297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2545 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0729  hemolysin-type calcium-binding region  86.74 
 
 
7072 aa  5541    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.971517 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2545  hemolysin-type calcium-binding region  100 
 
 
4451 aa  8473    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.15154 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43897  predicted protein  25.25 
 
 
2125 aa  172  1e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0388  hypothetical protein  23.95 
 
 
3263 aa  116  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4208  autotransporter adhesin  23.91 
 
 
3333 aa  80.9  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2503  hypothetical protein  25.94 
 
 
2489 aa  79  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.260274 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0313  putative outer membrane adhesin like proteiin  45.28 
 
 
4836 aa  73.2  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.971398 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  46.07 
 
 
2145 aa  73.6  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0783  outer membrane adhesin like proteiin  24.92 
 
 
4748 aa  71.6  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0798  hypothetical protein  49.35 
 
 
1538 aa  71.2  0.0000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  43.4 
 
 
4687 aa  68.6  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  44 
 
 
2689 aa  67.4  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3160  hemolysin-type calcium-binding region  48 
 
 
523 aa  66.2  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.243046 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  36.59 
 
 
5769 aa  65.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0379  VCBS  58.93 
 
 
7284 aa  63.9  0.00000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.943155 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1361  hypothetical protein  28.5 
 
 
2329 aa  63.9  0.00000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0713283 
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  36.36 
 
 
4106 aa  63.5  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.14 
 
 
1016 aa  63.2  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  32.63 
 
 
5218 aa  63.2  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.809343 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3664  hemolysin-type calcium-binding region  42 
 
 
678 aa  62.4  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.157401  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3766  hemolysin-type calcium-binding protein  44.71 
 
 
1166 aa  62  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234003  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3885  RTX cytolytic toxin protein A  42.35 
 
 
1394 aa  61.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0186  hypothetical protein  43.68 
 
 
6753 aa  60.8  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.306412 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2577  hemolysin-type calcium-binding region  50.79 
 
 
1383 aa  60.5  0.0000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0100249  normal  0.0162919 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0327  hemolysin-type calcium binding protein  46.99 
 
 
1814 aa  60.1  0.0000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0391395  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  24.71 
 
 
2768 aa  59.3  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1441  Ig family protein  40 
 
 
2245 aa  59.7  0.000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.195412  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0054  hypothetical protein  31.03 
 
 
2353 aa  59.7  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4079  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  37.38 
 
 
485 aa  59.3  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237943  normal  0.0279439 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  51.72 
 
 
588 aa  60.1  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  50 
 
 
4798 aa  58.9  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2342  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.5 
 
 
2812 aa  59.3  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000136287 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5060  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  34.78 
 
 
5962 aa  59.3  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.943676 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1100  hemolysin-type calcium-binding region  53.7 
 
 
2345 aa  58.9  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.400206 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0791  heme peroxidase  49.3 
 
 
2950 aa  59.3  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  44.54 
 
 
518 aa  59.3  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0020  hemolysin-type calcium-binding protein  40.7 
 
 
2890 aa  59.3  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0398  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.77 
 
 
1073 aa  58.2  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  58 
 
 
1180 aa  58.5  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  33.82 
 
 
2542 aa  58.2  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  43.18 
 
 
4678 aa  58.5  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14361  hypothetical protein  50 
 
 
4723 aa  58.2  0.000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  45.45 
 
 
460 aa  57.8  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  50.77 
 
 
2667 aa  58.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3665  endonuclease/exonuclease/phosphatase  51.85 
 
 
1052 aa  57.8  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.27613 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2777  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  39.18 
 
 
1372 aa  57.8  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.878054  decreased coverage  0.00575711 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3408  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  43.24 
 
 
547 aa  57.8  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.230394 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6074  hypothetical protein  49.33 
 
 
3734 aa  57.8  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  42.31 
 
 
7149 aa  57.8  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  45.45 
 
 
2954 aa  57.8  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  26.51 
 
 
4848 aa  57.4  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  47.14 
 
 
3209 aa  57.4  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0380  VCBS  35.25 
 
