205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0141 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0141  Aminopeptidase Y  100 
 
 
506 aa  1006    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01630  aminopeptidase Y  60.53 
 
 
509 aa  548  1e-155  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.777606  normal  0.140751 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0754  Aminopeptidase S  61.95 
 
 
512 aa  547  1e-154  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10423  lipoprotein aminopeptidase lpqL  51.31 
 
 
500 aa  410  1e-113  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0596975  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3147  Aminopeptidase Y  50.61 
 
 
513 aa  406  1.0000000000000001e-112  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.248558  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0543  aminopeptidase Y  48.5 
 
 
501 aa  376  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.207964  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0553  aminopeptidase Y  48.29 
 
 
501 aa  375  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0565  aminopeptidase Y  48.29 
 
 
501 aa  375  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.234277 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0715  aminopeptidase Y  48.46 
 
 
502 aa  375  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0168155 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0190  aminopeptidase Y  46.48 
 
 
510 aa  365  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0141  peptidase M28  49.33 
 
 
524 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.481582 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8952  Aminopeptidase Y  47.25 
 
 
515 aa  356  5e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2343  Aminopeptidase Y  46.34 
 
 
512 aa  346  5e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.362822  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0716  aminopeptidase Y  44.75 
 
 
488 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.841416  normal  0.0176108 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0927  Aminopeptidase Y  48.39 
 
 
548 aa  335  7.999999999999999e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464767  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3913  Aminopeptidase Y  45.47 
 
 
512 aa  330  3e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3246  aminopeptidase Y  44.79 
 
 
518 aa  330  3e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.765312  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2223  putative aminopeptidase  43.33 
 
 
535 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26020  putative aminopeptidase  43.23 
 
 
536 aa  327  3e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.394851 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0189  aminopeptidase Y  45.71 
 
 
488 aa  323  4e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1182  Aminopeptidase Y  49.43 
 
 
481 aa  323  6e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0544  aminopeptidase Y  46.77 
 
 
479 aa  322  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.282981  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2403  aminopeptidase Y  44.33 
 
 
512 aa  320  3.9999999999999996e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.204184  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0793  Aminopeptidase Y  43.92 
 
 
514 aa  320  5e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0554  aminopeptidase Y  46.1 
 
 
479 aa  317  3e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.293801  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0566  aminopeptidase Y  46.1 
 
 
479 aa  317  3e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0537512 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0749  Aminopeptidase Y  45.55 
 
 
512 aa  310  5.9999999999999995e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3548  aminopeptidase Y  43.76 
 
 
555 aa  297  3e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0650469 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0344  Aminopeptidase Y  43.22 
 
 
534 aa  291  3e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138174  normal  0.69761 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1367  aminopeptidase Y  56.44 
 
 
519 aa  268  2e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.227193  hitchhiker  0.000286251 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1408  aminopeptidase Y  62.16 
 
 
518 aa  265  1e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.499034 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08445  aminopeptidase Y, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00650)  40.57 
 
 
503 aa  263  4.999999999999999e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0792  Aminopeptidase S  54.23 
 
 
502 aa  256  8e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03918  aminopeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00220)  38.95 
 
 
502 aa  245  9.999999999999999e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0943032 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89245  Aminopeptidase yscIII Transferrin receptor  38.83 
 
 
533 aa  243  7.999999999999999e-63  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4953  Aminopeptidase Y  49.22 
 
 
312 aa  209  8e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000539028  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1707  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  50.22 
 
 
1147 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.255269 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3895  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  48.03 
 
 
1077 aa  197  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0075  peptidase M28  49.76 
 
 
947 aa  178  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11414  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3786  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  44.3 
 
 
1131 aa  162  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.550121  normal  0.857915 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5560  peptidase M28  41.13 
 
 
437 aa  152  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5720  peptidase M28  43.84 
 
 
313 aa  150  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.311136  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2070  peptidase M28  42.29 
 
 
309 aa  149  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.316925  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0686  peptidase M28  31.88 
 
 
391 aa  128  3e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1604  peptidase M28  36.84 
 
 
291 aa  124  6e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.548091 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5156  peptidase M28  27.22 
 
 
465 aa  89.4  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5215  peptidase M28  32.56 
 
