150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5091 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5091  FG-GAP repeat protein  100 
 
 
662 aa  1243    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.246094 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  38.83 
 
 
1838 aa  254  4.0000000000000004e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  41.94 
 
 
1118 aa  243  9e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  39.02 
 
 
2194 aa  240  5e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  42.54 
 
 
1340 aa  238  2e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  42.22 
 
 
1113 aa  231  4e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  40.15 
 
 
1222 aa  230  5e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  41.97 
 
 
1225 aa  230  6e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1773  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  38.42 
 
 
889 aa  228  4e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.403539  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  38.84 
 
 
1019 aa  216  9.999999999999999e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0893  Collagen triple helix repeat protein  37.14 
 
 
644 aa  214  2.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216124  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  36.29 
 
 
616 aa  214  3.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0599  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  34.09 
 
 
1012 aa  194  4e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387425  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3936  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.16 
 
 
1009 aa  188  3e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00889284  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  35.01 
 
 
2807 aa  187  7e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0616  FG-GAP repeat-containing protein  41.11 
 
 
386 aa  181  4e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0513696  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0620  FG-GAP repeat-containing protein  39.44 
 
 
412 aa  179  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.146794  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0666  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.85 
 
 
891 aa  174  5e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1026  C-type lectin  29.38 
 
 
4379 aa  171  4e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  34.51 
 
 
1557 aa  169  2e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1928  FG-GAP repeat-containing protein  34.45 
 
 
872 aa  158  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6310  FG-GAP repeat protein  33.33 
 
 
828 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1814  FG-GAP repeat-containing protein  34.01 
 
 
554 aa  142  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000122942  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2386  FG-GAP repeat protein  36.36 
 
 
657 aa  140  6e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0794745  decreased coverage  0.00143024 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  34.46 
 
 
813 aa  140  7.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  33.43 
 
 
1490 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3449  Collagen triple helix repeat protein  32.28 
 
 
663 aa  132  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.344079  normal  0.0780597 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  30.54 
 
 
1126 aa  127  4.0000000000000003e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1597  hypothetical protein  31.22 
 
 
1289 aa  123  9.999999999999999e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  32.76 
 
 
1275 aa  121  3.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  32.09 
 
 
974 aa  110  8.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4500  Collagen triple helix repeat protein  32.14 
 
 
685 aa  109  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.491219  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  34.1 
 
 
3197 aa  101  5e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4093  integrin-like protein  30.82 
 
 
494 aa  97.8  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4710  integrin-like protein  32.36 
 
 
604 aa  97.8  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2273  integrin-like protein  28.38 
 
 
472 aa  94.4  6e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.328252  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3594  integrin-like protein  27.69 
 
 
485 aa  90.1  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2274  integrin-like protein  31.89 
 
 
469 aa  84.3  0.000000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.474236  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  30.33 
 
 
1127 aa  78.2  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1605  coagulation factor 5/8 type domain protein  47.62 
 
 
1212 aa  77.8  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.232079 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  30.47 
 
 
3197 aa  77  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1405  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.78 
 
 
959 aa  73.9  0.000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0460  integrin-like protein  29.1 
 
 
1124 aa  73.2  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.849275 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0727  Integrins alpha chain  30.25 
 
 
447 aa  70.5  0.00000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000587794  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1458  FG-GAP repeat protein  27.91 
 
 
510 aa  70.5  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.664188  normal  0.305041 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3360  low-density lipoprotein receptor YWTD repeat protein  44.23 
 
 
772 aa  69.7  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0508989 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1066  hypothetical protein  39.82 
 
 
1193 aa  69.7  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0974046 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1842  hypothetical protein  41.41 
 
 
161 aa  68.9  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3318  Integrins alpha chain  35.29 
 
 
456 aa  67.8  0.0000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.893609  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0982  peptidase M10A and M12B matrixin and adamalysin  27.91 
 
 
470 aa  67.8  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.768142  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3294  coagulation factor 5/8 type domain protein  40.2 
 
 
1109 aa  67.4  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2945  TPR repeat-containing protein  30.29 
 
 
1184 aa  67.4  0.0000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2320  FG-GAP repeat-containing protein  24.79 
 
 
437 aa  66.6  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0600513  normal  0.0195588 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1470  Kelch repeat-containing protein  36.71 
 
