41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4122 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_4122  hypothetical protein  100 
 
 		 508 aa  1032    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4776  hypothetical protein  52.53 
 
 		 841 aa  110  7.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.174765  normal  0.0133719 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3594  integrin-like protein  27.1 
 
 		 485 aa  89.7  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2273  integrin-like protein  25.54 
 
 		 472 aa  75.1  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.328252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4093  integrin-like protein  24.67 
 
 		 494 aa  69.7  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3936  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  25.58 
 
 		 1009 aa  68.9  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00889284  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  24.41 
 
 		 1019 aa  64.7  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2274  integrin-like protein  28.5 
 
 		 469 aa  59.7  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.474236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  24.9 
 
 		 974 aa  58.2  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4181  phospholipase C  40.26 
 
 		 522 aa  57.8  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.424185  normal  0.508071 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  23.48 
 
 		 1557 aa  55.5  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  25.67 
 
 		 1490 aa  55.1  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.72 
 
 		 1222 aa  55.1  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  22.65 
 
 		 1838 aa  55.5  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0666  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.66 
 
 		 891 aa  54.7  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0616  FG-GAP repeat-containing protein  32.89 
 
 		 386 aa  53.1  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0513696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  25.91 
 
 		 1126 aa  52.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4733  hypothetical protein  29.37 
 
 		 506 aa  51.6  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.668304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  26.58 
 
 		 813 aa  51.6  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.67 
 
 		 1340 aa  50.8  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  23.56 
 
 		 2807 aa  50.8  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3327  metallophosphoesterase  32.95 
 
 		 492 aa  49.7  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.430138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0620  FG-GAP repeat-containing protein  24.48 
 
 		 412 aa  49.7  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.146794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0599  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.22 
 
 		 1012 aa  49.7  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.85 
 
 		 1118 aa  50.1  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0460  integrin-like protein  34.64 
 
 		 1124 aa  47.8  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.849275 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.54 
 
 		 1225 aa  47.4  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3318  Integrins alpha chain  25.37 
 
 		 456 aa  47.4  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.893609  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  24.53 
 
 		 1275 aa  47  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0727  Integrins alpha chain  25.97 
 
 		 447 aa  46.6  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000587794  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1773  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.89 
 
 		 889 aa  46.6  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.403539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.32 
 
 		 2194 aa  46.6  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1458  FG-GAP repeat protein  27.07 
 
 		 510 aa  46.6  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.664188  normal  0.305041 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.75 
 
 		 1113 aa  45.8  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4710  integrin-like protein  24.93 
 
 		 604 aa  44.7  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3038  hypothetical protein  27.7 
 
 		 524 aa  44.7  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.110831 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01580  conserved expressed protein  27.15 
 
 		 690 aa  44.3  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  25.06 
 
 		 1127 aa  43.9  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1928  FG-GAP repeat-containing protein  31.9 
 
 		 872 aa  43.9  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1597  hypothetical protein  30.67 
 
 		 1289 aa  43.9  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3449  Collagen triple helix repeat protein  32.05 
 
 		 663 aa  43.9  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.344079  normal  0.0780597 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>