101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2350 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2350  peptidase M28  100 
 
 		 457 aa  917    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0237  peptidase M28  54.29 
 
 		 471 aa  436  1e-121  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.706232 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1103  peptidase M28  48.2 
 
 		 471 aa  332  7.000000000000001e-90  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.608477  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2554  M28 family peptidase  41.89 
 
 		 469 aa  332  9e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0919  peptidase M28  43.94 
 
 		 467 aa  331  2e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000320691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1286  peptidase M28  42.01 
 
 		 466 aa  323  4e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000415736  normal  0.392366 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3197  peptidase M28  47.03 
 
 		 473 aa  323  4e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.815061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2895  peptidase M28  43.12 
 
 		 481 aa  317  3e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0744794  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3182  peptidase M28  41.69 
 
 		 472 aa  315  8e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.569108  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1189  peptidase M28  41.45 
 
 		 477 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.157157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02736  aminopeptidase  47 
 
 		 471 aa  313  2.9999999999999996e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.465186  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2728  peptidase M28  42.82 
 
 		 481 aa  311  2e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349349  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1150  peptidase M28  44.07 
 
 		 468 aa  310  5e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000117786  normal  0.22119 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1054  peptidase M28  42.68 
 
 		 469 aa  309  5.9999999999999995e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.580961  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1116  peptidase M28  43.83 
 
 		 468 aa  309  5.9999999999999995e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000079399  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1049  peptidase M28  43.58 
 
 		 468 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000023249  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3044  peptidase M28  42.06 
 
 		 468 aa  306  3e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000101958  normal  0.29803 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2962  peptidase M28  42.06 
 
 		 468 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00173052  normal  0.676879 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3142  peptidase M28  41.59 
 
 		 468 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000890237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3240  peptidase M28  42.86 
 
 		 468 aa  301  2e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0267852  normal  0.504623 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1094  peptidase M28  43.14 
 
 		 468 aa  298  1e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000099485  normal  0.0169877 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3661  peptidase M28  44.17 
 
 		 468 aa  293  6e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.21215 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3539  M28D family peptidase  42.08 
 
 		 414 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2654  peptidase M28  36.3 
 
 		 525 aa  231  2e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.423469 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1362  peptidase M28  35.06 
 
 		 495 aa  187  3e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.162739  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12058  peptidase, M28D family protein  28.92 
 
 		 472 aa  164  3e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1190  peptidase M28  30.34 
 
 		 458 aa  155  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.786712 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0412  peptidase M28  30.77 
 
 		 460 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0420601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3518  peptidase M28  26.81 
 
 		 463 aa  152  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6038  peptidase M28  29.36 
 
 		 454 aa  150  4e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5666  Endoribonuclease L-PSP  28.99 
 
 		 580 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.106128  normal  0.852479 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0844  peptidase M28  27.65 
 
 		 539 aa  102  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0906  peptidase M28  26.8 
 
 		 544 aa  94.4  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.53874  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2907  peptidase M28  28.46 
 
 		 463 aa  89  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2040  peptidase M28  25.73 
 
 		 578 aa  88.2  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.194253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1208  peptidase M28  24.73 
 
 		 525 aa  84  0.000000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382894  decreased coverage  0.00811068 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2848  peptidase M28  26.65 
 
 		 526 aa  83.6  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.549527  normal  0.194902 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4736  peptidase M28  28.94 
 
 		 497 aa  83.6  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.517188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2940  peptidase M28  39.64 
 
 		 552 aa  78.2  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4110  peptidase M28  25.41 
 
 		 487 aa  72  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3998  peptidase M28  25.23 
 
 		 440 aa  70.9  0.00000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.632162  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0319  peptidase M28  28.92 
 
 		 416 aa  70.5  0.00000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3241  peptidase M28  30.79 
 
 		 436 aa  65.9  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1360  peptidase M28  27.57 
 
 		 454 aa  64.7  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1093  peptidase M28  28.97 
 
 		 454 aa  62  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3936  peptidase M28  42.86 
 
 		 616 aa  60.8  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1664  peptidase M28  28.43 
 
 		 479 aa  60.8  0.00000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0075  peptidase M28  43.75 
 
 		 947 aa  57.8  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11414  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0653  peptidase M28  28.1 
 
 		 438 aa  57.8  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.602384  normal  0.117412 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0415  peptidase M28  25.63 
 
