201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1362 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1362  peptidase M28  100 
 
 
495 aa  1013    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.162739  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2654  peptidase M28  40.05 
 
 
525 aa  281  2e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.423469 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12058  peptidase, M28D family protein  37.61 
 
 
472 aa  270  4e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2554  M28 family peptidase  37.45 
 
 
469 aa  268  2e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6038  peptidase M28  40.27 
 
 
454 aa  261  3e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0919  peptidase M28  38.46 
 
 
467 aa  259  6e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000320691  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1054  peptidase M28  36.83 
 
 
469 aa  252  9.000000000000001e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.580961  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3197  peptidase M28  39.32 
 
 
473 aa  251  2e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.815061  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1049  peptidase M28  37.64 
 
 
468 aa  249  6e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000023249  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2962  peptidase M28  38.05 
 
 
468 aa  248  2e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00173052  normal  0.676879 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1094  peptidase M28  38.83 
 
 
468 aa  248  2e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000099485  normal  0.0169877 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2895  peptidase M28  36.12 
 
 
481 aa  247  3e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0744794  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3182  peptidase M28  36.67 
 
 
472 aa  247  4e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.569108  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0237  peptidase M28  39.3 
 
 
471 aa  247  4e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.706232 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3518  peptidase M28  36.53 
 
 
463 aa  246  4.9999999999999997e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3044  peptidase M28  37.84 
 
 
468 aa  246  6.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000101958  normal  0.29803 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1150  peptidase M28  37.19 
 
 
468 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000117786  normal  0.22119 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2728  peptidase M28  37.06 
 
 
481 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349349  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3661  peptidase M28  37.69 
 
 
468 aa  244  1.9999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.21215 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3240  peptidase M28  37.19 
 
 
468 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0267852  normal  0.504623 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1116  peptidase M28  36.85 
 
 
468 aa  244  3e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000079399  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3142  peptidase M28  36.27 
 
 
468 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000890237  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1190  peptidase M28  36.6 
 
 
458 aa  243  5e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.786712 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1286  peptidase M28  37.09 
 
 
466 aa  243  6e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000415736  normal  0.392366 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1189  peptidase M28  36.7 
 
 
477 aa  241  2e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.157157  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0412  peptidase M28  35.35 
 
 
460 aa  236  8e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0420601  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3539  M28D family peptidase  38.65 
 
 
414 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02736  aminopeptidase  36.48 
 
 
471 aa  218  2e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.465186  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5666  Endoribonuclease L-PSP  34.69 
 
 
580 aa  218  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.106128  normal  0.852479 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1103  peptidase M28  38.37 
 
 
471 aa  212  1e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.608477  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2350  peptidase M28  35.06 
 
 
457 aa  187  4e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4736  peptidase M28  28.33 
 
 
497 aa  136  9e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.517188  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4110  peptidase M28  27.92 
 
 
487 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2848  peptidase M28  28.39 
 
 
526 aa  129  9.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.549527  normal  0.194902 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1208  peptidase M28  26.18 
 
 
525 aa  122  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382894  decreased coverage  0.00811068 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0844  peptidase M28  26.81 
 
 
539 aa  120  7.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2940  peptidase M28  23.85 
 
 
552 aa  118  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529928  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0906  peptidase M28  26.64 
 
 
544 aa  111  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.53874  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2040  peptidase M28  28.42 
 
 
578 aa  103  8e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.194253  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3997  peptidase M28  27.56 
 
 
456 aa  100  8e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.664765  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2907  peptidase M28  27.17 
 
 
463 aa  90.1  8e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3990  peptidase M28  27.31 
 
 
447 aa  89.7  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.558433  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5481  putative aminopeptidase  24.02 
 
 
466 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1155  peptidase M28  26.58 
 
 
462 aa  80.5  0.00000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.447711  normal  0.173867 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5488  aminopeptidase, putative  24.55 
 
 
466 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5450  putative aminopeptidase  23.94 
 
 
466 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0415  peptidase M28  26.62 
 
 
440 aa  78.2  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0421  aminopeptidase  32.84 
 
 
501 aa  78.2  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.131984  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5537  putative aminopeptidase  24.32 
 
 
466 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5040  aminopeptidase  24.32 
 
