More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0168 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_0168  Peptidase M23  100 
 
 
435 aa  867    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1188  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  29.51 
 
 
794 aa  99  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.469744  normal  0.0598623 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2569  FG-GAP repeat protein  28.51 
 
 
685 aa  84.7  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.618986  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2570  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.17 
 
 
571 aa  82  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4186  hypothetical protein  32.52 
 
 
760 aa  80.9  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.394785 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1381  peptidase M23B  24.58 
 
 
491 aa  76.6  0.0000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.897006  normal  0.0374787 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1179  SpoIID/LytB domain protein  30.04 
 
 
658 aa  75.9  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4454  peptidase M23B  41.05 
 
 
254 aa  73.2  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.329906  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2500  peptidase M23B  32.68 
 
 
506 aa  72  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0374787 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0849  M24/M37 family peptidase  35.71 
 
 
462 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0168749  normal  0.445111 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2197  Peptidase M23  41.3 
 
 
300 aa  70.9  0.00000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.927466  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1127  peptidase M23B  35.83 
 
 
468 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000608337  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0192  Peptidase M23  36.36 
 
 
312 aa  70.5  0.00000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2811  peptidase M23B  35.83 
 
 
472 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000654378  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1213  peptidase M23B  35.83 
 
 
468 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0214324  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1246  peptidase M23B  35.83 
 
 
468 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00321659  normal  0.121883 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3404  domain of unknown function DUF1735  24.5 
 
 
411 aa  68.9  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00777972  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3144  Peptidase M23  35.83 
 
 
468 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0015226  normal  0.847017 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2972  peptidase M23B  35 
 
 
512 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000246824  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1169  peptidase M23B  35.83 
 
 
468 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000504545  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1021  peptidase M23B  40 
 
 
491 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000137565  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  40.16 
 
 
441 aa  67.8  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2963  peptidase M23B  35 
 
 
491 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00002101  normal  0.0112469 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1587  peptidase, M23/M37 family protein  41.44 
 
 
431 aa  67.4  0.0000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454077  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3059  peptidase M23B  35 
 
 
466 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000244164  normal  0.0231551 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01618  Peptidase, M23/M37 family protein  35 
 
 
441 aa  67  0.0000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0994  peptidase M23B  39 
 
 
470 aa  66.6  0.0000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000818534  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2881  peptidase M23B  34.17 
 
 
466 aa  66.2  0.0000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000532238  hitchhiker  0.00000791404 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2199  Peptidase M23  45.65 
 
 
316 aa  66.2  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1314  M24/M37 family peptidase  35 
 
 
482 aa  65.9  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39790  Peptidase  43.18 
 
 
274 aa  66.2  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.315957  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2571  FG-GAP repeat protein  30.3 
 
 
456 aa  65.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  35.29 
 
 
282 aa  65.9  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1211  peptidase M23B  39 
 
 
475 aa  65.5  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0168861  normal  0.0255188 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  41.86 
 
 
455 aa  65.1  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  35.66 
 
 
375 aa  65.9  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0060  Peptidase M23  40.62 
 
 
320 aa  64.7  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00481353  hitchhiker  0.00293385 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15100  hypothetical protein  42.05 
 
 
282 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.132292  hitchhiker  0.000839665 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3297  peptidase M23B  40.43 
 
 
448 aa  63.9  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00235812  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0030  Peptidase M23  40.66 
 
 
445 aa  63.9  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0513  peptidase M23B  38.64 
 
 
439 aa  63.9  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.842896  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  38.46 
 
 
375 aa  63.9  0.000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5846  peptidase M23B  43.01 
 
 
415 aa  63.9  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3741  peptidase M23B  35.86 
 
 
332 aa  63.5  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.65677 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0299  Peptidase M23  32.9 
 
 
490 aa  63.2  0.000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0751276  normal  0.0202035 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001428  cell wall endopeptidase family M23/M37  34.55 
 
 
404 aa  63.2  0.000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0015397  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  28.4 
 
 
3197 aa  63.2  0.000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1355  hypothetical protein  30.39 
 
 
1638 aa  62.8  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3167  Peptidase M23  43.33 
 
 
391 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1328  hypothetical protein  40.91 
 