 		 440 aa  56.2  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3997  peptidase M28  24.5 
 
 		 456 aa  56.2  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.664765  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2427  peptidase family protein  23.15 
 
 		 447 aa  54.7  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2137  peptidase family protein  23.04 
 
 		 447 aa  54.3  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3109  protease-associated PA domain protein  22.9 
 
 		 698 aa  54.3  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000536812  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3368  peptidase M28  27.97 
 
 		 459 aa  54.3  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2986  peptidase M28  25.33 
 
 		 775 aa  51.6  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0792  Aminopeptidase S  36.56 
 
 		 502 aa  51.2  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1751  peptidase M28  28.79 
 
 		 514 aa  51.2  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.691853  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1459  peptidase M28  26.94 
 
 		 1103 aa  49.3  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246557  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0092  peptidase M28  25.34 
 
 		 319 aa  49.3  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0749  Aminopeptidase Y  30.6 
 
 		 512 aa  49.3  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3876  peptidase M28  22.97 
 
 		 466 aa  49.3  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18700  predicted aminopeptidase  34.21 
 
 		 678 aa  48.9  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.561115 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0927  Aminopeptidase Y  35.14 
 
 		 548 aa  48.5  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464767  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0141  peptidase M28  35.71 
 
 		 524 aa  49.3  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.481582 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4339  peptidase M28  28.21 
 
 		 815 aa  48.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3895  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  36.17 
 
 		 1077 aa  47.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2188  M23B family peptidase  26.32 
 
 		 490 aa  47.4  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.558201  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3010  allantoate amidohydrolase  41.38 
 
 		 429 aa  47.4  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.140541 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0686  peptidase M28  26.63 
 
 		 391 aa  47  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1824  peptidase M28  30.97 
 
 		 534 aa  47  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0754  Aminopeptidase S  28.26 
 
 		 512 aa  47  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4272  peptidase M28  32.65 
 
 		 552 aa  46.2  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1707  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  25.32 
 
 		 1147 aa  46.6  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.255269 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4953  Aminopeptidase Y  37.5 
 
 		 312 aa  45.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000539028  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4460  aminopeptidase  40.24 
 
 		 794 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0000347887  normal  0.0102107 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2403  aminopeptidase Y  28.47 
 
 		 512 aa  45.1  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.204184  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46351  predicted protein  31.25 
 
 		 937 aa  45.1  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0158707 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5001  leucyl aminopeptidase  36.19 
 
 		 417 aa  44.7  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.341623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3301  leucyl aminopeptidase  37.36 
 
 		 417 aa  44.7  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177748  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5067  leucyl aminopeptidase  37.36 
 
 		 417 aa  44.7  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1367  aminopeptidase Y  36.71 
 
 		 519 aa  44.7  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.227193  hitchhiker  0.000286251 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5156  peptidase M28  23.15 
 
 		 465 aa  44.3  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5218  leucyl aminopeptidase  37.36 
 
 		 417 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1031  peptidase M28  33.05 
 
 		 563 aa  44.3  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4476  leucyl aminopeptidase  39.13 
 
 		 417 aa  44.3  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1817  peptidase M28  34.31 
 
 		 559 aa  44.3  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3147  Aminopeptidase Y  31.11 
 
 		 513 aa  43.9  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.248558  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0596  aminopeptidase Ap1  37.36 
 
 		 417 aa  43.9  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0518  Glutamate carboxypeptidase II  28.91 
 
 		 734 aa  43.9  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.925044  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5488  aminopeptidase, putative  23.65 
 
 		 466 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1408  aminopeptidase Y  36.25 
 
 		 518 aa  43.5  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5208  aminopeptidase  23.65 
 
 		 466 aa  43.5  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0274505  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5606  aminopeptidase  23.65 
 
 		 466 aa  43.5  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00045  probable aminopeptidase  25 
 
 		 545 aa  43.5  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04018  glutamate carboxypeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03740)  36.78 
 
 		 772 aa  43.5  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.791672 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5040  aminopeptidase  23.63 
 
 		 466 aa  43.1  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5056  aminopeptidase  23.63 
 
 		 466 aa  43.1  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.418047  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5537  putative aminopeptidase  23.63 
 
 		 466 aa  43.1  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2092  Glutamate carboxypeptidase II  35.24 
 
 		 727 aa  43.1  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135334  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>