233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3147 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_3147  Aminopeptidase Y  100 
 
 
513 aa  1023    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.248558  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0141  Aminopeptidase Y  52.43 
 
 
506 aa  390  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10423  lipoprotein aminopeptidase lpqL  48.3 
 
 
500 aa  377  1e-103  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0596975  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01630  aminopeptidase Y  48.35 
 
 
509 aa  373  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.777606  normal  0.140751 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2343  Aminopeptidase Y  42.45 
 
 
512 aa  364  2e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.362822  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0543  aminopeptidase Y  45.45 
 
 
501 aa  357  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.207964  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0553  aminopeptidase Y  45.26 
 
 
501 aa  355  1e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0565  aminopeptidase Y  45.26 
 
 
501 aa  355  1e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.234277 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0715  aminopeptidase Y  46.27 
 
 
502 aa  345  1e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0168155 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0754  Aminopeptidase S  44.92 
 
 
512 aa  341  2e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0190  aminopeptidase Y  46.94 
 
 
510 aa  338  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0554  aminopeptidase Y  47.71 
 
 
479 aa  326  5e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.293801  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0566  aminopeptidase Y  47.71 
 
 
479 aa  326  5e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0537512 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0716  aminopeptidase Y  44.73 
 
 
488 aa  324  3e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.841416  normal  0.0176108 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0544  aminopeptidase Y  47.49 
 
 
479 aa  323  4e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.282981  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8952  Aminopeptidase Y  42.89 
 
 
515 aa  318  1e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0749  Aminopeptidase Y  44.32 
 
 
512 aa  315  9e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3246  aminopeptidase Y  41.54 
 
 
518 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.765312  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26020  putative aminopeptidase  41.7 
 
 
536 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.394851 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0189  aminopeptidase Y  45.38 
 
 
488 aa  311  1e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2223  putative aminopeptidase  41.7 
 
 
535 aa  311  2e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0927  Aminopeptidase Y  42.42 
 
 
548 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464767  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3913  Aminopeptidase Y  43.04 
 
 
512 aa  296  5e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08445  aminopeptidase Y, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00650)  41.26 
 
 
503 aa  290  3e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0141  peptidase M28  44.15 
 
 
524 aa  290  3e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.481582 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2403  aminopeptidase Y  40.91 
 
 
512 aa  286  8e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.204184  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0793  Aminopeptidase Y  43.24 
 
 
514 aa  285  2.0000000000000002e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1182  Aminopeptidase Y  43.9 
 
 
481 aa  279  9e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0344  Aminopeptidase Y  38.79 
 
 
534 aa  271  2e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138174  normal  0.69761 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3548  aminopeptidase Y  39.05 
 
 
555 aa  268  2e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0650469 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89245  Aminopeptidase yscIII Transferrin receptor  35.14 
 
 
533 aa  250  5e-65  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1408  aminopeptidase Y  55.51 
 
 
518 aa  250  5e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1367  aminopeptidase Y  55.98 
 
 
519 aa  248  1e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.227193  hitchhiker  0.000286251 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0792  Aminopeptidase S  55.36 
 
 
502 aa  244  3.9999999999999997e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03918  aminopeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00220)  35.1 
 
 
502 aa  243  7e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0943032 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4953  Aminopeptidase Y  43.61 
 
 
312 aa  179  8e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000539028  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3895  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  44.54 
 
 
1077 aa  178  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1707  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  45.85 
 
 
1147 aa  177  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.255269 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0075  peptidase M28  42.06 
 
 
947 aa  162  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11414  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3786  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  39.91 
 
 
1131 aa  157  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.550121  normal  0.857915 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5560  peptidase M28  39.83 
 
 
437 aa  138  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5720  peptidase M28  35.02 
 
 
313 aa  137  7.000000000000001e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.311136  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2070  peptidase M28  37.87 
 
 
309 aa  129  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.316925  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1604  peptidase M28  37.79 
 
 
291 aa  128  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.548091 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0686  peptidase M28  33.67 
 
 
391 aa  121  3e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5470  putative aminopeptidase  26.22 
 
 
466 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.155221 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3876  peptidase M28  26.64 
 
 
466 aa  98.6  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5488  aminopeptidase, putative  24.75 
 
 
466 aa  98.2  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5156  peptidase M28  25.77 
 
