137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0599 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_0599  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  100 
 
 		 1012 aa  2005    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  64.03 
 
 		 1118 aa  1050    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  64.29 
 
 		 1113 aa  1040    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  62 
 
 		 1340 aa  1010    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1773  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  62.12 
 
 		 889 aa  1010    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.403539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3936  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  44.16 
 
 		 1009 aa  758    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00889284  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  62.74 
 
 		 1222 aa  1044    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  62.35 
 
 		 1225 aa  1018    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  57.19 
 
 		 2194 aa  618  1e-175  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0666  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  43.86 
 
 		 891 aa  563  1.0000000000000001e-159  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  54 
 
 		 1019 aa  329  2.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  42.52 
 
 		 1037 aa  239  3e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0620  FG-GAP repeat-containing protein  41.69 
 
 		 412 aa  219  2.9999999999999998e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.146794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  37.7 
 
 		 1838 aa  208  5e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0100  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  45.34 
 
 		 928 aa  207  7e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4998  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.9 
 
 		 1800 aa  201  6e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.329522  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6310  FG-GAP repeat protein  39.18 
 
 		 828 aa  196  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  32.65 
 
 		 1557 aa  189  3e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  35.18 
 
 		 2807 aa  184  9.000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0616  FG-GAP repeat-containing protein  38.14 
 
 		 386 aa  179  3e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0513696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1814  FG-GAP repeat-containing protein  33.76 
 
 		 554 aa  175  5e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000122942  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  35.25 
 
 		 813 aa  171  9e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2489  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  34.65 
 
 		 1661 aa  169  2.9999999999999998e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4429  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36.68 
 
 		 1269 aa  168  5e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.332356 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4367  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36.68 
 
 		 1269 aa  167  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  39.15 
 
 		 2305 aa  168  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  33.05 
 
 		 2310 aa  166  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1928  FG-GAP repeat-containing protein  33.64 
 
 		 872 aa  163  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0893  Collagen triple helix repeat protein  33.93 
 
 		 644 aa  162  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216124  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  37.84 
 
 		 768 aa  157  9e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  34.51 
 
 		 1275 aa  157  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1026  C-type lectin  28.18 
 
 		 4379 aa  151  5e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3855  hemolysin-type calcium-binding protein  32.47 
 
 		 1029 aa  147  7.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.460711  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  33.15 
 
 		 1490 aa  147  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  35.54 
 
 		 1126 aa  146  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.14 
 
 		 1029 aa  144  7e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.610735 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5091  FG-GAP repeat protein  36 
 
 		 662 aa  140  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.246094 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1597  hypothetical protein  32.39 
 
 		 1289 aa  134  7.999999999999999e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  33.15 
 
 		 974 aa  130  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0632  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.46 
 
 		 1415 aa  118  5e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0279  cadherin domain/calx-beta domain-containing protein  29.33 
 
 		 5899 aa  114  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1367  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.39 
 
 		 3396 aa  112  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.410312 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4710  integrin-like protein  34.34 
 
 		 604 aa  111  7.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30 
 
 		 1180 aa  106  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  30.27 
 
 		 616 aa  103  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2008  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.98 
 
 		 3168 aa  94.4  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2274  integrin-like protein  32.89 
 
 		 469 aa  89.4  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.474236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2273  integrin-like protein  25.06 
 
 		 472 aa  87  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.328252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4044  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  44.64 
 
 		 647 aa  85.9  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2386  FG-GAP repeat protein  28.05 
 
 		 657 aa  83.2  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0794745  decreased coverage  0.00143024 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  30.8 
 
 		 3197 aa  83.2  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3449  Collagen triple helix repeat protein  29.94 
 
 		 663 aa  82  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.344079  normal  0.0780597 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  35.23 
 
 		 7149 aa  82  0.00000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5094  conserved repeat domain protein  28.88 
 
 		 4013 aa  81.6  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2808  FHA domain-containing protein  37.04 
 
 		 894 aa  80.5  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1842  hypothetical protein  42.48 
 
 		 161 aa  79.3  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1450  hemolysin-type calcium-binding region  27.8 
 
 		 917 aa  79.3  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0841616  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  31.64 
 
 		 3197 aa  79  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0368  cadherin  34.86 
 
 		 5444 aa  77.8  0.0000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2106  hypothetical protein  30.12 
 
 		 1058 aa  75.5  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.866139  normal  0.660296 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3577  FG-GAP repeat protein  30.38 
 
 		 1022 aa  74.3  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00287898 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1893  peptidase-like  38.68 
 
 		 2632 aa  73.2  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1672  forkhead-associated protein  33.33 
 
 		 894 aa  73.2  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  23.73 
 
 		 8871 aa  72.4  0.00000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02371  hypothetical protein  25.42 
 
 		 2127 aa  72.4  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1892  peptidase-like  35.78 
 
 		 863 aa  70.5  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3408  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  38.78 
 
 		 547 aa  70.5  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.230394 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.81 
 
 		 11716 aa  70.5  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0360  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.51 
 
 		 1091 aa  69.7  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3594  integrin-like protein  28.67 
 
 		 485 aa  68.9  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1891  peptidase-like  36.36 
 
 		 1156 aa  68.2  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0870492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0642  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  34.51 
 
 		 2281 aa  67.8  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1087  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.16 
 
 		 5098 aa  67.8  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000320164 
 
 
-
 
NC_011734  PCC7424_5616  hypothetical protein  33.72 
 
 		 427 aa  67  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1405  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.79 
 
 		 959 aa  66.6  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4093  integrin-like protein  27.85 
 
 		 494 aa  65.9  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0727  Integrins alpha chain  31.36 
 
 		 447 aa  65.5  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000587794  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  34.21 
 
 		 2796 aa  65.5  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1974  peptidase-like  35.14 
 
 		 1594 aa  65.1  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.195376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0430  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.94 
 
 		 1092 aa  63.9  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.784359  hitchhiker  0.00134706 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0216  FG-GAP repeat protein  33.33 
 
 		 837 aa  63.5  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.560181  normal  0.665127 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1516  pectate lyase protein  25.99 
 
 		 1031 aa  62.8  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000206035  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29131  hypothetical protein  37.88 
 
 		 934 aa  62.4  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2814  peptidase-like  36.63 
 
 		 2334 aa  61.6  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1461  peptidase-like  33.1 
 
 		 715 aa  61.6  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.264021  normal  0.909062 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  26.89 
 
 		 1127 aa  60.8  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  31.68 
 
 		 16311 aa  60.1  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0460  integrin-like protein  31.76 
 
 		 1124 aa  60.5  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.849275 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3672  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  24.79 
 
 		 255 aa  60.1  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0168483 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  23.5 
 
 		 615 aa  59.3  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.94079 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3035  protease domain-containing protein  31.86 
 
 		 1053 aa  59.3  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.559762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3145  FG-GAP repeat protein  27.44 
 
 		 1346 aa  58.9  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3628  FG-GAP repeat protein  25.38 
 
 		 829 aa  57.8  0.0000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0477  FG-GAP repeat protein  33.82 
 
 		 466 aa  57.4  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00503985 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3318  Integrins alpha chain  31.88 
 
 		 456 aa  57.4  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.893609  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2398  FG-GAP repeat-containing protein  25.77 
 
 		 417 aa  56.6  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.276606  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003407  putative calcium-binding outer membrane-like protein  25.26 
 
 		 2042 aa  56.2  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1710  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  38.82 
 
 		 399 aa  55.5  0.000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4648  hypothetical protein  39.74 
 
 		 110 aa  55.1  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  24.72 
 
 		 4848 aa  55.1  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>