265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0020 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0020  hemolysin-type calcium-binding protein  100 
 
 		 2890 aa  5564    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4328  cadherin domain-containing protein  30.17 
 
 		 2193 aa  317  1.9999999999999998e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.859375  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1672  beta strand repeat-containing protein  34.32 
 
 		 3391 aa  306  3.0000000000000004e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848841 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2493  serralysin  31.44 
 
 		 1631 aa  193  5e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0241163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0436  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.97 
 
 		 5787 aa  184  2.9999999999999997e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0279  cadherin domain/calx-beta domain-containing protein  32.97 
 
 		 5899 aa  177  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  28.57 
 
 		 7149 aa  168  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  27.8 
 
 		 4848 aa  135  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  34.27 
 
 		 1597 aa  127  2e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001580  rTX toxin putative  27.08 
 
 		 2743 aa  117  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.47 
 
 		 5839 aa  105  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0798  hypothetical protein  37.2 
 
 		 1538 aa  103  7e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2073  EF hand domain/PKD domain-containing protein  27.57 
 
 		 1779 aa  101  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.167028  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4139  putative outer membrane adhesin like proteiin  24.24 
 
 		 4122 aa  96.3  9e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000324  autotransporter adhesin  48.89 
 
 		 5123 aa  90.5  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1227  cadherin domain-containing protein  41.46 
 
 		 2251 aa  88.2  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06128  hypothetical protein  44.06 
 
 		 6211 aa  87.4  0.000000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3053  Ig family protein  26.2 
 
 		 3244 aa  87  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  26.82 
 
 		 6662 aa  86.7  0.000000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.82 
 
 		 6683 aa  86.3  0.000000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  25.6 
 
 		 4285 aa  85.1  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  29.83 
 
 		 3544 aa  84  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  26.01 
 
 		 6779 aa  81.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02371  hypothetical protein  24.07 
 
 		 2127 aa  80.1  0.0000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003407  putative calcium-binding outer membrane-like protein  50 
 
 		 2042 aa  79  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3233  hypothetical protein  26.91 
 
 		 4465 aa  79.3  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.226873 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4004  putative outer membrane adhesin like proteiin  24.46 
 
 		 2239 aa  78.2  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1504  cadherin  35.93 
 
 		 1421 aa  77.8  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0750801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2342  putative outer membrane adhesin like proteiin  52.63 
 
 		 2812 aa  77  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000136287 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  38.57 
 
 		 8321 aa  75.1  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.38 
 
 		 1884 aa  74.3  0.00000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0313  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.9 
 
 		 4836 aa  73.9  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.971398 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  44.79 
 
 		 4678 aa  73.9  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  50 
 
 		 2768 aa  73.2  0.00000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0168  surface adhesion protein, putative  38.41 
 
 		 8682 aa  72.4  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.810778 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0368  cadherin  37.33 
 
 		 5444 aa  71.6  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0188  hypothetical protein  37.68 
 
 		 9030 aa  71.2  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220008 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1197  PKD domain containing protein  24.81 
 
 		 2079 aa  70.5  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  45.74 
 
 		 1883 aa  70.5  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0388  hypothetical protein  39.09 
 
 		 3263 aa  70.1  0.0000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  48.72 
 
 		 5218 aa  68.9  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809343 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  46.91 
 
 		 4220 aa  68.9  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0563  type 1 secretion C-terminal target domain protein  32.99 
 
 		 1706 aa  69.3  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  25.64 
 
 		 3699 aa  68.9  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  44.21 
 
 		 2542 aa  68.6  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3160  hemolysin-type calcium-binding region  53.52 
 
 		 523 aa  67.8  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.243046 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43897  predicted protein  34.29 
 
 		 2125 aa  67.8  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  37.6 
 
 		 5442 aa  67.8  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2909  Serralysin  48.68 
 
 		 474 aa  67.8  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1553  Serralysin  48.68 
 
 		 476 aa  67.8  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0421  cadherin  29.96 
 
 		 1323 aa  66.6  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.859378 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02378  hypothetical protein  32.28 
 
 		 814 aa  66.6  0.000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0479  outer membrane adhesin like proteiin  23.96 
 
