
 		 2296 aa  63.2  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  32.04 
 
 		 2927 aa  63.5  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5754  conserved repeat domain protein  29.29 
 
 		 3471 aa  62.8  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.350912 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3959  hypothetical protein  31.09 
 
 		 1066 aa  62.4  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.383952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1646  conserved repeat domain protein  36.73 
 
 		 315 aa  58.9  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0137205 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1251  hypothetical protein  35.29 
 
 		 1259 aa  58.2  0.0000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3435  hypothetical protein  31.4 
 
 		 2367 aa  58.2  0.0000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3654  hypothetical protein  31.4 
 
 		 2411 aa  58.2  0.0000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3437  hypothetical protein  31.4 
 
 		 2421 aa  57.8  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  31.4 
 
 		 2807 aa  56.6  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3439  glycerol kinase-related  31.4 
 
 		 2454 aa  57.4  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4946  hypothetical protein  31.82 
 
 		 711 aa  55.1  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0115  putative hemagglutinin-related protein  29.93 
 
 		 1672 aa  54.7  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3478  hypothetical protein  35.71 
 
 		 3737 aa  51.6  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  25.83 
 
 		 1059 aa  51.6  0.00008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0803  hypothetical protein  34.38 
 
 		 1114 aa  51.2  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3220  hypothetical protein  28.41 
 
 		 1980 aa  49.7  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.782341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  29.13 
 
 		 3324 aa  48.9  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6390  conserved repeat domain protein  28.28 
 
 		 1483 aa  48.9  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  26.44 
 
 		 1371 aa  48.9  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2924  hypothetical protein  32.35 
 
 		 1064 aa  48.5  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000594804  normal  0.19757 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3971  hypothetical protein  34.72 
 
 		 3602 aa  48.1  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2802  glycoside hydrolase family 5  29.81 
 
 		 677 aa  48.1  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.461879  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2040  hypothetical protein  31.52 
 
 		 2022 aa  48.1  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0726199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1934  hypothetical protein  31.52 
 
 		 1067 aa  48.1  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.109273 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2925  hypothetical protein  35.48 
 
 		 561 aa  47.8  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000000182074  normal  0.28317 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3440  glycoside hydrolase family 8 protein  29 
 
 		 2772 aa  46.6  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01025  hypothetical protein  29.58 
 
 		 2005 aa  46.6  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2181  conserved repeat domain protein  34.25 
 
 		 599 aa  46.2  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.609194 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03554  hemagglutinin-like protein  36.9 
 
 		 1222 aa  46.2  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2552  hypothetical protein  27 
 
 		 750 aa  46.2  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.477149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5260  hypothetical protein  28.91 
 
 		 1879 aa  46.2  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2038  FG-GAP  35.45 
 
 		 690 aa  45.8  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0466844 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2528  hypothetical protein  29.21 
 
 		 2270 aa  45.1  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3150  lipoprotein  29.25 
 
 		 2670 aa  45.4  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2684  PKD domain containing protein  26.02 
 
 		 1152 aa  45.4  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.386868 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3091  Ig family protein  29.91 
 
 		 618 aa  45.1  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04505  surface adhesion protein, putative  26.92 
 
 		 1345 aa  45.1  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2780  hypothetical protein  27.13 
 
 		 648 aa  45.1  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167113  normal  0.164287 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  26.92 
 
 		 3477 aa  45.1  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>