71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1750 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1750  ASPIC/UnbV domain-containing protein  100 
 
 		 526 aa  1061    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.678312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3172  ASPIC/UnbV  55.04 
 
 		 521 aa  459  9.999999999999999e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2002  hypothetical protein  42.64 
 
 		 492 aa  282  1e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.583711  normal  0.178712 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0824  ASPIC/UnbV  26.57 
 
 		 556 aa  133  6e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.853245 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0909  ASPIC/UnbV  23.63 
 
 		 593 aa  107  8e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.0377132 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2932  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.01 
 
 		 574 aa  98.2  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0476681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3034  ASPIC/UnbV domain protein  24.25 
 
 		 1129 aa  91.7  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.721984 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1684  ASPIC/UnbV  25.52 
 
 		 573 aa  89  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.478922 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1438  ASPIC/UnbV domain protein  27.43 
 
 		 593 aa  87  7e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2942  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.47 
 
 		 546 aa  85.9  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1690  integrin-like protein  23.54 
 
 		 562 aa  84  0.000000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0343612 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1753  ASPIC/UnbV domain protein  24.44 
 
 		 577 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1617  ASPIC/UnbV domain-containing protein  22.83 
 
 		 600 aa  82.4  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  23.63 
 
 		 1127 aa  74.7  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0919  ASPIC/UnbV  27.14 
 
 		 583 aa  73.6  0.000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.480457  normal  0.0168128 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2997  hypothetical protein  29.23 
 
 		 585 aa  72  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0217455  hitchhiker  0.0000181877 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5653  FG-GAP repeat protein  23.42 
 
 		 1208 aa  71.6  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2893  FG-GAP repeat-containing protein  32.11 
 
 		 566 aa  71.2  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6727  ASPIC/UnbV domain protein  21.82 
 
 		 1109 aa  70.5  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000293093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0920  ASPIC/UnbV  23.42 
 
 		 604 aa  69.7  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2331  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.5 
 
 		 585 aa  69.7  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092125 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1795  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.43 
 
 		 1228 aa  69.3  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.482089  normal  0.316892 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1751  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.41 
 
 		 737 aa  68.9  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.830192  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0319  ASPIC/UnbV  23.53 
 
 		 649 aa  68.6  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0713421  normal  0.920136 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1678  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.58 
 
 		 1066 aa  65.1  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0490  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.45 
 
 		 1225 aa  64.7  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.319917  normal  0.247742 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1623  ASPIC/UnbV domain-containing protein  32.98 
 
 		 551 aa  63.9  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5445  FG-GAP repeat protein  30.5 
 
 		 1203 aa  63.5  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0597  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.67 
 
 		 1208 aa  62.8  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1882  ASPIC/UnbV domain-containing protein  32.99 
 
 		 573 aa  61.6  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0826925 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2319  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.38 
 
 		 1192 aa  62  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.236252  normal  0.0252838 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3201  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25 
 
 		 1226 aa  61.6  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.949082  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0847  ASPIC/UnbV domain protein  30.46 
 
 		 482 aa  60.8  0.00000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0518  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.67 
 
 		 1193 aa  60.8  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.966806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1797  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.77 
 
 		 1246 aa  60.8  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2275  FG-GAP repeat-containing protein  28.19 
 
 		 604 aa  60.8  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1759  ASPIC/UnbV domain protein  23.88 
 
 		 1098 aa  60.5  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1760  ASPIC/UnbV domain protein  24.22 
 
 		 1120 aa  60.1  0.00000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2327  FG-GAP repeat-containing protein  29.63 
 
 		 803 aa  60.1  0.00000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.50278  decreased coverage  0.00347389 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2769  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.43 
 
 		 1040 aa  60.1  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.791466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2951  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.5 
 
 		 596 aa  60.1  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0418906  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0890  hypothetical protein  30.06 
 
 		 646 aa  59.7  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3233  ASPIC/UnbV domain-containing protein  32.64 
 
 		 1189 aa  58.9  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.017854 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0425  hypothetical protein  22.04 
 
 		 569 aa  59.3  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.324197  normal  0.0116192 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4948  ASPIC/UnbV domain protein  26.67 
 
 		 1183 aa  59.3  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.571754  normal  0.80828 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4587  ASPIC/UnbV domain protein  29.17 
 
 		 878 aa  58.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2324  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.51 
 
 		 1114 aa  57  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00426991 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4117  ASPIC/UnbV domain protein  33.58 
 
 		 655 aa  56.2  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0491  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.21 
 
 		 1236 aa  53.1  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2356  ASPIC/UnbV domain-containing protein  32.76 
 
 		 455 aa  53.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.57211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1747  ASPIC/UnbV domain protein  32.14 
 
 		 574 aa  52.4  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4738  ASPIC/UnbV domain protein  28.18 
 
 		 1127 aa  50.8  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.411918 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3980  FG-GAP repeat protein  45.33 
 
 		 1126 aa  50.8  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0419563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3076  ASPIC/UnbV domain protein  21.59 
 
 		 1107 aa  50.1  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2651  ATPase  30.95 
 
 		 752 aa  50.1  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000453711  normal  0.013056 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0695  ASPIC/UnbV domain protein  24.55 
 
 		 668 aa  49.7  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4979  secreted protein containing FG-GAP repeats  23.49 
 
 		 1098 aa  48.9  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.55758 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2953  ASPIC/UnbV domain-containing protein  31.55 
 
 		 1170 aa  48.9  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0362405  normal  0.571112 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0870  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.66 
 
 		 645 aa  48.9  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0868  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.45 
 
 		 638 aa  49.3  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3123  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.79 
 
 		 453 aa  47  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5056  ASPIC/UnbV domain protein  22.34 
 
 		 1113 aa  46.6  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.841506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3029  ASPIC/UnbV domain protein  22.52 
 
 		 1088 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0208708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5060  ASPIC/UnbV domain protein  33.33 
 
 		 1161 aa  45.8  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0911  hypothetical protein  27.43 
 
 		 664 aa  45.8  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4767  FG-GAP repeat protein  24.62 
 
 		 951 aa  45.4  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.47375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0746  Integrins alpha chain  31 
 
 		 681 aa  45.1  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.35 
 
 		 1340 aa  44.7  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00200  hypothetical protein  22.46 
 
 		 655 aa  44.7  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.846168  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1773  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  25.39 
 
 		 889 aa  43.5  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.403539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7001  hypothetical protein  23.82 
 
 		 658 aa  43.5  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.537258  hitchhiker  0.00183275 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>