30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0736 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0736  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  100 
 
 		 1021 aa  1989    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0279  cadherin domain/calx-beta domain-containing protein  27.77 
 
 		 5899 aa  144  7e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1516  pectate lyase protein  25.91 
 
 		 1031 aa  112  4.0000000000000004e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000206035  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.24 
 
 		 1340 aa  111  7.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1707  peptidase domain protein  39.01 
 
 		 365 aa  107  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000297847 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4998  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.67 
 
 		 1800 aa  95.5  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.329522  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.03 
 
 		 1029 aa  82  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.610735 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3855  hemolysin-type calcium-binding protein  26.85 
 
 		 1029 aa  80.9  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.460711  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.52 
 
 		 1225 aa  77.4  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  24.88 
 
 		 2194 aa  77.8  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1389  hypothetical protein  40.16 
 
 		 152 aa  76.3  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.236297 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0786  protein of unknown function DUF1555  36.07 
 
 		 229 aa  75.5  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0760  protein of unknown function DUF1555  36.07 
 
 		 229 aa  74.7  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.34 
 
 		 1222 aa  69.7  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26.73 
 
 		 1113 aa  68.6  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26.87 
 
 		 1118 aa  66.2  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5094  conserved repeat domain protein  24.97 
 
 		 4013 aa  65.5  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4367  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  24.51 
 
 		 1269 aa  65.1  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4429  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  24.65 
 
 		 1269 aa  63.9  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.332356 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3936  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26.8 
 
 		 1009 aa  62.8  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00889284  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1773  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26.45 
 
 		 889 aa  57.8  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.403539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  29.95 
 
 		 1037 aa  55.8  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.28 
 
 		 768 aa  53.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2489  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  23.48 
 
 		 1661 aa  51.6  0.00008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1367  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.21 
 
 		 3396 aa  50.1  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.410312 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0632  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  38.3 
 
 		 1415 aa  50.1  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0666  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  24.47 
 
 		 891 aa  48.9  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  27.93 
 
 		 2310 aa  48.9  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  34.15 
 
 		 16311 aa  47  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2008  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.1 
 
 		 3168 aa  45.8  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>