 
282 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1574  putative phage structural protein  32.11 
 
 
1019 aa  62.8  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1036  metalloprotease  36.04 
 
 
458 aa  62.8  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0193125  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0734  peptidase M23B  41.38 
 
 
373 aa  62.4  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0522246  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0060  hypothetical protein  38.1 
 
 
430 aa  62  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  5.86289e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1103  peptidase M23B  37 
 
 
475 aa  61.6  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.123313 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3607  peptidase M23B  42.05 
 
 
469 aa  62  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0610326  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3209  Peptidase M23  42.22 
 
 
392 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.626752  normal  0.571204 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2983  peptidase M23B  41.11 
 
 
392 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2733  Peptidase M23  39.53 
 
 
456 aa  61.6  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0321  metallopeptidase  38.93 
 
 
509 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.255107  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1887  M24/M37 family peptidase  38.93 
 
 
472 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0768301  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  35.19 
 
 
430 aa  60.8  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2447  peptidase M23B  39.53 
 
 
459 aa  61.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1900  M24/M37 family peptidase  38.93 
 
 
471 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0520216  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02939  membrane-bound metalloendopeptidase  32.05 
 
 
472 aa  60.8  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  42.42 
 
 
399 aa  60.8  0.00000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1665  peptidase  38.93 
 
 
470 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2055  peptidase  38.93 
 
 
512 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.485622  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2205  peptidase M23B  50.91 
 
 
450 aa  60.5  0.00000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000218447  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2447  M23/M37 familypeptidase  38.17 
 
 
499 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.372819  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  42.42 
 
 
399 aa  60.8  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0838  M24/M37 family peptidase  42.53 
 
 
269 aa  60.8  0.00000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0667187  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  35.59 
 
 
446 aa  60.5  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1678  peptidase M23B  32.52 
 
 
433 aa  60.5  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0411923  normal  0.669465 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3063  peptidase M23B  42.17 
 
 
377 aa  60.5  0.00000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000502081  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1656  peptidase M23B  32.52 
 
 
433 aa  60.5  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000516182  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2039  Peptidase M23  40 
 
 
414 aa  60.5  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0205491  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2141  hypothetical protein  36.78 
 
 
486 aa  60.5  0.00000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.0000028881  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1641  peptidase M23B  32.52 
 
 
433 aa  60.5  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000435092  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2702  Peptidase M23  32.52 
 
 
433 aa  60.5  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000811311  hitchhiker  0.0000822209 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1912  Peptidase M23  40.23 
 
 
439 aa  60.5  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.620351 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1037  Peptidase M23  35.25 
 
 
477 aa  60.5  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.501943  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0286  peptidase M23B  36.89 
 
 
374 aa  60.1  0.00000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  36.88 
 
 
238 aa  60.1  0.00000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2448  peptidase M23B  31.71 
 
 
431 aa  60.1  0.00000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.093884  hitchhiker  0.000000000665253 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2518  peptidase M23B  31.71 
 
 
431 aa  60.1  0.00000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0290484  unclonable  0.0000200771 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2610  peptidase M23B  31.71 
 
 
431 aa  60.1  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.326466  hitchhiker  0.000000038042 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4726  M24/M37 family peptidase  39.77 
 
 
498 aa  60.1  0.00000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1445  peptidase, M23/M37 family  39.08 
 
 
274 aa  60.1  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.813249  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0535  peptidase M23B  36.28 
 
 
247 aa  59.7  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3453  peptidase M23B  56.6 
 
 
271 aa  59.3  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  41.11 
 
 
454 aa  59.7  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1809  peptidase M23  40 
 
 
414 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00301021 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  51.85 
 
 
372 aa  59.3  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1533  peptidase M23B  31.71 
 
 
431 aa  59.3  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00239746  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06306  peptidase  35.51 
 
 
439 aa  59.7  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2849  peptidase M23B  37.21 
 
 
455 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649835  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2264  peptidase M23B  38.46 
 
 
450 aa  59.3  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.971907  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0856  hypothetical protein  51.92 
 
 
300 aa  58.5  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3011  peptidase M23B  33.33 
 
 
482 aa  58.9  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.698295 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>