23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1785 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1785  FG-GAP repeat protein  100 
 
 		 413 aa  851    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.320028  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4537  FG-GAP repeat-containing protein  41.07 
 
 		 402 aa  293  5e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.578932 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6339  FG-GAP repeat protein  35.22 
 
 		 406 aa  241  2e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1655  FG-GAP repeat-containing protein  32.68 
 
 		 389 aa  181  2e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.418657  normal  0.573557 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3417  esterase  33.61 
 
 		 379 aa  181  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.745885  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0837  FG-GAP repeat protein  26.8 
 
 		 895 aa  70.5  0.00000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2527  FG-GAP repeat protein  25.21 
 
 		 1433 aa  53.9  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000205902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2273  integrin-like protein  28.65 
 
 		 472 aa  51.6  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.328252  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3929  FG-GAP repeat protein  28.39 
 
 		 407 aa  52.4  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  23.75 
 
 		 1126 aa  50.8  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4229  FG-GAP repeat protein  24.05 
 
 		 1527 aa  50.4  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.460586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2274  integrin-like protein  25.41 
 
 		 469 aa  48.5  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.474236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  23.2 
 
 		 616 aa  48.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6310  FG-GAP repeat protein  25.56 
 
 		 828 aa  46.2  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3148  FG-GAP repeat protein  22.64 
 
 		 1348 aa  46.2  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.589686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  24.27 
 
 		 1222 aa  45.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  21.79 
 
 		 1838 aa  45.4  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2699  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.28 
 
 		 655 aa  44.7  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.163426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4500  Collagen triple helix repeat protein  25.68 
 
 		 685 aa  44.7  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.491219  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1540  putative lipoprotein  20.69 
 
 		 404 aa  44.3  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2050  FG-GAP repeat protein  24.56 
 
 		 1437 aa  43.5  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0616  FG-GAP repeat-containing protein  23.12 
 
 		 386 aa  43.1  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0513696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1759  ASPIC/UnbV domain protein  26.17 
 
 		 1098 aa  43.1  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>