254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4500 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4500  Collagen triple helix repeat protein  100 
 
 
685 aa  1311    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.491219  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  34.04 
 
 
616 aa  268  2.9999999999999995e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0893  Collagen triple helix repeat protein  30.57 
 
 
644 aa  132  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216124  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3152  BclA protein  68.75 
 
 
347 aa  112  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0005  BclA protein  68.75 
 
 
347 aa  112  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5836  Collagen triple helix repeat protein  35 
 
 
1426 aa  109  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278516  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  32.15 
 
 
1838 aa  109  2e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.22 
 
 
1113 aa  109  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  32.39 
 
 
2807 aa  109  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3449  Collagen triple helix repeat protein  35.01 
 
 
663 aa  108  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.344079  normal  0.0780597 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1773  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.73 
 
 
889 aa  105  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.403539  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.68 
 
 
2194 aa  102  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0620  FG-GAP repeat-containing protein  32.34 
 
 
412 aa  102  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.146794  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  30.29 
 
 
1019 aa  102  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3470  triple helix repeat-containing collagen  62.96 
 
 
813 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.943395  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  29.5 
 
 
1490 aa  99.4  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32 
 
 
1118 aa  99.8  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2406  collagen triple helix repeat protein  52.59 
 
 
300 aa  98.6  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3936  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.77 
 
 
1009 aa  97.4  7e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00889284  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.04 
 
 
1222 aa  97.4  7e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.51 
 
 
1340 aa  97.1  9e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1928  FG-GAP repeat-containing protein  30.4 
 
 
872 aa  94  8e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2280  triple helix repeat-containing collagen  63.95 
 
 
299 aa  93.2  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151545  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4654  hypothetical protein  66.35 
 
 
462 aa  93.2  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0666  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33 
 
 
891 aa  93.6  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0586  Collagen triple helix repeat protein  63.39 
 
 
606 aa  92.4  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2240  hypothetical protein  64.13 
 
 
258 aa  92  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2386  FG-GAP repeat protein  31.79 
 
 
657 aa  92.4  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0794745  decreased coverage  0.00143024 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4710  integrin-like protein  30.61 
 
 
604 aa  92.4  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1581  hypothetical protein  58.97 
 
 
585 aa  91.7  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.322632  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1008  Collagen triple helix repeat protein  60.75 
 
 
380 aa  91.7  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.03 
 
 
1225 aa  91.7  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6310  FG-GAP repeat protein  31.63 
 
 
828 aa  90.5  8e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1339  collagen-like protein  61.95 
 
 
712 aa  89.7  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  31.72 
 
 
1557 aa  89.4  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  31.91 
 
 
974 aa  89.4  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  53.1 
 
 
2914 aa  89.4  2e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3721  collagen triple helix repeat protein  64.55 
 
 
706 aa  89.4  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.98705e-33 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  45.79 
 
 
2851 aa  89  3e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1618  group-specific protein  57.03 
 
 
643 aa  88.2  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.747405  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4093  integrin-like protein  29.7 
 
 
494 aa  88.2  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4635  collagen triple helix repeat domain protein  61.6 
 
 
459 aa  87  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.179421  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4978  triple helix repeat-containing collagen  57.02 
 
 
469 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2389  triple helix repeat-containing collagen  53.66 
 
 
842 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00549275  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1027  triple helix repeat-containing collagen  51.38 
 
 
403 aa  85.9  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.155494  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3557  hypothetical protein  56 
 
 
481 aa  85.1  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285889  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3841  hypothetical protein  56 
 
 
478 aa  85.1  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000174288  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0148  collagen triple helix repeat protein  64.49 
 
 
639 aa  84.7  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1338  group-specific protein  63.46 
 
 
436 aa  84.3  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00783091  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1549  group-specific protein  60.34 
 
 
512 aa  84.3  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000333718 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4655  collagen triple helix repeat domain protein  65.66 
 
 
426 aa  84  0.000000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3227  triple helix repeat-containing collagen  61.62 
 
 
274 aa  84  0.000000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3403  triple helix repeat-containing collagen  53.85 
 
