230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_01630 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_01630  aminopeptidase Y  100 
 
 
509 aa  1034    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.777606  normal  0.140751 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0141  Aminopeptidase Y  61.38 
 
 
506 aa  521  1e-146  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0754  Aminopeptidase S  57.66 
 
 
512 aa  503  1e-141  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3147  Aminopeptidase Y  48.35 
 
 
513 aa  385  1e-106  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.248558  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10423  lipoprotein aminopeptidase lpqL  47.14 
 
 
500 aa  375  1e-103  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0596975  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0553  aminopeptidase Y  48.64 
 
 
501 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0565  aminopeptidase Y  48.64 
 
 
501 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.234277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0543  aminopeptidase Y  48.42 
 
 
501 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.207964  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8952  Aminopeptidase Y  47.29 
 
 
515 aa  352  7e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3246  aminopeptidase Y  45.26 
 
 
518 aa  351  2e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.765312  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3913  Aminopeptidase Y  46.47 
 
 
512 aa  344  2e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0715  aminopeptidase Y  44.09 
 
 
502 aa  345  2e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0168155 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2223  putative aminopeptidase  44.82 
 
 
535 aa  342  1e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0141  peptidase M28  48.44 
 
 
524 aa  342  1e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.481582 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1182  Aminopeptidase Y  46.98 
 
 
481 aa  341  2e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0190  aminopeptidase Y  45.31 
 
 
510 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2403  aminopeptidase Y  43.48 
 
 
512 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.204184  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26020  putative aminopeptidase  45.28 
 
 
536 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.394851 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0927  Aminopeptidase Y  48.82 
 
 
548 aa  333  4e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464767  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2343  Aminopeptidase Y  46.89 
 
 
512 aa  328  2.0000000000000001e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.362822  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3548  aminopeptidase Y  44.21 
 
 
555 aa  325  1e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0650469 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0749  Aminopeptidase Y  43.15 
 
 
512 aa  318  1e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0716  aminopeptidase Y  43.15 
 
 
488 aa  318  1e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.841416  normal  0.0176108 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0793  Aminopeptidase Y  43.84 
 
 
514 aa  309  1.0000000000000001e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0344  Aminopeptidase Y  43.84 
 
 
534 aa  306  5.0000000000000004e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138174  normal  0.69761 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08445  aminopeptidase Y, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00650)  43.99 
 
 
503 aa  299  6e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0544  aminopeptidase Y  43.67 
 
 
479 aa  298  1e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.282981  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0189  aminopeptidase Y  43.18 
 
 
488 aa  297  3e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1367  aminopeptidase Y  61.69 
 
 
519 aa  297  4e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.227193  hitchhiker  0.000286251 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0554  aminopeptidase Y  44.27 
 
 
479 aa  295  1e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.293801  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0566  aminopeptidase Y  44.27 
 
 
479 aa  295  1e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0537512 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1408  aminopeptidase Y  60.89 
 
 
518 aa  295  1e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0792  Aminopeptidase S  59.5 
 
 
502 aa  291  1e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03918  aminopeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00220)  37.42 
 
 
502 aa  268  1e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0943032 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89245  Aminopeptidase yscIII Transferrin receptor  41.08 
 
 
533 aa  246  6e-64  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4953  Aminopeptidase Y  49.38 
 
 
312 aa  219  6e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000539028  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1707  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  49.19 
 
 
1147 aa  219  8.999999999999998e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.255269 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3895  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  47.98 
 
 
1077 aa  214  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3786  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  48.25 
 
 
1131 aa  192  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.550121  normal  0.857915 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0075  peptidase M28  49.56 
 
 
947 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11414  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5720  peptidase M28  46.05 
 
 
313 aa  171  4e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.311136  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5560  peptidase M28  44.16 
 
 
437 aa  170  7e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2070  peptidase M28  41.22 
 
 
309 aa  170  7e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.316925  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1604  peptidase M28  39.71 
 
 
291 aa  137  4e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.548091 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0686  peptidase M28  34.15 
 
 
391 aa  120  6e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5481  putative aminopeptidase  29.3 
 
 
466 aa  97.4  5e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5470  putative aminopeptidase  29.41 
 
 
466 aa  96.7  8e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.155221 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5537  putative aminopeptidase  29.92 
 
 
466 aa  96.7  8e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5215  peptidase M28  29.45 
 