 
466 aa  77  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5056  aminopeptidase  24.32 
 
 
466 aa  77.4  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.418047  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0653  peptidase M28  25.78 
 
 
438 aa  77  0.0000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.602384  normal  0.117412 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5208  aminopeptidase  23.53 
 
 
466 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0274505  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5606  aminopeptidase  23.53 
 
 
466 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1093  peptidase M28  27.68 
 
 
454 aa  75.9  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0518  Glutamate carboxypeptidase II  25.21 
 
 
734 aa  75.9  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.925044  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3998  peptidase M28  24.71 
 
 
440 aa  75.1  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.632162  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1360  peptidase M28  25.63 
 
 
454 aa  74.7  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3109  protease-associated PA domain protein  26.01 
 
 
698 aa  74.7  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000536812  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0319  peptidase M28  28.62 
 
 
416 aa  74.7  0.000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5470  putative aminopeptidase  22.78 
 
 
466 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.155221 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3241  peptidase M28  26.38 
 
 
436 aa  72  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2466  glutamate carboxypeptidase II  25.55 
 
 
725 aa  72  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0461903  normal  0.618125 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5156  peptidase M28  23.62 
 
 
465 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0749  Aminopeptidase Y  33.33 
 
 
512 aa  68.2  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3876  peptidase M28  23.17 
 
 
466 aa  67.4  0.0000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0792  Aminopeptidase S  26.2 
 
 
502 aa  67  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2819  glutamate carboxypeptidase II  26.85 
 
 
757 aa  66.6  0.0000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.140178  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08546  Probable aminopeptidase  23.71 
 
 
491 aa  66.6  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1664  peptidase M28  25.79 
 
 
479 aa  65.9  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18700  predicted aminopeptidase  26.54 
 
 
678 aa  66.6  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.561115 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05516  aminopeptidase  30 
 
 
504 aa  66.6  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07020  leucyl aminopeptidase  30.2 
 
 
483 aa  65.9  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.384558  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2823  glutamate carboxypeptidase II  34.02 
 
 
712 aa  65.1  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.261678  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10423  lipoprotein aminopeptidase lpqL  25.81 
 
 
500 aa  65.1  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0596975  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2403  aminopeptidase Y  25 
 
 
512 aa  64.3  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.204184  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08445  aminopeptidase Y, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00650)  33.33 
 
 
503 aa  64.3  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1367  Glutamate carboxypeptidase II  37.25 
 
 
751 aa  63.5  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0341097  normal  0.079347 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6549  peptidase M28  27.4 
 
 
551 aa  63.5  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.657933  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3368  peptidase M28  24.78 
 
 
459 aa  63.2  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1817  peptidase M28  32.06 
 
 
559 aa  62.8  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4009  Glutamate carboxypeptidase II  34.58 
 
 
743 aa  62  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.677524  decreased coverage  0.0030346 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3301  leucyl aminopeptidase  31.94 
 
 
417 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177748  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5067  leucyl aminopeptidase  31.94 
 
 
417 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3414  aminopeptidase-like protein  29.38 
 
 
677 aa  61.6  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5218  leucyl aminopeptidase  31.94 
 
 
417 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02856  peptidase  37.23 
 
 
575 aa  61.2  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4201  peptidase M28  27.23 
 
 
346 aa  60.5  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.920242  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0029  peptidase M28  27.64 
 
 
548 aa  60.1  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5001  leucyl aminopeptidase  31.22 
 
 
417 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.341623  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4953  Aminopeptidase Y  26.41 
 
 
312 aa  59.7  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000539028  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0845  peptidase family protein  29.02 
 
 
384 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.292004  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4476  leucyl aminopeptidase  31.22 
 
 
417 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04925  glutamate carboxypeptidase Tre2, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G10650)  36.9 
 
 
884 aa  58.5  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0450501  normal  0.0918847 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0487  putative leucine aminopeptidase  29.32 
 
 
408 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2124  aminopeptidase  29.32 
 
 
408 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0245  peptidase M28  39.36 
 
 
550 aa  58.2  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0694  putative leucine aminopeptidase  29.32 
 
 
384 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.832714  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0990  putative leucine aminopeptidase  29.32 
 
 
384 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1962  putative leucine aminopeptidase  29.32 
 
 
384 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>