 
465 aa  98.2  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5056  aminopeptidase  25.34 
 
 
466 aa  97.8  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.418047  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5537  putative aminopeptidase  25.15 
 
 
466 aa  97.8  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5040  aminopeptidase  25.34 
 
 
466 aa  97.8  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5450  putative aminopeptidase  25.81 
 
 
466 aa  97.4  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5208  aminopeptidase  25.81 
 
 
466 aa  96.3  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0274505  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5606  aminopeptidase  25.81 
 
 
466 aa  96.3  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5481  putative aminopeptidase  26.79 
 
 
466 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5215  peptidase M28  31.27 
 
 
450 aa  88.6  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.05114  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1537  peptidase M28  27.12 
 
 
571 aa  82.8  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000191422 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2848  aminopeptidase  23.82 
 
 
457 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000136315 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0844  peptidase M28  35.48 
 
 
539 aa  75.1  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0653  peptidase M28  26.28 
 
 
438 aa  74.7  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.602384  normal  0.117412 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4736  peptidase M28  28.7 
 
 
497 aa  73.2  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.517188  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0319  peptidase M28  30.42 
 
 
416 aa  73.2  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5675  peptidase M28  22.99 
 
 
457 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00555231 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0415  peptidase M28  28.37 
 
 
440 aa  70.9  0.00000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3997  peptidase M28  29.56 
 
 
456 aa  70.9  0.00000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.664765  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2406  peptidase M28  27.61 
 
 
584 aa  70.5  0.00000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00346495  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2986  peptidase M28  28.63 
 
 
775 aa  68.2  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1360  peptidase M28  29.22 
 
 
454 aa  68.6  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4110  peptidase M28  25.55 
 
 
487 aa  67.4  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2895  peptidase M28  31.64 
 
 
481 aa  65.5  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0744794  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0862  peptidase M28  30.73 
 
 
574 aa  64.3  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.104433  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3044  peptidase M28  27.39 
 
 
468 aa  64.3  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000101958  normal  0.29803 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1960  peptidases M20 and M28  27.8 
 
 
333 aa  63.9  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0902014  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1817  peptidase M28  26.29 
 
 
559 aa  64.3  0.000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1155  peptidase M28  24.4 
 
 
462 aa  63.5  0.000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.447711  normal  0.173867 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0237  peptidase M28  27.21 
 
 
471 aa  63.5  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.706232 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1286  peptidase M28  30.3 
 
 
466 aa  62  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000415736  normal  0.392366 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  26.04 
 
 
598 aa  62.4  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2962  peptidase M28  27.83 
 
 
468 aa  62.4  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00173052  normal  0.676879 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3142  peptidase M28  27.83 
 
 
468 aa  62.4  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000890237  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1054  peptidase M28  24.42 
 
 
469 aa  61.6  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.580961  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0920  peptidases M20 and M28  28.24 
 
 
282 aa  61.2  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2728  peptidase M28  33.33 
 
 
481 aa  61.6  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349349  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0809  peptidase M28  38.95 
 
 
625 aa  60.8  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1116  peptidase M28  25.31 
 
 
468 aa  60.8  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000079399  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12058  peptidase, M28D family protein  28.24 
 
 
472 aa  60.1  0.00000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0600  peptidase M28  23.96 
 
 
555 aa  60.5  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.284248 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5038  peptidase M28  30.81 
 
 
944 aa  60.5  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.705528 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2222  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.98 
 
 
891 aa  59.3  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2112  peptidase M28  32.61 
 
 
1247 aa  59.7  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0150866  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0906  peptidase M28  37.14 
 
 
544 aa  59.3  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.53874  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2940  peptidase M28  43.37 
 
 
552 aa  58.9  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529928  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1664  peptidase M28  31.82 
 
 
479 aa  59.3  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1824  peptidase M28  36.13 
 
 
534 aa  59.3  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0419  hypothetical protein  40.59 
 
 
647 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3241  peptidase M28  26.91 
 
 
436 aa  58.2  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3240  peptidase M28  42.68 
 
 
468 aa  58.5  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0267852  normal  0.504623 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2289  peptidase M28  44.68 
 
 
338 aa  58.5  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1208  peptidase M28  45.71 
 
 
525 aa  58.2  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382894  decreased coverage  0.00811068 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>