 
586 aa  65.9  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00615821  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3577  FG-GAP repeat protein  30.9 
 
 
1022 aa  65.9  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00287898 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3370  Kelch repeat-containing protein  38.71 
 
 
642 aa  64.7  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.198533 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2160  hypothetical protein  41.59 
 
 
607 aa  64.3  0.000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.750892  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5033  coagulation factor 5/8 type domain protein  36.52 
 
 
1001 aa  64.3  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1728  hypothetical protein  35.96 
 
 
699 aa  63.9  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.463962  normal  0.652246 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0530  hypothetical protein  25.85 
 
 
1210 aa  63.5  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0010082  normal  0.0887655 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0487  hypothetical protein  24.76 
 
 
438 aa  62.8  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.153415 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5056  ASPIC/UnbV domain protein  31.01 
 
 
1113 aa  61.6  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.841506 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2327  FG-GAP repeat-containing protein  29.04 
 
 
803 aa  61.2  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.50278  decreased coverage  0.00347389 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2465  hypothetical protein  37.59 
 
 
608 aa  61.2  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0593  hypothetical protein  27.49 
 
 
435 aa  60.8  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0425  hypothetical protein  26.51 
 
 
569 aa  60.5  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.324197  normal  0.0116192 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4177  hypothetical protein  26.15 
 
 
517 aa  60.1  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.229175  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1617  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.06 
 
 
600 aa  59.7  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1450  hemolysin-type calcium-binding region  24.85 
 
 
917 aa  58.5  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0841616  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4229  FG-GAP repeat protein  27.51 
 
 
1527 aa  58.5  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.460586  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1438  ASPIC/UnbV domain protein  28.41 
 
 
593 aa  57.8  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0319  ASPIC/UnbV  28.37 
 
 
649 aa  57  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0713421  normal  0.920136 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3038  hypothetical protein  28.22 
 
 
524 aa  57  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.110831 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2897  hypothetical protein  32.24 
 
 
1575 aa  55.8  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0255386  normal  0.161029 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2807  FHA domain-containing protein  37.04 
 
 
1424 aa  55.5  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2066  multicopper oxidase type 2  32.73 
 
 
1736 aa  55.5  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.697525  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3010  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.11 
 
 
726 aa  55.5  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1760  ASPIC/UnbV domain protein  30.18 
 
 
1120 aa  54.7  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2178  Integrins alpha chain  27.82 
 
 
883 aa  53.9  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.297382  hitchhiker  0.000212806 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1240  YD repeat-containing protein  26.92 
 
 
1328 aa  53.5  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1673  FHA domain-containing protein  38.71 
 
 
1428 aa  52.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4648  hypothetical protein  46.58 
 
 
110 aa  53.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2914  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  28.87 
 
 
1035 aa  53.1  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.78 
 
 
11716 aa  52.4  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1924  FG-GAP repeat protein  39 
 
 
1029 aa  52  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0920  ASPIC/UnbV  27.78 
 
 
604 aa  51.6  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1158  YD repeat-containing protein  28.52 
 
 
1517 aa  52  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0480723  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01460  cell wall associated biofilm protein  26.67 
 
 
2239 aa  51.6  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0824  ASPIC/UnbV  25.23 
 
 
556 aa  51.6  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.853245 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5731  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  39.81 
 
 
1073 aa  51.2  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2165  Integrins alpha chain:multicopper oxidase, type 2  31.78 
 
 
1094 aa  51.2  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000701868 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5796  hypothetical protein  24.6 
 
 
521 aa  51.2  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.243702  normal  0.17082 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1355  hypothetical protein  28.78 
 
 
1638 aa  50.8  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6354  FG-GAP repeat protein  31.87 
 
 
423 aa  50.8  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.505611 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2472  ASPIC/UnbV domain protein  29.53 
 
 
1172 aa  50.8  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0642293  normal  0.355386 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1540  putative lipoprotein  23.26 
 
 
404 aa  50.1  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1747  ASPIC/UnbV domain protein  32.52 
 
 
574 aa  50.1  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1394  spore coat protein-related protein  29.41 
 
 
1303 aa  49.7  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.617881  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1759  ASPIC/UnbV domain protein  29.19 
 
 
1098 aa  49.7  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2942  ASPIC/UnbV domain-containing protein  32.91 
 
 
546 aa  49.7  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>