220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_07020 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_07020  leucyl aminopeptidase  100 
 
 
483 aa  992    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.384558  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2131  leucyl aminopeptidase  40.92 
 
 
523 aa  245  9.999999999999999e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.227059  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4476  leucyl aminopeptidase  42.6 
 
 
417 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0596  aminopeptidase Ap1  42.26 
 
 
417 aa  243  6e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5001  leucyl aminopeptidase  42.01 
 
 
417 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.341623  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0421  aminopeptidase  37.38 
 
 
501 aa  240  4e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.131984  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0694  putative leucine aminopeptidase  42.28 
 
 
384 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.832714  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0990  putative leucine aminopeptidase  42.28 
 
 
384 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1962  putative leucine aminopeptidase  42.28 
 
 
384 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0487  putative leucine aminopeptidase  42.28 
 
 
408 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2124  aminopeptidase  42.28 
 
 
408 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3301  leucyl aminopeptidase  41.72 
 
 
417 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177748  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5067  leucyl aminopeptidase  41.72 
 
 
417 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3414  aminopeptidase-like protein  42.58 
 
 
677 aa  238  2e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5218  leucyl aminopeptidase  41.42 
 
 
417 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0757  peptidase family protein  41.98 
 
 
408 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31218  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0845  peptidase family protein  42.28 
 
 
384 aa  237  3e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.292004  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1852  leucine aminopeptidase, putative  41.18 
 
 
408 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0188761  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05516  aminopeptidase  40.91 
 
 
504 aa  234  2.0000000000000002e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2866  hypothetical protein  35.96 
 
 
401 aa  184  3e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2729  hypothetical protein  36.28 
 
 
401 aa  183  5.0000000000000004e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0031  hypothetical protein  29.73 
 
 
397 aa  157  3e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0032  hypothetical protein  32.76 
 
 
397 aa  155  1e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28372  leucyl aminopeptidase precursor  36.73 
 
 
407 aa  140  4.999999999999999e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.36652 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1163  hypothetical protein  30.48 
 
 
398 aa  130  4.0000000000000003e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1158  hypothetical protein  30.48 
 
 
398 aa  129  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI04080  peptidase, putative  29.21 
 
 
402 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.321428  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07035  aminopeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04210)  30.93 
 
 
390 aa  110  6e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4953  Aminopeptidase Y  29.8 
 
 
312 aa  74.3  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000539028  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1367  aminopeptidase Y  28.08 
 
 
519 aa  71.6  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.227193  hitchhiker  0.000286251 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0792  Aminopeptidase S  30 
 
 
502 aa  70.5  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03479  probable aminopeptidase fused to fibronectin type 3 domain  31.8 
 
 
468 aa  70.1  0.00000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2289  peptidase M28  27.57 
 
 
338 aa  70.1  0.00000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3240  peptidase M28  41.38 
 
 
468 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0267852  normal  0.504623 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1049  peptidase M28  41.38 
 
 
468 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000023249  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3044  peptidase M28  41.38 
 
 
468 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000101958  normal  0.29803 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1054  peptidase M28  39.08 
 
 
469 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.580961  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0075  peptidase M28  30.67 
 
 
947 aa  67.8  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11414  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  29.05 
 
 
598 aa  67.8  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1408  aminopeptidase Y  25.57 
 
 
518 aa  67.8  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3142  peptidase M28  40.23 
 
 
468 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000890237  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1116  peptidase M28  40.23 
 
 
468 aa  66.6  0.0000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000079399  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2728  peptidase M28  38.89 
 
 
481 aa  65.9  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349349  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2962  peptidase M28  39.08 
 
 
468 aa  66.2  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00173052  normal  0.676879 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2895  peptidase M28  39.08 
 
 
481 aa  66.2  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0744794  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12058  peptidase, M28D family protein  34.19 
 
 
472 aa  65.9  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1286  peptidase M28  36.78 
 
 
466 aa  65.5  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000415736  normal  0.392366 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1362  peptidase M28  30.2 
 
 
495 aa  65.9  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.162739  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3182  peptidase M28  31.16 
 
 
472 aa  65.9  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.569108  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1208  peptidase M28  31.13 
 
 
525 aa  65.9  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382894  decreased coverage  0.00811068 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1150  peptidase M28  39.08 
 
