More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0368 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_3258  putative outer membrane adhesin like protein  38.2 
 
 		 4214 aa  931    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.523735 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  39.82 
 
 		 7149 aa  1749    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  40.35 
 
 		 4678 aa  1602    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0368  cadherin  100 
 
 		 5444 aa  10460    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1601  hypothetical protein  35.49 
 
 		 6715 aa  580  1.0000000000000001e-163  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4139  putative outer membrane adhesin like proteiin  61.07 
 
 		 4122 aa  581  1.0000000000000001e-163  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0994  hypothetical protein  28.51 
 
 		 4874 aa  570  1e-160  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  31.85 
 
 		 6779 aa  543  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  31.74 
 
 		 16322 aa  500  1e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  50 
 
 		 4285 aa  409  1.0000000000000001e-112  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0581  PKD domain protein  32.91 
 
 		 1461 aa  403  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3642  putative outer membrane adhesin like protein  27.91 
 
 		 4791 aa  307  3.0000000000000004e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0478  outer membrane adhesin like proteiin  39.63 
 
 		 3259 aa  305  1e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0313  putative outer membrane adhesin like proteiin  47.98 
 
 		 4836 aa  269  1e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.971398 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  30.38 
 
 		 8321 aa  252  2e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  42.53 
 
 		 5839 aa  245  1e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  63.86 
 
 		 2768 aa  244  5e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  45.78 
 
 		 6662 aa  241  2e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  45.78 
 
 		 6683 aa  241  2e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  61.76 
 
 		 5442 aa  241  3e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4113  hypothetical protein  25.17 
 
 		 3562 aa  239  9e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0537133 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0436  putative outer membrane adhesin like proteiin  47.57 
 
 		 5787 aa  236  8.000000000000001e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4004  putative outer membrane adhesin like proteiin  43.59 
 
 		 2239 aa  229  8e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  42.06 
 
 		 5218 aa  198  3e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809343 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5060  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  40.15 
 
 		 5962 aa  191  3e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.943676 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0168  surface adhesion protein, putative  37.59 
 
 		 8682 aa  177  5e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.810778 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0186  hypothetical protein  38.49 
 
 		 6753 aa  177  5e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306412 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0188  hypothetical protein  37.22 
 
 		 9030 aa  177  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220008 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  42.67 
 
 		 4848 aa  176  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0055  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  30.99 
 
 		 3314 aa  152  1.0000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1806  hemolysin-type calcium-binding region  32.98 
 
 		 3184 aa  152  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.387385 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2342  putative outer membrane adhesin like proteiin  51.19 
 
 		 2812 aa  152  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000136287 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  49.16 
 
 		 4220 aa  144  4.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  37.44 
 
 		 5171 aa  142  3.0000000000000003e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  37.56 
 
 		 2542 aa  131  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0510  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.25 
 
 		 2812 aa  129  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3766  hemolysin-type calcium-binding protein  34.69 
 
 		 1166 aa  127  5e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234003  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4137  putative outer membrane adhesin like proteiin  47.06 
 
 		 1599 aa  124  4.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00005  transcriptional regulator, AraC family with Parallel beta-helix repeat  27.18 
 
 		 8918 aa  122  1.9999999999999998e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4138  hypothetical protein  47.3 
 
 		 3182 aa  121  3.9999999999999997e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0594  von Willebrand factor, type A  28.4 
 
 		 686 aa  110  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.855968  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4208  autotransporter adhesin  28.63 
 
 		 3333 aa  104  5e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1227  cadherin domain-containing protein  34.83 
 
 		 2251 aa  101  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.63 
 
 		 1340 aa  99  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36.69 
 
 		 1113 aa  91.3  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1773  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36.84 
 
 		 889 aa  90.9  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.403539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36.69 
 
 		 1118 aa  90.5  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3936  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.51 
 
 		 1009 aa  89.4  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00889284  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2886  large repetitive protein  25.26 
 
 		 3824 aa  88.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.659132 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.53 
 