 
1586 aa  57.4  0.000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.101859  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1806  hemolysin-type calcium-binding region  32.26 
 
 
3184 aa  57.4  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.387385 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0405  hemolysin-type calcium-binding region  51.85 
 
 
709 aa  57.4  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2705  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  50.79 
 
 
517 aa  57.4  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0718596 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  37.96 
 
 
980 aa  57.4  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1161  Hemolysin-type calcium-binding region  46.97 
 
 
2537 aa  57.4  0.000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3521  hypothetical protein  47.22 
 
 
161 aa  57.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0357588  normal  0.598556 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0055  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  50.82 
 
 
3314 aa  57  0.000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3374  hemolysin-type calcium-binding region  40.83 
 
 
491 aa  57  0.000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.337821 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  39.47 
 
 
1424 aa  57  0.000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  44.16 
 
 
2668 aa  56.6  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0050  hemolysin-type calcium-binding region  48.44 
 
 
2296 aa  56.6  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.133604 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  41.18 
 
 
1236 aa  56.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0797  outer membrane adhesin like proteiin  40.71 
 
 
1141 aa  56.6  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000422857  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3933  PKD domain containing protein  47.46 
 
 
1502 aa  56.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114839  normal  0.527223 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2424  glycoside hydrolase family protein  45.9 
 
 
467 aa  56.2  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.443188 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  44.07 
 
 
3598 aa  56.2  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2502  Hemolysin-type calcium-binding region  46.67 
 
 
361 aa  56.2  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263018  normal  0.592505 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  43.68 
 
 
3427 aa  56.6  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0168  surface adhesion protein, putative  42.53 
 
 
8682 aa  56.2  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.810778 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  36.94 
 
 
1532 aa  55.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3074  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  50 
 
 
855 aa  55.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0479509  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  31.58 
 
 
1883 aa  55.5  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1337  Integrins alpha chain  52 
 
 
1434 aa  55.8  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.153084  normal  0.903463 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  42.86 
 
 
1712 aa  55.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2298  hemolysin-type calcium binding protein  50.85 
 
 
1480 aa  55.8  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.880239  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1599  hemolysin-type calcium-binding region  44.74 
 
 
303 aa  55.5  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0042965  normal  0.464742 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1795  Allergen V5/Tpx-1 family protein  49.18 
 
 
421 aa  55.5  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.797719 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1622  putative hemolysin precursor  45.33 
 
 
504 aa  55.8  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0615311 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3548  glycoside hydrolase family 16  44.59 
 
 
486 aa  55.8  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40260  hypothetical protein  34.11 
 
 
2456 aa  55.5  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.702086  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1877  hypothetical protein  48.15 
 
 
1699 aa  55.1  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.070874 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  45.33 
 
 
1079 aa  55.1  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2204  peptidase M23  50.85 
 
 
999 aa  55.1  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2686  lipase, class 3  45.9 
 
 
617 aa  55.5  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.458877  unclonable  0.0000292693 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0721  hemolysin-type calcium-binding region  40 
 
 
1764 aa  55.1  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  31.54 
 
 
1557 aa  55.1  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1664  hemolysin-type calcium-binding region  39.53 
 
 
741 aa  55.1  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.273862  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  48.33 
 
 
2885 aa  55.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1619  cadherin  37.36 
 
 
1202 aa  55.1  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42147  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  37.13 
 
 
1363 aa  55.1  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0188  hypothetical protein  42.53 
 
 
9030 aa  55.5  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0220008 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0436  putative outer membrane adhesin like proteiin  41.1 
 
 
5787 aa  55.1  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1981  hemolysin-type calcium-binding region  39.53 
 
 
734 aa  54.7  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3615  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  53.33 
 
 
868 aa  54.7  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.705484  normal  0.0425486 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6850  Hemolysin-type calcium-binding region  50 
 
 
565 aa  54.3  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  43.24 
 
 
260 aa  54.7  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.65 
 
 
4220 aa  54.3  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>