 
582 aa  84  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000154784 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4623  triple helix repeat-containing collagen  57.02 
 
 
647 aa  83.6  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2925  collagen triple helix repeat protein  63.04 
 
 
252 aa  83.6  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00742867 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  47.47 
 
 
689 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3469  triple helix repeat-containing collagen  60.36 
 
 
748 aa  82.8  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  29.58 
 
 
1126 aa  83.2  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2198  hypothetical protein  63.29 
 
 
240 aa  82.4  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1202  triple helix repeat-containing collagen  56.04 
 
 
400 aa  82  0.00000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2758  tail fiber protein  46.72 
 
 
439 aa  82  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.204827  normal  0.264951 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4912  collagen triple helix repeat protein  58.76 
 
 
524 aa  81.6  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4370  triple helix repeat-containing collagen  51.96 
 
 
344 aa  81.6  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324657  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3739  hypothetical protein  58.93 
 
 
1147 aa  81.3  0.00000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0102662  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1380  triple helix repeat-containing collagen  58.59 
 
 
474 aa  80.9  0.00000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0453849  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2273  integrin-like protein  27.53 
 
 
472 aa  80.5  0.00000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.328252  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3118  tail fiber protein  45.9 
 
 
437 aa  80.5  0.00000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.145222 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1597  hypothetical protein  33.01 
 
 
1289 aa  80.1  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3477  triple helix repeat-containing collagen  59.81 
 
 
936 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00171179  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3456  triple helix repeat-containing collagen  61.4 
 
 
1168 aa  79  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00439724  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0915  tail fiber protein  52.53 
 
 
438 aa  78.2  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13970  collagen triple helix repeat protein  46.67 
 
 
523 aa  78.2  0.0000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0616  FG-GAP repeat-containing protein  30.36 
 
 
386 aa  77.4  0.0000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0513696  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  33.02 
 
 
3197 aa  77  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1203  tail fiber protein  50.51 
 
 
451 aa  76.6  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  28.3 
 
 
813 aa  77  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2165  tail fiber protein  50.51 
 
 
437 aa  76.6  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.468721  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0460  integrin-like protein  29.28 
 
 
1124 aa  75.9  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.849275 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2871  tail fiber protein  50.51 
 
 
437 aa  76.3  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0235495 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2465  BclA protein  60.58 
 
 
348 aa  75.5  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4263  triple helix repeat-containing collagen  61.9 
 
 
390 aa  75.1  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5091  FG-GAP repeat protein  28.69 
 
 
662 aa  75.1  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.246094 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5835  metallophosphoesterase  37.31 
 
 
1421 aa  74.7  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0189418  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0682  triple helix repeat-containing collagen  48.62 
 
 
542 aa  74.7  0.000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1926  triple helix repeat-containing collagen  37.89 
 
 
582 aa  74.3  0.000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3386  hypothetical protein  52.5 
 
 
867 aa  73.6  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.12938  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1262  BclA protein  70.83 
 
 
295 aa  73.9  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3508  tail fiber protein  50.49 
 
 
645 aa  72.8  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.283696 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1804  tail fiber protein  48.96 
 
 
434 aa  72.8  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.982324  hitchhiker  0.00650595 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3686  triple helix repeat-containing collagen  38.12 
 
 
587 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3360  hypothetical protein  51.61 
 
 
835 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.888871  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1104  bclA protein  69.44 
 
 
283 aa  72.4  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4476  collagen-like protein  54.78 
 
 
815 aa  72  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.957246  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3684  triple helix repeat-containing collagen  52.34 
 
 
468 aa  72  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  30.85 
 
 
3197 aa  71.6  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1925  triple helix repeat-containing collagen  41.14 
 
 
492 aa  71.6  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1608  collagen triple helix repeat protein  49.14 
 
 
1101 aa  72  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.712053 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1924  triple helix repeat-containing collagen  51.4 
 
 
466 aa  70.9  0.00000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2697  hypothetical protein  40.27 
 
 
382 aa  70.9  0.00000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2201  exosporium protein H  74.58 
 
 
428 aa  70.5  0.00000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>