 
468 aa  64.7  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000117786  normal  0.22119 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4736  peptidase M28  32.09 
 
 
497 aa  64.3  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.517188  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1094  peptidase M28  28.57 
 
 
468 aa  64.3  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000099485  normal  0.0169877 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1189  peptidase M28  34.38 
 
 
477 aa  63.5  0.000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.157157  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1065  peptidase M28  31.78 
 
 
455 aa  63.2  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.377443  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3197  peptidase M28  33.05 
 
 
473 aa  62  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.815061  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1679  peptidase M28  30 
 
 
459 aa  62.4  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3518  peptidase M28  30.51 
 
 
463 aa  61.6  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10643  Probable aminopeptidase fused to fibronectin type 3 domain  28.35 
 
 
450 aa  61.2  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0919  peptidase M28  35.87 
 
 
467 aa  61.2  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000320691  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1190  peptidase M28  28.05 
 
 
629 aa  61.2  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.909659  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0054  peptidase M28  25.25 
 
 
335 aa  60.5  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6038  peptidase M28  30.77 
 
 
454 aa  60.5  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18700  predicted aminopeptidase  38.89 
 
 
678 aa  59.3  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.561115 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0405  peptidase M28  35.78 
 
 
550 aa  59.3  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.446061  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1875  peptidase M28  31.03 
 
 
509 aa  59.7  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.967408  normal  0.215425 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2554  M28 family peptidase  37.76 
 
 
469 aa  58.9  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2819  glutamate carboxypeptidase II  40 
 
 
757 aa  58.9  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.140178  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0412  peptidase M28  30.51 
 
 
460 aa  58.2  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0420601  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0749  Aminopeptidase Y  29.6 
 
 
512 aa  57.8  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2940  peptidase M28  25.95 
 
 
552 aa  57.8  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529928  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5488  aminopeptidase, putative  29.68 
 
 
466 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3876  peptidase M28  28.57 
 
 
466 aa  57.8  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5156  peptidase M28  27.92 
 
 
465 aa  57.4  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0793  Aminopeptidase Y  28.57 
 
 
514 aa  57.4  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1103  peptidase M28  25.79 
 
 
471 aa  57  0.0000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.608477  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5040  aminopeptidase  29.68 
 
 
466 aa  56.6  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5056  aminopeptidase  29.68 
 
 
466 aa  56.6  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.418047  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3899  peptidase M28  28.66 
 
 
674 aa  56.2  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1949  peptidase M28  36.09 
 
 
439 aa  56.2  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0927  Aminopeptidase Y  36.21 
 
 
548 aa  55.8  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464767  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5537  putative aminopeptidase  29.68 
 
 
466 aa  56.6  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5450  putative aminopeptidase  29.68 
 
 
466 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5208  aminopeptidase  27.27 
 
 
466 aa  55.8  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0274505  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5606  aminopeptidase  27.27 
 
 
466 aa  55.8  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1031  peptidase M28  30.83 
 
 
563 aa  55.5  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418542  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1817  peptidase M28  33.06 
 
 
559 aa  55.5  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3155  peptidase M28  33.04 
 
 
436 aa  55.5  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000680764  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08756  aminopeptidase  27.55 
 
 
334 aa  54.7  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0052  peptidase M28  25.68 
 
 
308 aa  55.1  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000295021 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5470  putative aminopeptidase  27.27 
 
 
466 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.155221 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3998  peptidase M28  34.38 
 
 
440 aa  55.1  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.632162  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1155  peptidase M28  24.29 
 
 
462 aa  55.1  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.447711  normal  0.173867 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5481  putative aminopeptidase  27.27 
 
 
466 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4009  Glutamate carboxypeptidase II  25.29 
 
 
743 aa  54.7  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.677524  decreased coverage  0.0030346 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6549  peptidase M28  29.45 
 
 
551 aa  54.3  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.657933  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2846  peptidase M28  28 
 
 
623 aa  54.3  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0223512  normal  0.0909725 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5666  Endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 
580 aa  53.9  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.106128  normal  0.852479 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1997  peptidase M28  31.3 
 
 
537 aa  53.1  0.000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801062  hitchhiker  0.00000223343 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0518  Glutamate carboxypeptidase II  30.83 
 
 
734 aa  53.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.925044  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>