 		 3229 aa  66.2  0.000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  45.68 
 
 		 16322 aa  66.2  0.000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3808  outer membrane adhesin like proteiin  41.67 
 
 		 2524 aa  66.2  0.000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000355585 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1877  hypothetical protein  45.05 
 
 		 1699 aa  65.9  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.070874 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3258  putative outer membrane adhesin like protein  43.82 
 
 		 4214 aa  66.2  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.523735 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1806  hemolysin-type calcium-binding region  31.05 
 
 		 3184 aa  65.1  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.387385 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0594  von Willebrand factor, type A  39.47 
 
 		 686 aa  64.7  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.855968  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0470  Ig family protein  26 
 
 		 2853 aa  64.3  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  40.91 
 
 		 4106 aa  63.9  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0186  hypothetical protein  48.68 
 
 		 6753 aa  63.5  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306412 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  43.18 
 
 		 2704 aa  63.5  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3766  hemolysin-type calcium-binding protein  40.59 
 
 		 1166 aa  63.2  0.00000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234003  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5060  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  43.59 
 
 		 5962 aa  63.2  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.943676 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  24.78 
 
 		 3699 aa  63.2  0.00000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1337  Integrins alpha chain  39.18 
 
 		 1434 aa  63.2  0.00000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.153084  normal  0.903463 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4143  alkaline metalloproteinase precursor  42.67 
 
 		 479 aa  63.2  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.100514  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42310  hypothetical protein  43.62 
 
 		 858 aa  63.2  0.00000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.809887  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  31.07 
 
 		 4854 aa  62.4  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0676  VCBS  26.01 
 
 		 4661 aa  62.8  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000119465 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0210  serralysin  47.95 
 
 		 504 aa  62.4  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00868189 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2905  large repetitive protein  38.98 
 
 		 3824 aa  62  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2903  large repetitive protein  40.37 
 
 		 3721 aa  61.6  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0306  hypothetical protein  38.26 
 
 		 1350 aa  62  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  41.58 
 
 		 1180 aa  61.2  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3885  RTX cytolytic toxin protein A  41.25 
 
 		 1394 aa  60.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3017  VCBS repeat-containing protein  38.14 
 
 		 3739 aa  60.5  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  43.59 
 
 		 3209 aa  60.8  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  31.86 
 
 		 5769 aa  60.5  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  24.61 
 
 		 3927 aa  60.5  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48060  alkaline metalloproteinase precursor  44 
 
 		 479 aa  60.1  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0741923 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0729  hemolysin-type calcium-binding region  40.7 
 
 		 7072 aa  59.7  0.0000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.971517 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  40.19 
 
 		 4798 aa  59.3  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1450  hemolysin-type calcium-binding region  40.96 
 
 		 917 aa  58.9  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0841616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1310  hypothetical protein  41.11 
 
 		 542 aa  58.9  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0330443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4004  hemolysin-type calcium-binding region  45.78 
 
 		 424 aa  59.3  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2545  hemolysin-type calcium-binding region  40.7 
 
 		 4451 aa  59.3  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.15154 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0933  hypothetical protein  27.71 
 
 		 2636 aa  58.5  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1619  cadherin  28.25 
 
 		 1202 aa  58.2  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42147  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1979  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.77 
 
 		 3038 aa  58.2  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.109352 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3849  calcium-binding protein, hemolysin-type  31.06 
 
 		 768 aa  57.8  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.184239  normal  0.669368 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0367  Hemolysin-type calcium-binding region  44.05 
 
 		 726 aa  58.2  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  47.44 
 
 		 1424 aa  57.8  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6850  Hemolysin-type calcium-binding region  40.66 
 
 		 565 aa  58.2  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0412  beta-Ig-H3/fasciclin  49.35 
 
 		 510 aa  57.8  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.821212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3642  putative outer membrane adhesin like protein  49.18 
 
 		 4791 aa  57.8  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1796  hemolysin-type calcium-binding region  40.19 
 
 		 537 aa  57.8  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.47796  hitchhiker  0.00183267 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3258  cadherin  25.68 
 
 		 2454 aa  58.2  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104244 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  40.51 
 
 		 2701 aa  57.4  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>