164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1190 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1190  peptidase M28  100 
 
 		 458 aa  946    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.786712 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12058  peptidase, M28D family protein  51.63 
 
 		 472 aa  448  1e-125  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6038  peptidase M28  51.58 
 
 		 454 aa  441  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0412  peptidase M28  48.81 
 
 		 460 aa  439  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0420601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3518  peptidase M28  47.94 
 
 		 463 aa  411  1e-113  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5666  Endoribonuclease L-PSP  43.44 
 
 		 580 aa  351  2e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.106128  normal  0.852479 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2654  peptidase M28  38.76 
 
 		 525 aa  294  2e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.423469 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3044  peptidase M28  37.67 
 
 		 468 aa  248  2e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000101958  normal  0.29803 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2728  peptidase M28  36.96 
 
 		 481 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349349  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2962  peptidase M28  37.47 
 
 		 468 aa  244  3e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00173052  normal  0.676879 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1362  peptidase M28  36.6 
 
 		 495 aa  243  5e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.162739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3142  peptidase M28  37.7 
 
 		 468 aa  242  1e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000890237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1094  peptidase M28  37.77 
 
 		 468 aa  241  1e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000099485  normal  0.0169877 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1054  peptidase M28  35.48 
 
 		 469 aa  239  5e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.580961  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2895  peptidase M28  35.36 
 
 		 481 aa  238  2e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0744794  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1189  peptidase M28  35.75 
 
 		 477 aa  236  4e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.157157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1049  peptidase M28  36.04 
 
 		 468 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000023249  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1116  peptidase M28  35.6 
 
 		 468 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000079399  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1150  peptidase M28  35.6 
 
 		 468 aa  233  5e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000117786  normal  0.22119 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1286  peptidase M28  35.22 
 
 		 466 aa  233  5e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000415736  normal  0.392366 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3539  M28D family peptidase  38.05 
 
 		 414 aa  231  2e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3240  peptidase M28  35.36 
 
 		 468 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0267852  normal  0.504623 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0919  peptidase M28  34.33 
 
 		 467 aa  223  6e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000320691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3182  peptidase M28  35.36 
 
 		 472 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.569108  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3197  peptidase M28  32.55 
 
 		 473 aa  199  7e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.815061  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2554  M28 family peptidase  31.79 
 
 		 469 aa  197  3e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3661  peptidase M28  31.63 
 
 		 468 aa  197  3e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.21215 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0237  peptidase M28  32.95 
 
 		 471 aa  196  7e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.706232 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02736  aminopeptidase  32.82 
 
 		 471 aa  186  5e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.465186  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1103  peptidase M28  30.79 
 
 		 471 aa  180  4e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.608477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2350  peptidase M28  30.34 
 
 		 457 aa  155  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4736  peptidase M28  31.77 
 
 		 497 aa  143  6e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.517188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4110  peptidase M28  29.22 
 
 		 487 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2940  peptidase M28  23.5 
 
 		 552 aa  114  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1208  peptidase M28  27.1 
 
 		 525 aa  114  4.0000000000000004e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382894  decreased coverage  0.00811068 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2848  peptidase M28  27.68 
 
 		 526 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.549527  normal  0.194902 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2040  peptidase M28  25.37 
 
 		 578 aa  107  5e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.194253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0844  peptidase M28  25.74 
 
 		 539 aa  90.9  5e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3990  peptidase M28  27.44 
 
 		 447 aa  83.6  0.000000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.558433  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1360  peptidase M28  26.47 
 
 		 454 aa  72.4  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0906  peptidase M28  27.06 
 
 		 544 aa  70.9  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.53874  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0653  peptidase M28  26.75 
 
 		 438 aa  69.7  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.602384  normal  0.117412 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3241  peptidase M28  26.71 
 
 		 436 aa  68.6  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1093  peptidase M28  25.71 
 
 		 454 aa  68.2  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3414  aminopeptidase-like protein  34.26 
 
 		 677 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0421  aminopeptidase  25.11 
 
 		 501 aa  67  0.0000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.131984  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5481  putative aminopeptidase  24.93 
 
 		 466 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05516  aminopeptidase  25.85 
 
 		 504 aa  63.9  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3368  peptidase M28  24.32 
 
 		 459 aa  63.5  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5488  aminopeptidase, putative  24.11 
 
 		 466 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5040  aminopeptidase  23.97 
 