 
450 aa  85.9  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.05114  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5470  putative aminopeptidase  25.14 
 
 
466 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.155221 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3876  peptidase M28  25.79 
 
 
466 aa  84.3  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5488  aminopeptidase, putative  25.79 
 
 
466 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5056  aminopeptidase  25.79 
 
 
466 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.418047  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5537  putative aminopeptidase  25.5 
 
 
466 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5040  aminopeptidase  25.79 
 
 
466 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5450  putative aminopeptidase  25.79 
 
 
466 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5208  aminopeptidase  25.79 
 
 
466 aa  82  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0274505  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5606  aminopeptidase  25.79 
 
 
466 aa  82  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5481  putative aminopeptidase  24.57 
 
 
466 aa  80.1  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1537  peptidase M28  27.83 
 
 
571 aa  77  0.0000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000191422 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3997  peptidase M28  26.89 
 
 
456 aa  73.9  0.000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.664765  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1155  peptidase M28  27.79 
 
 
462 aa  73.2  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.447711  normal  0.173867 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0415  peptidase M28  29.28 
 
 
440 aa  73.2  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3182  peptidase M28  38.51 
 
 
472 aa  66.2  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.569108  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2848  aminopeptidase  26.01 
 
 
457 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000136315 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0084  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  45.26 
 
 
860 aa  64.7  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000306364  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0653  peptidase M28  29.63 
 
 
438 aa  64.7  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.602384  normal  0.117412 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0919  peptidase M28  25.56 
 
 
467 aa  65.1  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000320691  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0844  peptidase M28  40.38 
 
 
539 aa  64.3  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3767  protease domain-containing protein  31.86 
 
 
1311 aa  63.9  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000363962 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0237  peptidase M28  25.5 
 
 
471 aa  63.9  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.706232 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1116  peptidase M28  25.77 
 
 
468 aa  63.5  0.000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000079399  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3998  peptidase M28  29.69 
 
 
440 aa  63.2  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.632162  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2940  peptidase M28  30.73 
 
 
552 aa  62.8  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529928  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2222  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.64 
 
 
891 aa  63.2  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4110  peptidase M28  23.82 
 
 
487 aa  63.2  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1150  peptidase M28  26.24 
 
 
468 aa  63.2  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000117786  normal  0.22119 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0809  peptidase M28  41.3 
 
 
625 aa  62  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1286  peptidase M28  26.3 
 
 
466 aa  62  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000415736  normal  0.392366 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5038  peptidase M28  25.89 
 
 
944 aa  61.6  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.705528 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2962  peptidase M28  27.95 
 
 
468 aa  61.2  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00173052  normal  0.676879 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3241  peptidase M28  27.41 
 
 
436 aa  61.2  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1208  peptidase M28  42.27 
 
 
525 aa  60.5  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382894  decreased coverage  0.00811068 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2112  peptidase M28  35.11 
 
 
1247 aa  60.5  0.00000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0150866  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1362  peptidase M28  29.1 
 
 
495 aa  60.5  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.162739  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  24.54 
 
 
598 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2895  peptidase M28  28.37 
 
 
481 aa  60.1  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0744794  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2728  peptidase M28  26.71 
 
 
481 aa  58.9  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349349  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02856  peptidase  25.07 
 
 
575 aa  58.9  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0319  peptidase M28  33.93 
 
 
416 aa  58.9  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2289  peptidase M28  42.7 
 
 
338 aa  59.3  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0419  hypothetical protein  37.84 
 
 
647 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0754  peptidase M28  28.18 
 
 
339 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.050482 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0600  peptidase M28  24.38 
 
 
555 aa  58.2  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.284248 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2308  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  42.17 
 
 
1776 aa  57.8  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5001  hypothetical protein  38.27 
 
 
1407 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2092  Glutamate carboxypeptidase II  30.33 
 
 
727 aa  57.8  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135334  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2866  hypothetical protein  35.56 
 
 
401 aa  57.4  0.0000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2986  peptidase M28  28.9 
 
 
775 aa  57.4  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04290  hypothetical protein  36.94 
 
 
647 aa  57.4  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00560134  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3368  peptidase M28  25.3 
 
 
459 aa  57.4  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3035  protease domain-containing protein  37.88 
 
 
1053 aa  57.4  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.559762  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>