 
450 aa  96.3  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.05114  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5040  aminopeptidase  29.92 
 
 
466 aa  95.1  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5056  aminopeptidase  29.92 
 
 
466 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.418047  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5450  putative aminopeptidase  29.92 
 
 
466 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5208  aminopeptidase  29.92 
 
 
466 aa  94.7  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0274505  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5606  aminopeptidase  29.92 
 
 
466 aa  94.7  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5488  aminopeptidase, putative  29.64 
 
 
466 aa  94.4  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5156  peptidase M28  28.21 
 
 
465 aa  94.4  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3241  peptidase M28  31.79 
 
 
436 aa  89.4  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3997  peptidase M28  27.64 
 
 
456 aa  87.4  5e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.664765  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2406  peptidase M28  25.83 
 
 
584 aa  87.4  6e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00346495  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0415  peptidase M28  27.18 
 
 
440 aa  85.1  0.000000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3876  peptidase M28  25.97 
 
 
466 aa  84  0.000000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1537  peptidase M28  30.16 
 
 
571 aa  82.8  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000191422 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0653  peptidase M28  30.88 
 
 
438 aa  82  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.602384  normal  0.117412 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3182  peptidase M28  28.61 
 
 
472 aa  80.5  0.00000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.569108  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4736  peptidase M28  27.04 
 
 
497 aa  78.2  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.517188  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0844  peptidase M28  28.06 
 
 
539 aa  77  0.0000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4110  peptidase M28  25.69 
 
 
487 aa  75.5  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2848  aminopeptidase  27.85 
 
 
457 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000136315 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1093  peptidase M28  31.53 
 
 
454 aa  73.9  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1116  peptidase M28  25.75 
 
 
468 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000079399  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2728  peptidase M28  26.71 
 
 
481 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349349  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3998  peptidase M28  29.82 
 
 
440 aa  69.3  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.632162  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1155  peptidase M28  25.35 
 
 
462 aa  67.8  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.447711  normal  0.173867 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3990  peptidase M28  25.42 
 
 
447 aa  66.6  0.0000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.558433  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2940  peptidase M28  30.69 
 
 
552 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529928  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5001  hypothetical protein  43.02 
 
 
1407 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2962  peptidase M28  27.7 
 
 
468 aa  65.1  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00173052  normal  0.676879 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5031  subtilase domain-containing protein  43.02 
 
 
1407 aa  64.7  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4623  subtilisin-like serine protease  43.02 
 
 
1406 aa  64.7  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5011  minor extracellular protease VPR  43.02 
 
 
1407 aa  64.7  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3240  peptidase M28  27.8 
 
 
468 aa  64.3  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0267852  normal  0.504623 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2937  protease-associated PA  43.36 
 
 
730 aa  63.9  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1094  peptidase M28  26.33 
 
 
468 aa  63.9  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000099485  normal  0.0169877 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0919  peptidase M28  27.37 
 
 
467 aa  63.9  0.000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000320691  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1150  peptidase M28  25.06 
 
 
468 aa  63.5  0.000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000117786  normal  0.22119 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3142  peptidase M28  27.4 
 
 
468 aa  63.2  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000890237  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0319  peptidase M28  40 
 
 
416 aa  63.5  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3767  protease domain-containing protein  36 
 
 
1311 aa  63.2  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000363962 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1189  peptidase M28  27.21 
 
 
477 aa  63.2  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.157157  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2222  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.56 
 
 
891 aa  62  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1286  peptidase M28  27.82 
 
 
466 aa  62.4  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000415736  normal  0.392366 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3313  cold-active alkaline serine protease  26.24 
 
 
514 aa  62.4  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1049  peptidase M28  25.58 
 
 
468 aa  62  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000023249  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1360  peptidase M28  29.56 
 
 
454 aa  61.6  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0669  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.29 
 
 
728 aa  61.2  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5038  peptidase M28  23.8 
 
 
944 aa  60.8  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.705528 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1208  peptidase M28  43.53 
 
 
525 aa  60.8  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382894  decreased coverage  0.00811068 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2578  peptidase M28  28.94 
 
 
563 aa  60.5  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0256321  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2986  peptidase M28  30.49 
 
 
775 aa  60.1  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3044  peptidase M28  26.33 
 
 
468 aa  59.7  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000101958  normal  0.29803 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>