51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2571 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2571  FG-GAP repeat protein  100 
 
 		 456 aa  925    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2569  FG-GAP repeat protein  73.17 
 
 		 685 aa  430  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.618986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2570  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  74.4 
 
 		 571 aa  372  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3103  hypothetical protein  28.27 
 
 		 536 aa  89  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.186273  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0293  hypothetical protein  34.3 
 
 		 316 aa  79.7  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1179  SpoIID/LytB domain protein  30.61 
 
 		 658 aa  76.6  0.0000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2178  Integrins alpha chain  33.9 
 
 		 883 aa  73.6  0.000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.297382  hitchhiker  0.000212806 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1188  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  27.72 
 
 		 794 aa  70.1  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.469744  normal  0.0598623 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2135  hypothetical protein  35 
 
 		 243 aa  68.2  0.0000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.173128  normal  0.269343 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1405  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.08 
 
 		 959 aa  67.8  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0168  Peptidase M23  30.3 
 
 		 435 aa  65.9  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2378  hypothetical protein  33.65 
 
 		 555 aa  65.5  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.104258 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3359  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.12 
 
 		 1154 aa  59.7  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.324183  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7206  hypothetical protein  30 
 
 		 536 aa  58.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.632114  normal  0.0521608 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  31.48 
 
 		 3197 aa  57.8  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.5 
 
 		 1113 aa  57.8  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.14 
 
 		 1222 aa  57.8  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.81 
 
 		 1340 aa  55.1  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6048  hypothetical protein  29 
 
 		 534 aa  55.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2642  metallophosphoesterase  29.82 
 
 		 649 aa  55.5  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0441775  normal  0.87277 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  27.72 
 
 		 1275 aa  53.9  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  29 
 
 		 1490 aa  53.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5322  hypothetical protein  29.08 
 
 		 134 aa  52.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.877896  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  29.63 
 
 		 1019 aa  51.6  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.69 
 
 		 1225 aa  50.8  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1381  peptidase M23B  25.71 
 
 		 491 aa  50.4  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.897006  normal  0.0374787 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0198  YD repeat-containing protein  27.23 
 
 		 3333 aa  50.1  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00448474 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1380  FG-GAP repeat-containing protein  27.19 
 
 		 514 aa  49.7  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0133276 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3048  multicopper oxidase, type 2  29.83 
 
 		 1308 aa  49.3  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3145  FG-GAP repeat protein  25.93 
 
 		 1346 aa  48.5  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  29.32 
 
 		 1126 aa  48.9  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.14 
 
 		 1118 aa  48.5  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6310  FG-GAP repeat protein  30.04 
 
 		 828 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2038  FG-GAP  26.09 
 
 		 690 aa  48.5  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0466844 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  29.11 
 
 		 3197 aa  48.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.82 
 
 		 2194 aa  47  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4328  hypothetical protein  31.21 
 
 		 288 aa  47  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300835 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1773  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.35 
 
 		 889 aa  45.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.403539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  27.14 
 
 		 974 aa  46.2  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2168  Integrins alpha chain  25.96 
 
 		 534 aa  45.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000439039 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1279  putative large secreted protein  27.93 
 
 		 1037 aa  45.8  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97722  hitchhiker  0.000946553 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8159  hypothetical protein  30.94 
 
 		 293 aa  44.3  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2050  FG-GAP repeat protein  24.48 
 
 		 1437 aa  44.7  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3148  FG-GAP repeat protein  28.77 
 
 		 1348 aa  44.3  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.589686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0330  FG-GAP repeat protein  31.34 
 
 		 732 aa  44.3  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.87032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0616  FG-GAP repeat-containing protein  29.59 
 
 		 386 aa  44.3  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0513696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48800  hypothetical protein  27.45 
 
 		 205 aa  43.9  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.040428  hitchhiker  0.0000000044472 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  28.57 
 
 		 1838 aa  43.5  0.008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1950  FG-GAP repeat-containing protein  27.57 
 
 		 861 aa  43.5  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0767  hypothetical protein  26.74 
 
 		 811 aa  43.1  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.4016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1337  Integrins alpha chain  24.85 
 
 		 1434 aa  43.1  0.01  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.153084  normal  0.903463 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>