16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_2135 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_2135  hypothetical protein  100 
 
 		 243 aa  494  1e-139  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.173128  normal  0.269343 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2378  hypothetical protein  28.44 
 
 		 555 aa  73.9  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.104258 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7206  hypothetical protein  34.71 
 
 		 536 aa  70.1  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.632114  normal  0.0521608 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6048  hypothetical protein  30.06 
 
 		 534 aa  68.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2571  FG-GAP repeat protein  35 
 
 		 456 aa  67.4  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0293  hypothetical protein  34.62 
 
 		 316 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1936  hypothetical protein  36.61 
 
 		 523 aa  58.2  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.168185  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02105  predicted peptidase, outer membrane lipoprotein  40.98 
 
 		 188 aa  42.4  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1482  NLP/P60 protein  40.98 
 
 		 188 aa  42.4  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.736883  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2313  putative outer membrane lipoprotein  40.98 
 
 		 188 aa  42.4  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.871525  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2473  putative outer membrane lipoprotein  40.98 
 
 		 188 aa  42.4  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.303091  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1472  putative outer membrane lipoprotein  40.98 
 
 		 188 aa  42.4  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000135569  normal  0.0170642 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2324  putative outer membrane lipoprotein  40.98 
 
 		 188 aa  42.4  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669952 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0783  putative outer membrane lipoprotein  40.98 
 
 		 188 aa  42.4  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3313  putative outer membrane lipoprotein  40.98 
 
 		 188 aa  42.4  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0116683  normal  0.115135 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02064  hypothetical protein  40.98 
 
 		 188 aa  42.4  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>