More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1753 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1753  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 1014 aa  1962    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0398453 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  29.2 
 
 		 700 aa  197  8.000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  27.21 
 
 		 1085 aa  175  5e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0732  TPR repeat-containing protein  26.08 
 
 		 706 aa  170  1e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  23.99 
 
 		 3560 aa  160  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  23.58 
 
 		 4489 aa  157  1e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  25.03 
 
 		 3035 aa  156  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1755  TPR repeat-containing protein  27.86 
 
 		 647 aa  149  3e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0455441 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  28.18 
 
 		 654 aa  147  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1891  hypothetical protein  32.65 
 
 		 492 aa  146  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.591473 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  23.53 
 
 		 732 aa  144  8e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  26.83 
 
 		 667 aa  138  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3428  tetratricopeptide TPR_2  29.78 
 
 		 560 aa  136  3e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0384278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  21.02 
 
 		 909 aa  135  6e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  24.45 
 
 		 808 aa  134  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  24.91 
 
 		 1094 aa  131  6e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7846  hypothetical protein  32.99 
 
 		 452 aa  131  8.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.346388 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  26.9 
 
 		 761 aa  130  1.0000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1086  hypothetical protein  30.81 
 
 		 632 aa  127  8.000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  20.74 
 
 		 739 aa  125  5e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3091  hypothetical protein  25.23 
 
 		 680 aa  124  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677352  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0489  TPR repeat-containing protein  26.02 
 
 		 618 aa  123  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0261011  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1104  TPR repeat-containing protein  23.27 
 
 		 616 aa  123  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  21.17 
 
 		 816 aa  122  3e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0772  TPR repeat-containing protein  26.9 
 
 		 611 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447572  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1088  hypothetical protein  29.79 
 
 		 566 aa  120  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  19.4 
 
 		 750 aa  119  3e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1008  TPR repeat-containing protein  29.43 
 
 		 672 aa  116  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2288  TPR repeat-containing protein  28.43 
 
 		 740 aa  116  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4069  TPR repeat-containing protein  31.41 
 
 		 590 aa  115  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00017793  normal  0.44147 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3853  O-linked acetylglucosamine transferase  31.41 
 
 		 590 aa  114  9e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1161  hypothetical protein  28.21 
 
 		 637 aa  110  9.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.143311  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1547  hypothetical protein  28.27 
 
 		 459 aa  108  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.948596 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  25.79 
 
 		 739 aa  107  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.19 
 
 		 589 aa  106  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20301  hypothetical protein  25.12 
 
 		 395 aa  106  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.236649 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  24.06 
 
 		 968 aa  107  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1162  hypothetical protein  27.43 
 
 		 633 aa  106  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0720  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.98 
 
 		 570 aa  105  4e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.597499 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1160  hypothetical protein  27.18 
 
 		 630 aa  103  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.795058  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0451  TPR repeat-containing protein  26.52 
 
 		 574 aa  102  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.871153  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0327  hypothetical protein  24.22 
 
 		 657 aa  101  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.322162 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0359  hypothetical protein  24.12 
 
 		 657 aa  101  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.224796  normal  0.0716049 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  25.17 
 
 		 708 aa  98.2  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  24.42 
 
 		 789 aa  97.1  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2394  hypothetical protein  22.69 
 
 		 740 aa  96.7  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000509541  hitchhiker  0.0000624153 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1202  TPR repeat-containing protein  19.21 
 
 		 632 aa  97.1  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0452  TPR repeat-containing protein  27.26 
 
 		 569 aa  96.3  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.384213  normal  0.0840159 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0933  TPR repeat-containing protein  28.86 
 
 		 738 aa  96.3  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.450791  normal  0.93664 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0934  TPR repeat-containing protein  25.27 
 
 		 739 aa  95.9  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.897718 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3269  TPR repeat-containing protein  24.16 
 
 		 693 aa  95.1  6e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.306934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3331  TPR repeat-containing protein  24.94 
 
 		 633 aa  95.1  6e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.332967  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2411  hypothetical protein  25.84 
 
 		 582 aa  94.7  7e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.100681  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04549  tetratricopeptide repeat domain protein  26.43 
 
 		 568 aa  94.7  8e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0293  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 789 aa  94.4  9e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27710  glycosyl transferase,TPR repeat protein  25.28 
 
 		 1221 aa  94  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3824  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.11 
 
 		 1106 aa  93.6  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138221 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3037  TPR repeat-containing protein  23.41 
 
 		 717 aa  93.2  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3742  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.32 
 
 		 589 aa  92.8  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0346  TPR repeat-containing protein  23.66 
 
 		 739 aa  92.4  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.110262  normal  0.110805 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0122  TPR repeat-containing protein  21.86 
 
 		 660 aa  91.7  6e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.142603  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3361  TPR repeat-containing protein  29.02 
 
 		 750 aa  91.7  6e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311751 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2387  tetratricopeptide TPR_2  23.31 
 
 		 745 aa  91.3  7e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.625245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0256  hypothetical protein  24.21 
 
 		 719 aa  89.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2809  TPR repeat-containing protein  23.61 
 
 		 717 aa  89.7  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  26.05 
 
 		 713 aa  89.4  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  26.62 
 
 		 1106 aa  89  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2410  hypothetical protein  24.74 
 
 		 624 aa  88.6  5e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.361804  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2579  hypothetical protein  27.27 
 
 		 588 aa  86.3  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.385383  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1509  TPR domain-containing protein  21.66 
 
 		 699 aa  86.3  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000367862  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.89 
 
 		 632 aa  85.9  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0785  TPR repeat-containing protein  25.42 
 
 		 796 aa  83.2  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.225465  hitchhiker  0.00421983 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4067  hypothetical protein  22.72 
 
 		 747 aa  83.6  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0148  TPR repeat-containing protein  27.76 
 
 		 619 aa  83.2  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3955  TPR repeat-containing protein  24.77 
 
 		 776 aa  82.4  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  22.52 
 
 		 585 aa  82  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2822  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.5 
 
 		 529 aa  82  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3873  TPR repeat-containing protein  24.77 
 
 		 776 aa  82  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.661818  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  28.86 
 
 		 878 aa  82  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0094  TPR domain-containing protein  24.96 
 
 		 821 aa  81.6  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.822931  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0100  TPR domain-containing protein  24.57 
 
 		 790 aa  81.6  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  24.78 
 
 		 754 aa  81.3  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2876  TPR domain-containing protein  25.11 
 
 		 821 aa  80.9  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3099  TPR domain-containing protein  24.92 
 
 		 776 aa  80.9  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1668  TPR domain-containing protein  24.92 
 
 		 776 aa  80.9  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.329119  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  23.59 
 
 		 828 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5235  hypothetical protein  26.54 
 
 		 797 aa  80.5  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050699  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3451  TPR domain-containing protein  24.92 
 
 		 776 aa  80.9  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0799942  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  24.13 
 
 		 742 aa  80.9  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  25.17 
 
 		 754 aa  80.9  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  31.34 
 
 		 827 aa  80.9  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0863  TPR repeat-containing protein  23.02 
 
 		 647 aa  80.1  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399235 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0161  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 		 598 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1319  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 295 aa  80.5  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000490816  hitchhiker  8.5993e-22 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  22.76 
 
 		 1714 aa  79.3  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  22.8 
 
 		 718 aa  79  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28 
 
 		 810 aa  78.6  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  23.59 
 
 		 828 aa  78.2  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  24.25 
 
 		 3145 aa  76.6  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  24.66 
 
 		 828 aa  75.9  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.710571 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>