 		 1222 aa  87.8  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0314  putative outer membrane adhesin like proteiin  41.5 
 
 		 1553 aa  87  0.000000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0526571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.5 
 
 		 1225 aa  87  0.000000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001580  rTX toxin putative  45.38 
 
 		 2743 aa  86.7  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1367  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.02 
 
 		 3396 aa  85.5  0.00000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.410312 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  37.74 
 
 		 4854 aa  85.5  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1310  hypothetical protein  35.38 
 
 		 542 aa  83.2  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0330443  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2430  VBCS repeat-containing protein  39.18 
 
 		 3758 aa  82.8  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0531  hypothetical protein  30.79 
 
 		 850 aa  82  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.744468  normal  0.643161 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0666  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36.42 
 
 		 891 aa  82  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0699  structural toxin protein RtxA  37.8 
 
 		 7679 aa  80.9  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3017  VCBS repeat-containing protein  26.1 
 
 		 3739 aa  80.9  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0681  structural toxin protein RtxA  37.98 
 
 		 7919 aa  79.3  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  40.13 
 
 		 4106 aa  78.6  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  39.47 
 
 		 2704 aa  78.2  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0237  hypothetical protein  45.36 
 
 		 1006 aa  78.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0211048 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0599  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  34.86 
 
 		 1012 aa  77.8  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  47.17 
 
 		 1712 aa  76.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.87 
 
 		 2194 aa  76.6  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3686  parallel beta-helix repeat-containing protein  46.67 
 
 		 1066 aa  75.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.346515 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  27.38 
 
 		 5745 aa  76.3  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0479  outer membrane adhesin like proteiin  40.58 
 
 		 3229 aa  75.1  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  47.01 
 
 		 1424 aa  75.5  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1018  hypothetical protein  41.53 
 
 		 2767 aa  75.1  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.556407 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43897  predicted protein  36.92 
 
 		 2125 aa  74.3  0.00000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1877  hypothetical protein  39.58 
 
 		 1699 aa  74.7  0.00000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.070874 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0008  Hemolysin-type calcium-binding region  29.28 
 
 		 2336 aa  74.3  0.00000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  30.9 
 
 		 1037 aa  73.2  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0054  hypothetical protein  45.26 
 
 		 2353 aa  73.6  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0369  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.78 
 
 		 2067 aa  72.4  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.936845  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3051  hypothetical protein  42.61 
 
 		 1744 aa  72.8  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0100  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.7 
 
 		 928 aa  72.4  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0388  hypothetical protein  43.96 
 
 		 3263 aa  72.8  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0020  hemolysin-type calcium-binding protein  37.33 
 
 		 2890 aa  71.6  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  40.45 
 
 		 4978 aa  71.6  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  41.51 
 
 		 768 aa  71.2  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0006  von Willebrand factor type A  37.86 
 
 		 2452 aa  71.2  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  41.6 
 
 		 1883 aa  70.9  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1890  integrin, beta chain-like  56.25 
 
 		 663 aa  70.5  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0160  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.81 
 
 		 2156 aa  70.5  0.0000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000324  autotransporter adhesin  37.18 
 
 		 5123 aa  70.5  0.0000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4998  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  39.69 
 
 		 1800 aa  69.3  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.329522  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0306  hypothetical protein  37.59 
 
 		 1350 aa  69.3  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06128  hypothetical protein  51.32 
 
 		 6211 aa  68.9  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0563  type 1 secretion C-terminal target domain protein  25.66 
 
 		 1706 aa  68.2  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6214  hypothetical protein  41.18 
 
 		 1752 aa  67  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0213789 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6410  hypothetical protein  51.35 
 
 		 1781 aa  67  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.885103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  43.82 
 
 		 5769 aa  66.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3119  putative outer membrane adhesin like proteiin  24.7 
 
 		 3552 aa  64.7  0.00000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0912825 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  46.81 
 
 		 1236 aa  64.3  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0304  hypothetical protein  39.81 
 
 		 1806 aa  63.9  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>