 		 466 aa  62.8  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5056  aminopeptidase  23.97 
 
 		 466 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.418047  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2954  peptidase M28  30.47 
 
 		 547 aa  62.8  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000316234  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5537  putative aminopeptidase  23.45 
 
 		 466 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5208  aminopeptidase  23.45 
 
 		 466 aa  61.6  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0274505  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5606  aminopeptidase  23.45 
 
 		 466 aa  61.6  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5450  putative aminopeptidase  23.45 
 
 		 466 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5470  putative aminopeptidase  24.38 
 
 		 466 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.155221 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2907  peptidase M28  25.57 
 
 		 463 aa  60.8  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5001  leucyl aminopeptidase  26.57 
 
 		 417 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.341623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3301  leucyl aminopeptidase  26.07 
 
 		 417 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177748  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5067  leucyl aminopeptidase  26.07 
 
 		 417 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0415  peptidase M28  26.35 
 
 		 440 aa  60.5  0.00000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4476  leucyl aminopeptidase  26.57 
 
 		 417 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0596  aminopeptidase Ap1  26.57 
 
 		 417 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.317864 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08445  aminopeptidase Y, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00650)  30.66 
 
 		 503 aa  59.7  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5156  peptidase M28  24.09 
 
 		 465 aa  59.7  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3463  peptidase M28  36.78 
 
 		 309 aa  59.7  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5218  leucyl aminopeptidase  25.59 
 
 		 417 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2466  glutamate carboxypeptidase II  28.97 
 
 		 725 aa  57.8  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0461903  normal  0.618125 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0749  Aminopeptidase Y  29.51 
 
 		 512 aa  57.8  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1817  peptidase M28  24.45 
 
 		 559 aa  57.8  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2092  Glutamate carboxypeptidase II  31.3 
 
 		 727 aa  57  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135334  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3147  Aminopeptidase Y  30.67 
 
 		 513 aa  56.2  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.248558  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3997  peptidase M28  25.42 
 
 		 456 aa  56.6  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.664765  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2403  aminopeptidase Y  28.46 
 
 		 512 aa  55.5  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.204184  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2819  glutamate carboxypeptidase II  36.89 
 
 		 757 aa  55.1  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.140178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2131  leucyl aminopeptidase  34.95 
 
 		 523 aa  55.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.227059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18700  predicted aminopeptidase  29.89 
 
 		 678 aa  55.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.561115 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04925  glutamate carboxypeptidase Tre2, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G10650)  38.55 
 
 		 884 aa  54.7  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0450501  normal  0.0918847 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0319  peptidase M28  31.65 
 
 		 416 aa  54.7  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0052  peptidase M28  35.71 
 
 		 308 aa  54.7  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000295021 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08756  aminopeptidase  32.35 
 
 		 334 aa  54.3  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1367  Glutamate carboxypeptidase II  33.08 
 
 		 751 aa  54.7  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0341097  normal  0.079347 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02856  peptidase  28.46 
 
 		 575 aa  54.3  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01630  aminopeptidase Y  27.8 
 
 		 509 aa  54.3  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.777606  normal  0.140751 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3397  peptidase M28  35.23 
 
 		 546 aa  53.9  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4009  Glutamate carboxypeptidase II  31.01 
 
 		 743 aa  53.5  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.677524  decreased coverage  0.0030346 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2124  aminopeptidase  25.49 
 
 		 408 aa  53.1  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0075  peptidase M28  31.3 
 
 		 947 aa  53.1  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11414  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0487  putative leucine aminopeptidase  25.49 
 
 		 408 aa  53.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0694  putative leucine aminopeptidase  25.49 
 
 		 384 aa  52.8  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.832714  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0990  putative leucine aminopeptidase  25.49 
 
 		 384 aa  52.8  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0845  peptidase family protein  25.49 
 
 		 384 aa  52.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.292004  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0757  peptidase family protein  25 
 
 		 408 aa  52.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31218  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1962  putative leucine aminopeptidase  25.49 
 
 		 384 aa  52.8  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02720  putative Glutamate carboxypeptidase II  29.22 
 
 		 555 aa  53.1  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0518  Glutamate carboxypeptidase II  30.48 
 
 		 734 aa  52  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.925044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3109  protease-associated PA domain protein  27.93 
 
 		 698 aa  50.8  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000536812  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4661  peptidase M28  31.9 
 
 		 341 aa  50.4  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>