30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2570 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2570  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 		 571 aa  1162    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2569  FG-GAP repeat protein  76.49 
 
 		 685 aa  404  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.618986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2571  FG-GAP repeat protein  74.4 
 
 		 456 aa  386  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0168  Peptidase M23  30.17 
 
 		 435 aa  89.7  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1179  SpoIID/LytB domain protein  34.65 
 
 		 658 aa  84.7  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0741  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.2 
 
 		 315 aa  70.1  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0731955  normal  0.318843 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1188  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  32.53 
 
 		 794 aa  62.8  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.469744  normal  0.0598623 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2178  Integrins alpha chain  29.63 
 
 		 883 aa  57.8  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.297382  hitchhiker  0.000212806 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3359  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.38 
 
 		 1154 aa  56.6  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.324183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2985  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.23 
 
 		 316 aa  56.6  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000194556 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1405  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.84 
 
 		 959 aa  54.3  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26.87 
 
 		 1113 aa  53.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2642  metallophosphoesterase  28.8 
 
 		 649 aa  52  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0441775  normal  0.87277 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  34.88 
 
 		 1222 aa  51.6  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3400  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.29 
 
 		 378 aa  51.6  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8159  hypothetical protein  29.67 
 
 		 293 aa  50.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.43 
 
 		 1340 aa  48.9  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0330  FG-GAP repeat protein  26.6 
 
 		 732 aa  48.9  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.87032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.04 
 
 		 1225 aa  48.5  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1381  peptidase M23B  26.56 
 
 		 491 aa  47.4  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.897006  normal  0.0374787 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  27.07 
 
 		 1490 aa  46.6  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2038  FG-GAP  27.35 
 
 		 690 aa  45.8  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0466844 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  33.14 
 
 		 1126 aa  45.8  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1380  FG-GAP repeat-containing protein  26.56 
 
 		 514 aa  45.1  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0133276 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1773  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  37.93 
 
 		 889 aa  45.4  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.403539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  28.8 
 
 		 1275 aa  45.1  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0198  YD repeat-containing protein  27.53 
 
 		 3333 aa  44.7  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00448474 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.57 
 
 		 2194 aa  45.1  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  27.66 
 
 		 3197 aa  43.9  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  27.75 
 
 		 3197 aa  43.9  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>